生化学Ⅲ 第3回 遺伝情報を担う分子-1
今回のSBOs
遺伝子発現に関するセントラルドグマに ついて概説できる
染色体の構造を説明できる
生化学ⅢSBO-4
遺伝子発現に関するセントラルドグマについて概説で きる
CentralDogma
SBO-4課題(予習&復習)-1
遺伝子とセントラルドグマに関連する基本的な用語の 意味について確認し、ノートにまとめること。
セントラルドグマ、複製、転写、翻訳、逆転写
SBO-4小テスト-1
セントラルドグマとは、遺伝情報がDNAからRNA、RNAか らタンパク質の順で受け渡されることにより、遺伝子 の機能が発揮される過程を説明する概念である。
Yes No
SBO-4小テスト-2
RNAの合成過程を示す用語はどれか。1つ選べ。
1.分裂 2.複製 3.翻訳 4.転写 5.交配
SBO-4小テスト-3
セントラルドグマに関する記述として正しいのはどれ か。1つ選べ。
1.原核生物に対しては、あてはまらない概念である。
2.細胞分裂時にのみ、あてはまる概念である。
3.DNAは、生体内の様々な反応を触媒する。
4.転写時にRNAに生じた変異は、次世代に遺伝しない。
5.アミノ酸の配列情報をもとにRNAを合成する過程が 知られている。
DNAと遺伝子の謎-1
DNAはどのような仕組みで子孫(娘細胞)に 伝わるのか?
DNAと遺伝子の謎-2
どのような仕組みでDNAの持つ情報が細胞
内の様々な分子の働きとして反映されるの
か?
DNAと遺伝子の謎-3
なぜ4種類のヌクレオチド(塩基)だけで多 種多様な遺伝情報を規定することができる のか?
復習・基礎生命科学p147-151
7-1DNAと遺伝子
2 ゲノムと遺伝子
DNA 原本
永久保存版 DNAの複製
DNA
原本
情報の流れ永久保存版
①DNAは永久保存
DNAはDNAを鋳型として合成される。
DNAとRNAの役割分担
細胞内の決まり
RNA
___
情報の流れ
②一方通行
DNAをもとにRNAがつくられる
DNA 原本
永久保存版
DNAとRNAの役割分担
細胞内の決まり
DNA 原本
RNA コピー
情報の流れ
永久保存版 使い捨て
③RNAは使い捨て
DNAをもとにRNAがつくられる
DNAとRNAの役割分担
細胞内の決まり
DNA 原本
RNA コピー
情報の流れ
永久保存版 使い捨て
例外はレトロウイルスなど
RNAをもとにDNAがつくられる 逆転写
DNAとRNAの役割分担
RNAはDNAが持つ遺伝情報を細胞内の機能に置き 換える媒体としての役割を持つ。
細胞内の決まり
DNA 原本
RNA コピー
情報の流れ
永久保存版 使い捨て
例外はレトロウイルスなど
RNAの役割とタンパク質合成 タンパク質は、リボソームとtRNAの働きによっ てmRNAの配列情報をもとに合成される。
細胞内の決まり
RNA コピー
Protein
情報の流れ
使い捨て 使い捨て
セントラルドグマ
DNA
↓複製 DNA
↓転写 RNA
↓翻訳 タンパク質
Centraldogmaofmolecularbiology
分子生物学の中心原理 (中心教義)。1958年、
F・クリックが提唱した。
*現在ではRNAからDNA への逆転写が確認され ている。
自己複製
細胞増殖の基本は分裂である。
染色体
複製
細胞が分裂する前に、染色体(遺伝物質:DNA) が複製される。
どうすれば同じ情報(塩基配列)を持つDNAを合成(複製)できるか?
p400図34-4DNAの半保存的複製
二本鎖DNAが一本鎖に分かれてから、それ ぞれのDNA鎖を鋳型にして新しい相補的な DNA鎖が合成される。
DNAの複製に関する3つの仮説
複製前のDNA 複製後のDNA
半保存的複製
保存的複製
分散的複製
メセルソンとスタールの実験
15Nのみを含む培地 で培養した大腸菌
14Nのみを含む培地 で培養した大腸菌
DNAを抽出する
メセルソンとスタールの実験
遠心器
メセルソンとスタールの実験
15Nのみを含むDNA
14Nのみを含むDNA
重い 軽い
メセルソンとスタールの実験
15Nのみを含む培地 で培養した大腸菌
14Nのみを含む培地
?
