日本医学図書館協会第 15 回医学図書館員基礎研修会 講義 5 情報検索 1 MeSH PubMed 阿部信一 東京慈恵会医科大学学術情報センター

講義５

情報検索1（MeSH・PubMed）

阿部信一

日本医学図書館協会 第15回医学図書館員基礎研修会

講義５

講義５ 情報検索１

情報検索１

講義５

講義５ 情報検索１

情報検索１

MeSH

MeSH・

・PubMed

PubMed

MeSH

MeSH PubMed

PubMed

阿部信一 阿部信一 東京慈恵会医科大学学術情報センター 東京慈恵会医科大学学術情報センター 東京慈恵会医科大学学術情報センタ 東京慈恵会医科大学学術情報センタ

講義のゴール 講義のゴール 文献データベース（特にＰｕｂＭｅｄ）の性格を 文献データベース（特にＰｕｂＭｅｄ）の性格を 文献デ タベ ス（特にＰｕｂＭｅｄ）の性格を 文献デ タベ ス（特にＰｕｂＭｅｄ）の性格を 理解し、基本的な検索方法を習得する。 理解し、基本的な検索方法を習得する。 講義の内容 講義の内容 講義の内容 講義の内容 ①情報検索概論(10分) ② ②ＰｕｂＭｅｄの使い方(40分) ③MeSHの活用法(40分) ③MeSHの活用法(40分) JMLA JMLA第第1515回医学図書館員基礎研修会回医学図書館員基礎研修会(08.08.7)(08.08.7)

医学の進歩と変化

医学の進歩と変化

医学生が学んだ知識の半分は，

医学生が学んだ知識の半分は，

１０年後には誤りとなる

１０年後には誤りとなる

１０年後には誤りとなる。

１０年後には誤りとなる。

Dr Sydney Burwell, Dr Sydney Burwell, Dean of Harvard Medical School, Dean of Harvard Medical School, Dean of Harvard Medical School, Dean of Harvard Medical School, BMJ 1956 BMJ 1956

過去

過去50

50年間の医学文献の増加

年間の医学文献の増加

過去

過去

年間

年間

医学文献

医学文献

増加

増加

（ （PubMedPubMed収録文献，収録文献，19561956--20062006年）年） 700000 800000 2006年 726,741件 500000 600000 数 400000 500000 出 版論文 数 200000 300000 出 1956年 105,216件 0 100000 6 8 0 2 4 6 8 0 2 4 6 8 0 2 4 6 8 0 2 4 6 8 0 2 4 6 JMLA JMLA第第1515回医学図書館員基礎研修会回医学図書館員基礎研修会(08.08.7)(08.08.7) 5 5 6 6 6 6 6 7 7 7 7 7 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 0 0 0 0

臨床医が情報検索にかける時間

臨床医が情報検索にかける時間

医師が臨床上の疑問の解決に１時間以上 医師が臨床上の疑問の解決に１時間以上 医師が臨床上の疑問の解決に１時間以上 医師が臨床上の疑問の解決に１時間以上 費やすことはない。 費やすことはない。

(Davidoff, Florance. Ann Intern Med 132(12), 2000) (Davidoff, Florance. Ann Intern Med 132(12), 2000)

臨床医が情報収集にかけられる時間は 臨床医が情報収集にかけられる時間は せいぜい１０分である。

せいぜい１０分である。

究活動 研究活動 学術情報の発生と流通 イ ン タ ｜ 仲間うちの 勉強会・会議 文献データベースで探す ｜ ネ ッ ト 学会・研究会 _{事前の抄録集 ／ 事後の会議録} （PubMed，医学中央雑誌） ト 学会 研究会 _{事前の抄録集 ／ 事後の会議録} 学術雑誌 原著論文 ／ 要約 ／ 総説・レビュー 新聞 単行書 専門書 ／ 大系書 ／ 教科書 ／ 辞書・事典 JMLA JMLA第第1515回医学図書館員基礎研修会回医学図書館員基礎研修会(08.08.7)(08.08.7) オンライン目録(OPAC)で探す

