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電気泳動による光合成関連タンパク質の分離 基礎生命科学実験・生命科学実験(東京大学 教養学部)実験概要

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Academic year: 2018

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(1)

実験2

電気泳動

光合成関連 ン

質 分離

目的:

ン 質を分子量 違い 分離 手法

あ SDS 電気泳動法

原理を理解 そ 手法を習得

材料:

ノ テ Synechocystis sp. PCC 6803

野生株 びcpcA遺伝子欠損変異株

実験:

班単位 う

A:野生株 びcpcA遺伝子欠損変異株 細胞を破砕後

ン 質を電気泳動 分離 ニン

ン を同定 そ 分子量を推定

B:分光光度計を用い 細胞 吸収 を測定

ニン 光合成 利用 光 波長を推定

(2)

実験

A

電気泳動

手順

1 泳動サン

調製

1人2本:野生株 変異株を一本

培養懸濁液を 混合

野生株 変異株を 1 mLい 蓋を

遠心 15,000 rpm, 1分

沈澱 ッ

さごご µL 細胞破砕緩衝液を

加え ッテ ン

再懸濁

そ 全量を移

ュー

細胞破砕 4,000 rpm , 40秒

蓋付 ュー 蓋

蓋をあ 自動 ッ

細胞を吸わ い う注意

上澄 液を 除

沈澱 細胞 上澄 液

ー をい

入 注意

蓋を 破砕機 ッ

2×サン ッ ーさごごµLを加え 混合

出来上 !

遠心 15,000 rpm, 10秒

(3)

2

電気泳動

1. 泳動用緩衝液を泳動槽 線 い

2. 板 ー をゆ 垂直 抜 取

ーン 配列 乱 場合 教員 TA 申 出

3. 板を泳動槽 (教科書参照)

4. 上部槽 上端 2-3 mm 完全

浸 泳動用緩衝液を入

5. 自動 ッ 両端 ーン 分子量 ー ーを

10 µL そ 間 ーン 各自 サン さご µLを

ー を 吸わ い う 上 方 吸い

ゆ 流 込

全 ーンを埋 方 い 泳動

6. 電源部 泳動槽 取 付 を う(教科書参照)

7. ン ッ OFFを確認 AC ーを

ン ン 差 込 ン ッ をON

Tris-Gly PAGEL High ー 選択 い

を確認

8. RUN ンを押 泳動を開始

泳動 30分経 自動的 終了

泳動 30分 間 実験Bを う

(4)

3 ゲ

染色、脱染

手袋を 操作

1. 泳動終了後 泳動用緩衝液を流 捨 泳動槽

板を取 出 軽 板全体を水洗 後

テ を使 板を 裏表 分 う

右下を切

2. を 板 染色用 容器 入

50mL ュー 染色液全量 約30mL)を加え

を 後 電子 ン ッ 加熱処理

あ ー 約30〜40秒 目安 火傷 注意

容器を振 う機 置 約10分間振 う

染色液を を使 50 mL ュー 必 戻

3. 容器 水道水を50 mL程度加え 量 入 必要

い 2. 同様 電子 ン 加熱処理後 約10分間

ン 見え う 振 う

※脱染水 指定 容器 廃棄 絶対 流 捨 い

4. を写真 撮

撮影方法 い 教員 指示 従う

(5)

実験

B

吸収 ペクト

測定

1. 野生株(WT)又 変異株(MT) 培養懸濁液 1 mLを

測定用 入 測定を う 班 1本

あ 培養懸濁液を 混合 自動

ッ を用い 懸濁液を分取 ー ン

事前 教員 補正済 培養懸濁液 測定

を行う い

2. ノ廃液入 細胞を捨 後 を蒸留水 DW

5

タン ク質名称 け 分子 (kDa) 存在場所

ロッドリンカー 34 ロッド

ロッドリンカー 33 ロッド

ロッドコ リンカー 30 ロッド コ 間

フ コシ ニン 21 ロッド

ロフ コシ ニン 18.5 コ フ コシ ニン 17.5 ロッド

ロフ コシ ニン 17 コ

参考資料

表 教科書 p.30

生 株 ? 変

異 株 ? マ

ー カ ー

kDa

コ ロッド

フ コシ ニン

フ コシ ニン

ロフ コシ ニン

ロフ コシ ニン

ロッドリンカー

ロッドコ リンカー

図: 生株 フ コビリソーム 構造

図:電気泳動 け

(6)

後かたづけ

泳動漕

水 洗 あ 実験机上 逆 乾

染色用ガラ 容器

水洗後 各自 実験机 逆 乾

ビー 入った容器

各自 実験机 置

使用済ゲ 板

軽 い 所定 机 指定容器 捨

包装袋 ー 不燃

使用済 イク チュー

軽 水 洗浄後 指定容器 を開 捨

使用済 じ蓋付チュー

指定容器 を閉 捨

15mlチュー 野生株・変異株用

水洗→蒸留水 い 後 野生株・変異株を

分 所定 机 洗い桶 逆 乾 う

ラ チック 分光器

純水 後 逆 各自 実験机上

(7)

ート 内容

タイト 目的 材料と方法 生物名

結果

A)電気泳動

• 写真 余白を切 取 糊付

• 各 ーン 説明 分子量 ー ー サ 記載

• 実験A課題1〜3

– 課題1: ニンα ン 特定 そ 特定理由

– 課題2:変異株 ニンα以外 失わ ン

質 特定

– 課題3:変異株 ソー 構造 う

い 図 文章 説明

2) 細胞 吸収

• 野生株 変異株 余白を切 取 糊付

• 株 種類 読 取 吸収 ー 波長を記載

• 実験B課題1 問い 3 あ 注意

– ノ テ 光合成 利用 い 波長 推定

– 野生株 変異株 見 目 色 違い 生 原因を

吸収 違い 噛 砕い 説明

– ニン 吸収 光 波長

考察

書 しょう。

例1: フ コシ ニン 以外 も影響 出た理由 ?

例2: 変異株 増えた ンド い ? ?

7

遺伝子 欠損 あ ニンα あ 注意

参照

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