メセルソンとスタールの実験
第一世代 第二世代
14Nを含む条件で培養
14N
15N
メセルソンとスタールの実験
メセルソンとスタールは、DNAが半保存的に複製される ことを証明した。
DNAの複製
C G A T
A T
C G
G T
T T G T A
DNA合成酵素は、鋳型DNAをもとにアデニンとチ ミン、シトシンとグアニンが必ず対になるよう 新しいDNA鎖を合成する。
3' 5'
A C A
DNA合成酵素
伸長方向
5' 3'
DNAの情報をRNAに置き換える仕組み せつなんだいがくやくがくぶ
セツナンダイガクヤクガクブ
RNAポリメラーゼは分子コピー機 RNAポリメラーゼは、DNAをもとにRNAを合成する 分子装置である。
RNAの合成(転写)
C G A T
A T
C G
G U
T T G U A
RNA合成酵素は、鋳型DNAをもとに相補的なRNA鎖 を合成する。RNAではチミン(T)の代わりにウラ シル(U)が使われる。
3' 5'
A C A
RNA合成酵素
伸長方向
5' 3'
DNAとRNAの役割分担
ACGTGGTCAGAT...
DNAのTはRNAのUに相当する。
ACGTGGTCAGAT...
TGCACCAGTCTA...
例えばDNA(原本)の文字列が
なら
ACGUGGUCAGAU...
RNA(コピー)の文字列は
となる
核酸とタンパク質
DNA
(塩基配列)
mRNA
(塩基配列) タンパク質
(アミノ酸配列)
A遺伝子
Aタンパク質 AmRNA
B
B
B C
C
C DNAにコードされた遺伝情報は、mRNAに転写され、
mRNAにコードされた遺伝情報は、タンパク質の アミノ酸配列に翻訳される。
核酸とタンパク質
核酸 タンパク質
DNA 4種類の塩基(ACGT) 20種類のアミノ酸 Ala,Arg,Asp,Asn,Cys, Gln,Glu,Gly,His,Ile, Leu,Lys,Met,Phe,Pro, Ser,Thr,Trp,Tyr,Val RNA 4種類の塩基(ACGU)
核酸とタンパク質
4種類の塩基しかない核酸で、20種類のアミノ酸 から構成されるタンパク質を合成するために、
どのような秘密が隠されているか?
A T G C C T T A C DNAとRNA:それぞれ4種類の塩基
?