疑問の発生

疑問の発生

この症状から 考えられる 病気 年齢は？ １２歳

疑問の発生

疑問の発生

病気は？？ 診断上の疑問 性別は？ 男 診断上の疑問 症状は？ 発熱（39度） 頭痛 検索の方針 この症状に 頭痛 腹痛 病歴は？ 検索の方針 この症状に 効果のある 治療法は？？ 病歴は？ 小児喘息 アレルギー 治療上の疑問 ・・・ キーワード キーワード

情報検索のイメージ

情報検索のイメージ

情報検索のイメ ジ

情報検索のイメ ジ

疑問の文章化 キーワードの抽出 P bli hされた情報 Publishされた情報 PubMed 医中誌誌 etc 情報の評価 疑問の解決 データベースの選択 疑問の解決 デ タ スの選択 検索の実行

39

39度の発熱と悪寒のある 慈恵

度の発熱と悪寒のある 慈恵

郎

郎

39

39度の発熱と悪寒のある、慈恵一郎

度の発熱と悪寒のある、慈恵一郎

さんが、自宅にあったアスピリンをのん

さんが、自宅にあったアスピリンをのん

さ

、自宅 あ

ア

リンを

さ

、自宅 あ

ア

リンを

だところ、じんましんが出て、受診した。

だところ、じんましんが出て、受診した。

病因・リスク 診断 治療 アスピリンと じんましんの 因果関係 田中さんの 症状から考 えられる病気 発熱・悪寒や じんましんの 因果関係 は？ えられる病気 は？ じんましんの 治療法は？

文献検索

角度

文献検索

角度

文献検索の３つの角度

文献検索の３つの角度

主題 文献 患者 文献 種類 患者 属性 JMLA JMLA第第1515回医学図書館員基礎研修会回医学図書館員基礎研修会(08.08.7)(08.08.7)

１８歳、男性が、昨朝からの腹痛で深夜に救急車で来院した。 痛みはヘソの周囲から始まり、胃腸炎と思い様子をみていたが、 徐々に増強し、右下腹部に移動してきたために受診した。診察では 徐々に増強し、右下腹部に移動してきたために受診した。診察では 腹壁硬直が認められた。 あなたは虫垂炎を疑い、雑誌文献を探すことにした。 検索方針 検索キーワード ①右下腹部痛 右下腹部痛がある 場合の虫垂炎の診断 ①右下腹部痛 ②虫垂炎 ③１８歳、男性 ③ 歳、男性

PubMed

PubMedのカバー範囲

のカバー範囲

PubMed

PubMedのカバー範囲

のカバー範囲

z z 19501950年以降、世界年以降、世界7070ヶ国、ヶ国、48004800誌以上の文献誌以上の文献 （約 （約1600約約1600万件）万件） z z 主要誌からは発行とほぼ同時期に収録主要誌からは発行とほぼ同時期に収録 z

z 構造化抄録構造化抄録(Structured Abstract)(Structured Abstract)が増えているが増えている

z

z 構造化抄録構造化抄録(Structured Abstract)(Structured Abstract)が増えているが増えている

z

z 電子ジャーナルへのリンク電子ジャーナルへのリンク z

z ACP Journal ClubACP Journal Club等のコメント等のコメント

z

z The Cochrane LibraryThe Cochrane Library (Cochrane Database of(Cochrane Database of

z

z The Cochrane Library The Cochrane Library (Cochrane Database of (Cochrane Database of Systematic Reviews)

Systematic Reviews)の収録の収録

JMLA

論理演算子 Ａ AND B 論理演算子 Ａ OR B Ａ OR B Ａ NOT B Ａ NOT B

文献検索の方針１

文献検索の方針１

文献検索の方針１

文献検索の方針１

結果の絞り込み 結果の絞り込み z z 結果の絞り込み結果の絞り込み １．キーワードの追加 １．キーワードの追加 ２．年齢・性別の指定 ２．年齢・性別の指定 ３ 検索年代の限定 ３ 検索年代の限定 ３．検索年代の限定 ３．検索年代の限定 ４．データの種類の限定 ４．データの種類の限定デ タデ タ 種類種類 限定限定 ５．使用言語の指定 ５．使用言語の指定 そ 他 そ 他 （（ ド 重み付け）ド 重み付け） ６．その他 ６．その他 （フィールド、重み付け）（フィールド、重み付け） JMLA JMLA第第1515回医学図書館員基礎研修会回医学図書館員基礎研修会(08.08.7)(08.08.7)