Met Pro Tyr タンパク質:20種類のアミノ酸
核酸とタンパク質
1つのアミノ酸を規定する塩基の数 組み合わせの数
1塩基 4x1=4種類
2塩基 4x4=16種類
3塩基 4x4x4=64種類
A T G C C T T A C
3塩基で1組ならば、64種類の「文字」を表す ことができる。トリプレット説
タンパク質に含まれるアミノ酸は20種類あるが、
DNAの塩基は4種類しかない。F.クリックは、ア ミノ酸を4種類の塩基で指定するためには3個 の塩基の組み合わせ(トリプレット)が必要であ ると考えた。
この説を裏付ける実験が必要だ
ニーレンバーグ-マティの実験
大腸菌
細胞破壊 無細胞
タンパク質合成系 合成RNA
①
②
③
ニーレンバーグ-マティの実験
ポリウラシル UUUUUUUUUUUUUUUU
ポリフェニルアラニン Phe-Phe-Phe-Phe
大腸菌の タンパク質合成装置
ニーレンバーグ-マティの実験
ウラシル-アデニン UAUAUAUAUAUAUAUA
チロシン-イソロイシン Tyr-Ile-Tyr-Ile
大腸菌の タンパク質合成装置
遺伝暗号の解読
ニーレンバーグとマティらの実験によって、遺 伝暗号(トリプレットコドン)が解読された。
コドン
DNAとRNAは3つの塩基で1つのアミノ酸残基を コードする。これをコドン(codon)と呼ぶ。
p457図37-1コドン表
アミノ酸の省略表記
G(Gly)Glycine A(Ala)Alanine V(Val)Valine L(Leu)Leucine I(Ile)Isoleucine S(Ser)Serine P(Pro)Proline T(Thr)Threonine D(Asp)Asparticacid N(Asn)Asparagine
E(Glu)Glutamicacid Q(Gln)Glutamine H(His)Histidine K(Lys)Lysine C(Cys)Cysteine R(Arg)Arginine M(Met)Methionine F(Phe)Phenylalanine Y(Tyr)Tyrosine W(Trp)Tryptophan
アミノ酸配列の一般的表記例
1102030 MKEKEFQSKPSLTKREREVFELLVQDKTTK
314050 EIASELFISEKTVRNHISNA
アミノ末端
(N末端:N-terminal)
カルボキシ末端͒
(C末端:C-terminal)
タンパク質のアミノ酸配列を一次配列と呼ぶ。左端をN 末端にして、アミノ酸残基を1文字あるいは3文字で 表記する。数字はアミノ酸残基の位置を示す。
遺伝暗号を解読してみよう
5'-CCUCGAGCCUGCACUAUAUGUGAA-3' p457のコドン表を参考に下記のRNA塩基配列をア ミノ酸配列に翻訳して下さい。
3文字表 記
1文字表 記
遺伝暗号の解答
5'-CCUCGAGCCUGCACUAUAUGUGAA-3'
3文字表 記
1文字表 記
ProArgAlaCysThrIleCysGlu
PRACTICE Practice!
フレーム(frame):コドンの読み枠 1つのコドンは3つの塩基で決まるため、同一DNA 鎖上でコドンの読み枠は3通り存在する。
例:5'-CCUCGAGCCUGCACUAUA-3' Frame-1:CCUCGAGCCUGCACUAUA Frame-2:CUCGAGCCUGCACUAUA*
Frame-3:UCGAGCCUGCACUAUA**
通常、1つのタンパク質は1つのフレームにコードさ れる(途中でフレームがずれない)。
開始コドンと終止コドン
タンパク質の生合成は、翻訳開始コドン(AUG) から始まり、翻訳終止コドン(UAA,UAG,UGA)で 終結する。
AUG
リボソーム結合配列
リボソーム
UAA UAG UGA
Stop Start*AUGの他、UUG,GUGなどが翻訳開始コドンになることがある。
ORF
オープンリーディングフレーム ORFは翻訳開始コドン(AUG)から、終止コドン
(UAA,UAG,UGA)の1つ前のコドンまでの塩基 配列を示す言葉。
(openreadingframe)
略してORF
語句使用例
○このORFにコードされるタンパク質は、
○3つの連続したORFが、
DNAのセンス鎖とアンチセンス鎖 センス鎖:タンパク質をコードするDNA鎖 アンチセンス鎖:センス鎖の逆側DNA鎖
例
センス鎖 5'-CCTCGAGCCTGCACTATA-3' アンチセンス鎖 3'-GGAGCTCGGACGTGATAT-5' mRNA 5'-CCUCGAGCCUGCACUAUA-3'
mRNAはアンチセンス鎖を鋳型に合成されるので、UをT に置換すればセンス鎖と同じ配列になる。
遺伝子発現練習問題
DNA配列
5'-GCCTATATGGAATCTTCAGCAGGGGAGTAACAA-3' 3'-CGGATATACCTTAGAAGTCGTCCCCTCATTGTT-5'