文献検索の方針２

文献検索の方針２

文献検索の方針２

文献検索の方針２

z z 検索範囲の拡大検索範囲の拡大 １ キーワードの変更 １ キーワードの変更 １．キーワードの変更 １．キーワードの変更 （組み合わせ方の変更） （組み合わせ方の変更） ２．検索年代の拡大 ２．検索年代の拡大 ３ デ タベ スの変更 ３ デ タベ スの変更 ３．データベースの変更 ３．データベースの変更 ４．その他（参考文献、関連文献） ４．その他（参考文献、関連文献）

MeSHとPubMedの関係 論 著者 論 著者 PubMedPubMedの索引者の索引者 MeSHとPubMedの関係 論文の著者 論文の著者 neoplasm neoplasm PubMed PubMedの索引者の索引者 neoplasms neoplasms p p neoplasms neoplasms cancer cancer cancer cancer MeSH 定義 「腫瘍に関する文献には 索引語としてneoplasms PubMed PubMedの検索者の検索者 p を付与する」 PubMed PubMedの検索者の検索者 neoplasms neoplasms JMLA JMLA第第1515回医学図書館員基礎研修会回医学図書館員基礎研修会(08.08.7)(08.08.7)

総標目数

総標目数

年

年

MeSH

MeSHの総標目数

の総標目数(1960

(1960～

～2005

2005年

年))

22,995 25,000 15 000 20,000 10,000 15,000 語 4,413 5,000 0 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005

M SH

M SHのカテゴリ

のカテゴリ

MeSH

MeSHのカテゴリー

のカテゴリー

A Anatomy（解剖） B Organisms（生物） C Diseases（疾患） D Ch i l & D （化学物質と薬物） D Chemicals & Drugs（化学物質と薬物）

E Analytical, Diagnostic & Therapeutic Techniques & Equipment（分析・診断・治療の技術・機器） F Psychiatry & Psychology（精神医学・心理学）

G Biological Sciences（生物科学） G Biological Sciences（生物科学） H Natural Sciences（自然科学）

I Anthropology, Education, Sociology & Social Phenomena（人類学・教育・社会学・社会現象） J Technology, Industry, Agriculture（工業技術・産業・農業）

K H iti （人文科学） K Humanities（人文科学） L Information Science（情報科学） M Persons（人間） N Health Care（保健医療）（保健医療） V Publication Characteristics（出版特性） Z Geographic Locations（地理） JMLA JMLA第第1515回医学図書館員基礎研修会回医学図書館員基礎研修会(08.08.7)(08.08.7)

M SH

M SHの階層構造

の階層構造(T

(T

St

St

t

t

)

)

MeSH

MeSHの階層構造

の階層構造(Tree Structure)

(Tree Structure)

Digestive System Diseases

Gastrointestinal Diseases より広いキーワード Gastrointestinal Diseases Stomach Diseases Duodenogastric Reflux より広いキーワード Duodenogastric Reflux Bile Reflux G i i より狭いキーワード Gastritis Gastritis, Atrophic Gastritis, Hypertrophic

サブヘディング

サブヘディング(Subheadings)

(Subheadings)

サブヘディング

サブヘディング(Subheadings)

(Subheadings)

MeSHでは各用語に共通性の高い80余語を 副標目（サブヘディング）として 主標目(Main 副標目（サブヘディング）として、主標目(Main Heading)と分けている。 サブヘディングはMeSH用語（主標目）をより 限定するための補助的キーワードとして組み 限定するための補助的キ ワ ドとして組み 合わせて用いられ、内容を限定するという意 味で「限定句（Qualifier）」と呼ぶこともある 味で「限定句（Qualifier）」と呼ぶこともある。 JMLA JMLA第第1515回医学図書館員基礎研修会回医学図書館員基礎研修会(08.08.7)(08.08.7)

MeSH

MeSH用語の選択 索引手順

用語の選択 索引手順

MeSH

MeSH用語の選択、索引手順

用語の選択、索引手順

①最も特定のMeSH用語を索引する ①最も特定のMeSH用語を索引する 例）「腎臓移植」には、KidneyとTransplantationではなく、 Kidney Transplantationを付与する ②特定の1語がなければ、適当な用語とサブヘディングを組 み合わせて索引する み合わせて索引する 例）「腎臓の病理」には、KidneyとPathologyではなく、 Kidney/pathologyを付与する ③サブヘディングとの組み合わせでは難しければ、複数の用 語を組み合わせて索引する 語を組み合わせて索引する 例）「MRSA」には、Methicillin Resistanceと Staphylococcus aureusを付与する

MeSH

MeSH用語の選択、索引手順（続き）

用語の選択、索引手順（続き）

MeSH

MeSH用語の選択、索引手順（続き）

用語の選択、索引手順（続き）

①最も特定のMeSH用語を索引する ②特定の1語がなければ、適当な用語とサブヘディ ② 定 語 、 語 ングを組み合わせて索引する ③サブヘディングとの組み合わせでは難しければ、 ③ 複数の用語を組み合わせて索引する →組織・部位の用語よりも疾患の用語を優先する 例）「Jejunitis（空腸炎）」はMeSH用語にないため、この主題を表す 「 空腸 も「 空腸 MeSH用語としては「Jejunum（空腸）」よりも「Jejunal Diseases（空腸 疾患）」を選択し、「Enteritis（小腸炎）」と組み合わせて索引する。 JMLA JMLA第第1515回医学図書館員基礎研修会回医学図書館員基礎研修会(08.08.7)(08.08.7)

サブヘディングの組み合わせ例

サブヘディングの組み合わせ例

サブヘディングの組み合わせ例

サブヘディングの組み合わせ例

疾患の薬物療法 ・疾患の薬物療法

［疾患］のdrug therapy × ［治療薬］のtherapeutic use 例）インタ フ ロンによるC型肝炎の薬物療法

例）インターフェロンによるC型肝炎の薬物療法 Hepatitis C / drug therapy [MH] AND

Interferons / therapeutic use [MH] Interferons / therapeutic use [MH] ・薬物の副作用によって起こった疾患薬物の副作用によって起こった疾患

［疾患］のchemically induced × ［薬物］のadverse effects 例）免疫グロブリンによって起こったC型肝炎

例）免疫グ ブリンによって起 った 型肝炎

Hepatitis C / chemically induced [MH] AND

腫瘍に関する論文の索引

腫瘍に関する論文の索引

腫瘍に関する論文の索引

腫瘍に関する論文の索引

腫瘍に関する論文の場合 腫瘍の組織タイプを表す S 用 ・腫瘍に関する論文の場合、腫瘍の組織タイプを表すMeSH用 語と腫瘍の部位を表すMeSH用語を組み合わせて索引されて いる。 いる。 例）眼球のメラノーマ

Eye Neoplasms[MH] AND Melanoma[MH]

部位 組織タイプ ・腫瘍の原発と転移の関係についてはサブヘディングsecondary ・腫瘍の原発と転移の関係についてはサブヘディングsecondary などを組み合わせて索引される。 ［原発の腫瘍］ × ［転移性の腫瘍］のsecondary ［原発 腫瘍］ ［転移性 腫瘍］ y 例）卵巣腫瘍が結腸に転移した症例

Ovarian Neoplasms[MH] AND Colonic Neoplasms/secondary[MH]

JMLA

薬物の作用に関する論文の索引

薬物の作用に関する論文の索引

薬物の作用に関する論文の索引

薬物の作用に関する論文の索引

薬物や化学物質の作用について論じられている論文には、薬物 を表すMeSH用語と薬効を表すMeSH用語を組み合わせて索引さ れている。 例）抗炎症剤としてのアスピリン 例）抗炎症剤としてのアスピリン

Aspirin [MH] AND Anti-Inflammatory Agents, Non-Steroidal [PA]

薬物 薬効

薬物 薬効

例）抗凝固剤としてのアスピリン 例）抗凝固剤としてのアスピリン

チェックタグ

チェックタグ(Check Tags)

(Check Tags)

チェックタグ

チェックタグ(Check Tags)

(Check Tags)

Ch k T M i H di Check Tag Main Heading Human (1966) Humans (2005)

Male Men

Female Women Pregnancy Pregnancy Animals (1974) Animals (2004) Infant, Newborn Infant, Newborn Infant Infant

Child, Preschool Child, Preschool Child Child

Adolescent Adolescent Adult Adult

Adult Adult

Middle Aged Middle Aged

Aged Aged

A d 80 d (1987) A d 80 d (1987)