mRNA
5'-̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲-3'
Aminoacid
N-̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲̲-C 下記のDNAからmRNAを転写し、ORFを探して1文 字表記のアミノ酸配列に翻訳して下さい。
DNAは上段がセンス鎖です。アミノ酸配列は1文字表記 法で示し、Stopコドンは「*」で示して下さい。
遺伝子発現練習問題解答
DNA配列
5'-GCCTATATGGAATCTTCAGCAGGGGAGTAACAA-3' 3'-CGGATATACCTTAGAAGTCGTCCCCTCATTGTT-5'
mRNA
5'-,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,-3'
Aminoacid
N-,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,-C
DNAは上段がセンス鎖です。アミノ酸配列は1文字表記 法で示し、Stopコドンは「*」で示して下さい。
GCCUAUAUGGAAUCUUCAGCAGGGGAGUAACAA
MESSAGE*
下記のDNAからmRNAを転写し、ORFを探して1文 字表記のアミノ酸配列に翻訳して下さい。
まとめ:生命の基本システム
DNA
↓ RNA
↓ タンパク質
↓
細胞の機能複製(replication)
↓↑
物質輸送
転写(transcription) 翻訳(translation) DNA→ 設計図の原本
設計図のコピー&部品 部品
代謝(metabolism)
核の働き
核は染色体DNAの存在部位であり、核内でDNAと RNAが合成される(DNAの複製とRNAの転写)。
Nucleus(yellow)andActin(red)
核の構造
核内には染色体と1~数個の核小体(仁)が存在す る。核膜は脂質二重膜の内外二重構造になって いる。
核小体の働き
核小体内ではリボソームRNA(rRNA)の合成とリボソーム (80Sリボソーム)の組み立てが行われる。
核膜孔
核膜には、イオン・タンパク質・RNAなどを透過させる ための核膜孔が存在する。
小胞体の構造と働き
小胞体は脂質二重膜で構成される網目状や扁平袋状の 細胞小器官で、タンパク質の合成や修飾に関与する。
小胞体膜とタンパク質合成
膜タンパク質や分泌タンパク質は、小胞体膜に 付着したリボソームで合成される(粗面小胞体)。
真核細胞の分泌タンパク質
小胞体で合成された前駆体タンパク質は、小胞体内と ゴルジ体内で切断や糖鎖付加などの修飾を受けて成熟 タンパク質となる。
核:mRNA合成 小胞体膜:分泌タンパク質合 成
小胞体内:タンパク質修飾 (切断&立体構造形成など)
ゴルジ体内:糖鎖修飾
分泌顆粒:細胞外へのタンパ ク質放出
生化学ⅢSBO-5 染色体の構造を説明できる
ChromosomeStructure
染色体とは?
染色体は遺伝子の集合体であり、遺伝情報を持 つDNA(核酸)と、DNAと結合するタンパク質から 構成される。
復習 遺伝物質(DNAまたはRNA)の種類
真核生物染色体DNA(核DNA)、ミトコンドリ アDNA、葉緑体DNA
原核生物染色体DNA、プラスミドDNA
ウイルスDNAまたはRNA
一般に真核細胞の染色体DNA(核DNA)や、原核細胞の染 色体DNAをゲノムDNAとよぶ。
ミトコンドリアゲノム、葉緑体ゲノム、ウイルスゲノムなどと 表現することがある
SBO-5課題(予習&復習)-1
染色体の構造に関連する基本的な用語の意味について 確認し、ノートにまとめること。
核、原核細胞、真核細胞、細胞周期、ヌクレオ ソーム、クロマチン、テロメア、セントロメア、
マイクロサテライト、DNA結合タンパク質、DNA の修飾
SBO-5小テスト-1
真核細胞の染色体は、DNAとタンパク質で構成されてい る。
Yes No
染色体
本来は真核生物の細胞周期の分裂期に見られる 凝縮した構造体を指すが、広義にはミトコンド リアなどの細胞小器官や原核生物のゲノム(全 DNA)も含まれる。
復習・基礎生命科学p147-148
7-1DNAと遺伝子
1 生物種とDNA量
原核細胞と真核細胞
核
DNA (染色体)
核膜
細胞膜
原核細胞 真核細胞
核様体
すべての細胞に染色体DNAと細胞膜が存在する。
原核細胞と真核細胞
核
DNA (染色体)
核膜
細胞膜
原核細胞 真核細胞
核様体
原核細胞と真核細胞の最も重要な形態の違いは、
染色体DNAを包む核膜の有無である。
細菌と真核細胞の染色体構造比較
核膜
形態
塩基対数
推定ORF数
細菌(大腸菌)
無
環状 2本鎖DNA
4.2x106
4.4x103
真核細胞(ヒト)
有
直鎖状 2本鎖DNA
3.3x109
4x104?
核の染色体
真核生物の核の染色体は直鎖状DNA
ミトコンドリアの染色体
真核生物のミトコンドリア染色体は環状DNA
ヒトの場合、mtDNAの割合は細胞DNAの総量の約1%程度
ウイルスの遺伝物質(染色体)
原核生物や真核生物だけでなく、ウイルスにも固有 の「染色体」があります。
原核生物に共通する特徴-追加
原核生物の染色体DNAは環状二本鎖DNAである。
細胞とDNAの長さ
大腸菌の細胞の長さは約2μmで、染色体DNAの 長さは約1.6mm、太さは約2nmである。
細胞とDNAの長さ
A.大腸菌を20cmの円柱に例えると、DNAの長さは 約1.6kmで太さは約0.2mmに相当する。
細胞とDNAの長さの不思議
A.小さな細胞の中でDNAが絡まないのは、DNAを 巻き取ってコンパクトにまとめる仕組みがあ るからです!
原核細胞のDNAとDNA結合タンパク質 原核細胞の染色体DNAは、DNA結合タンパク質と 複合体を形成する(細胞内のDNAは単独で存在し ない)。
リールのようにDNAをま とめるタンパク質があり ました!
原核細胞のDNAとDNA結合タンパク質 原核細胞の染色体DNAの構造は、DNA結合タンパ ク質によって制御される。
原核細胞の核様体
原核細胞において染色体DNAが存在する領域は核様体と 呼ばれ、特殊な顕微鏡を用いることで観察できる。
赤(FM4-64) 細胞膜 青(DAPI) DNA 緑(HBS-GFP) DNA結合タンパク質 枯草菌の蛍光顕微 鏡観察:染色体DNA は原核生物のヒス トン様タンパク質 HBSと結合している。
ミトコンドリアと葉緑体のDNA 核の染色体は直鎖状で、ミトコンドリアと葉緑体の染 色体DNAは環状である。
核 直鎖状DNA 葉緑体
環状DNA
ミトコンドリア 環状DNA
p417図35-8 ミトコンドリアDNA 核のDNAの他に、ミトコンドリアにも独自のDNA が存在する(mtDNA)。mtDNAは環状二本鎖DNAで ある。
p417表35-3 ミトコンドリアDNAの特徴
ウイルスの基本構造
コア(核酸) カプシド
(タンパク質)
ヌクレオカプシド (核酸+タンパク質)
ウイルスの遺伝物質
DNAウイルスのDNAは、直鎖状の一本鎖(singlestrand)または二本鎖 (doublestrand)の分子、あるいは環状二本鎖分子である。
直鎖状一本鎖 DNA (ssDNA)
直鎖状二本鎖 DNA (dsDNA)
環状二本鎖 DNA (dsDNA)
DNAウイルス
ウイルスの遺伝物質 DNAウイルス 直鎖状
一本鎖 DNA
パルボウイルス(パルボウイルス科・伝染性紅斑)
直鎖状 二本鎖 DNA
アデノウイルス(アデノウイルス科)
天然痘ウイルス(ポックスウイルス科)
単純ヘルペスウイルス(ヘルペスウイルス科)
環状 二本鎖 DNA
パピローマウイルス(パピローマウイルス科・子宮頸がん)
B型肝炎ウイルス(ヘパドナウイルス科)
ウイルスの遺伝物質
RNAウイルスのRNAは、直鎖状の一本鎖(singlestrand)または二本鎖 (doublestrand)の分子で、分節型と非分節型がある。
RNAウイルス