JMLA

JMLA第第1515回医学図書館員基礎研修会回医学図書館員基礎研修会(08.08.7)(08.08.7)

最近

最近7

7年の

年のMeSH

MeSH変更の推移

変更の推移

最近

最近7

7年の

年のMeSH

MeSH変更の推移

変更の推移

1251 1251 1000 1200 848 666 933 800 666 487 494 ₄₅₆ 400 600 185 93 109 129 138 99 288 47 60 50 46 200 47 _{20 20} 60 50 ₂₂ 46 0 2002年 2003年 2004年 2005年 2006年 2007年 2008年 新語 変更語 削除語 新語 変更語 削除語

MeSH2008

MeSH2008年版で再構成された

年版で再構成された

冠疾患関係の用語

冠疾患関係の用語

Myocardial Ischemia

Acute Coronary Syndrome 急性冠状動脈症候群(2008)

Angina Pectoris Angina Pectoris Coronary Disease

Coronary Aneurysm C A t Di

Coronary Artery Disease

Coronary Occlusion 冠状動脈閉塞症(2008)

Coronary Stenosis Coronary Thrombosis Coronary Vasospasm Myocardial Infarctiony

Myocardial Reperfusion Injury Myocardial Stunning

JMLA

情報専門職としての自己研鑽

情報専門職としての自己研鑽

情報専門職としての自己研鑽

情報専門職としての自己研鑽

z z PubMedPubMedの変化を把握するの変化を把握する NLM

NLM--ANNOUNCESANNOUNCES https://list nih gov/cgihttps://list nih gov/cgi--bin/wa?SUBED1=nlmbin/wa?SUBED1=nlm--announces&A=1announces&A=1 NLM

NLM--ANNOUNCESANNOUNCES https://list.nih.gov/cgihttps://list.nih.gov/cgi--bin/wa?SUBED1=nlmbin/wa?SUBED1=nlm--announces&A=1announces&A=1

z z MeSHMeSHの変更点をチェックするの変更点をチェックする シソ ラス研究会 シソ ラス研究会 htt //hhtt //h 3 ift3 ift / i/ i kk /H/H 02 ht02 ht シソーラス研究会 シソーラス研究会 http://homepage3.nifty.com/sisoken/Home02.htmhttp://homepage3.nifty.com/sisoken/Home02.htm NLM Technical Bulletin

NLM Technical Bulletin http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/tb.htmlhttp://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/tb.html

z

z 主要誌をチェックする主要誌をチェックする z

z 主要誌をチェックする主要誌をチェックする

Journal of Medical Library Association Journal of Medical Library Association

http://www.mlanet.org/publications/jmla/index.html http://www.mlanet.org/publications/jmla/index.html （全文）（全文） 『 『 学学 書書 学 書 協学 書 協 『 『医学図書館医学図書館』』（日本医学図書館協会）（日本医学図書館協会） http://wwwsoc.nii.ac.jp/jmla/kikanshi/index.html http://wwwsoc.nii.ac.jp/jmla/kikanshi/index.html （目次のみ）（目次のみ）

医学図書館員は、もっと医学知識の内容に 医学図書館員は、もっと医学知識の内容に 立ち入れる能力を養うべきでしょう。 立ち入れる能力を養うべきでしょう。 （中略） （中略） 文献を読んだり専門家から教えてもらった 文献を読んだり専門家から教えてもらった 文献を読んだり専門家から教えてもらった 文献を読んだり専門家から教えてもらった りして、ある程度の医学の知識を持たなけ りして、ある程度の医学の知識を持たなけ ればならないということです。 ればならないということです。な なな な うう す。す。 さもないと、本当の意味での医学情報とい さもないと、本当の意味での医学情報とい うものを扱えません。 うものを扱えません。 うものを扱えません。 うものを扱えません。 津田良成（名誉顧問）． 津田良成（名誉顧問）． 医学情報を担当する今の図書館員諸君 医学情報を担当する今の図書館員諸君 医学情報を担当する今の図書館員諸君へ． 医学情報を担当する今の図書館員諸君へ． 日本医学図書館協会， 日本医学図書館協会，20002000．． JMLA JMLA第第1515回医学図書館員基礎研修会回医学図書館員基礎研修会(08.08.7)(08.08.7)