一本鎖(+)
RNA (ssRNA(+))
一本鎖(−)
RNA (ssRNA(-))
二本鎖 RNA (dsRNA) 一本鎖(−)
RNA (ssRNA(-))
非分節型 分節型
ウイルスの遺伝物質 RNAウイルスの分類
一本鎖
(+)
RNA
ポリオウイルス(ピコルナウイルス科)
A型肝炎ウイルス(ピコルナウイルス科)
ノロウイルス(カリシウイルス科) ヒト免疫不全ウイルス(レトロウイルス科)
一本鎖
(−)
RNA
A型インフルエンザウイルス(オルトミクソウイルス科)
狂犬病ウイルス(ラブドウイルス科)
エボラウイルス(フィロウイルス科)
二本鎖
RNA ロタウイルス(レオウイルス科)
p413図35-5 ヒトの12番染色体
テロメアの反復配列
哺乳類 TTAGGG
線虫 TTAGGC
カイコ TTAGG
シロイヌナズナ TTTAAGG
セントロメアとテロメア
真核生物のDNAにいおて、紡錘糸(微小管)が付着 する部分をセントロメアと呼ぶ。両末端にはテ ロメアが存在する。
5' 3'
3' 5'
テロメア セントロメア テロメア
(動原体)
相同染色体
二倍体の細胞では、両親から受け継いだ同じ種 類の染色体が2つずつ存在する。これを相同染 色体と呼ぶ。
1番 染 色体
1 番染 色体
2番 染色 体
2番 染色 体
3 番染 色 体
3 番染 色 体
二倍体の細胞(体細胞)
相同染色体
受精
精子由来 卵由来 精子と卵に由来する同じタイプの染色体
精子
卵
相同染色体
姉妹染色体
体細胞 複製
姉妹染色体
複製によって生じる染色体のペア
分裂
相同染色体
相同染色体と姉妹染色体
姉妹染色体
相同染色体 相同染色体 相同染色体
姉妹染色体
復習・基礎生命科学p151-152
7-2DNAの複製
1 DNAの存在様式
p410図35-3 染色体の構造
真核細胞のDNA
通常、真核細胞のDNAは凝集状態で存在する。
p409図35-2 DNAとヒストン ヌクレオソーム=コアヒストン+145bpDNA
DNAとヒストン
DNA (酸性)
ヒストン (塩基性)
ヒストンH1
ヒストン8量体 (H2A,H2B,H3,H4)
復習・基礎生命科学p174-176
7-5遺伝子発現
3 真核生物の転写制御
p409表35-1 ヒストン修飾の意義 ヒストンはDNAの複製・修復と、遺伝子の発現 制御に関与する
DNAとヒストン
DNA (酸性)
ヒストン (アセチル化)
どうして離れていくの?ヒストン さん
俺の塩基性アミノ酸残基が、アセチ ル化しちまったのさ。
ユークロマチン
ヒストンのアセチル化により転写が促進される
ヘテロクロマチン
ヒストンのメチル化により転写が抑制される
ヒストンのメチル化の他、DNAのシトシンのメチル化 も同様に染色体を凝集させる
クロマチンと遺伝子発現制御
染色体がほどけた部分(ループ)で遺伝子が活性化する
ヒストン修飾酵素 クロマチン再校正複合体 RNAポリメラーゼ
DNAのメチル化
シトシンがメチル化され、5-メチルシトシンになる 真核生物では特定の「CG」配列の「C」がメチル化される
DNAのメチル化
複製後もメチル化のパターンが維持される