PubMedの使い方
応用編
本日の内容
• PubMedをカスタマイズする（My NCBI） • MeSHの活用 • 忙しい臨床医のための検索 Clinical Queries • エビデンスレベルの高い文献検索（網羅的な 検索） • タグを使った検索 • その他便利な機能についてPubMedをカスタマイズする
My NCBI
My NCBIの主な機能 • 検索式の保存 • 保存した検索式を自動的に実行し、定期的に メール配信（アラート機能） • 検索結果の保存 • 表示形式のカスタマイズ利用するには登録が
必要（無料）
My NCBI登録
• 登録画面 ここを クリック Usernameは3文字 以上で、数字または アンダーバーを含む。 Passwordは6文字以 上で、大文字小文字 は区別される。 ここで設定したメールアドレスは、検 索結果画面のSend toでE‐mailを指 定した時に自動的に表示されます。 ＜ログイン後＞My NCBI（検索式保存）
• 検索式を長期間保存し、繰り返し利用する ① 検索実行後、「Save Search」をクリック。 ② 検索式に名前をつけて「Save」ボタンをクリック。 ③ 詳細を設定（アラート機能※の 設定など） 検索式に名 前を付ける ① ② ③ アラート機 能、頻度 の設定 送付レコード 内容の設定 ※ 保存した検索式を自動実行させ、結果を メール転送させる機能。 送付件数 の指定My NCBI（検索結果保存）
• 検索結果の保存 ① 結果一覧表示画面で保存するレコードを選択。（チェック を付ける。）チェックを付けない場合は全件。（5000件まで） ② Send toでCollectionsを選択して、Add to Collectionsをク リック。 ① ② ③ 新しいCollectionを 作成するか、既存 のCollectionに追 加するか選択する。 保存したデータは、My NCBIから確認できる。My NCBI（検索結果フィルター表示）
• 検索結果を設定したフィルターにかける ① 結果表示画面の右上フィルター項目の「Manage Filters」を クリック（初期設定はReviewとFree Full Textに設定） ② 「Frequently Requested Filters」タブまたは「Browse Filter」 タブでフィルターを設定（５つまで）My NCBI
（検索キーワードのハイライト）
• 検索結果の表示画面で、検索したキーワード をハイライト表示させる ① My NCBIのPreferencesのページで設定する。 ② 好きな色を選択する。 ① ②MeSHの活用
• MeSH（Medical Subject Headings）とは 文献中の表現 MEDLINEのキーワード cancer,neoplasm, neoplasms（統制語） tumor MEDLINEの統制語辞書（シソーラス）がMeSH （さまざまな医学用語をできるだけ統一して使える ようにまとめられている。） ※ PubMedでは自動マッピング機能があり、思い 付いたキーワードで検索しても、自動的に適切 なMeSH用語も含めた検索をしてくれる。MeSHを使った検索のメリット
• MeSHに限定した検索 自動マッピング機能では、キーワード以外の 項目（抄録などすべての項目）も含めた検索 をするので、ごみの多い検索になる。 MeSHに限定した検索をすることで、精度の高 い検索ができる。 ※ さらにMajor Topic（中心テーマ）に限った 検索をするとより質の高い検索に。MeSHを使った検索のメリット
• Subheadings（副標目）を組み合わせた検索 Subheadings＝各分野に共通する大きな概念 （diagnosis, etiology, therapy, geneticsなど） MeSH用語に組み合わせることできめの細かい検索ができる。 各MeSH用語にどのようなSubheadingsが組み合わせ可能か は、MeSHデータベースで確認する。lung neoplasms AND drug therapy "Lung Neoplasms/drug therapy"[Mesh]
lung
neoplasms
drug therapy lung neoplasms drug therapy
MeSHを使った検索のデメリット
• 最新レコードを漏らす可能性がある PubMedには作業前・作業中のレコードも収録さ れているが、MeSH用語の付与がまだなので、 MeSHのみの検索では漏らす恐れがある。 → 別途、作業前・作業中のレコードのみフリー ワード（できるだけ同義語を含める）の検索が必 要 (lung caner OR lung neoplasm* OR lung tumor) AND (publisher [SB] OR in process [SB]) 作業前・作業 中のデータに 限定MeSHを使った検索のデメリット
• 新しい概念の検索には対応するMeSH用語が ない場合がある MeSHは毎年改訂され、新しい用語も追加さ れるが、すぐには対応していない場合もある。 → フリーワード（できるだけ同義語を含める） で検索忙しい臨床医のための検索
Clinical Queries
• エビデンスの高い文献を短時間で検索する ここを クリック 入力した キーワードに ついて、比較 的根拠の確 かな文献に 絞って検索 できる。（網 羅的な検索 ではない。）Clinical Queries
• ３つの検索フィルター 研究デザインに着目したキーワードのまとまりであるフィル ターが、自動的に付与されて検索される。 ① ② ③ 各Filterをクリックすると、 どのような検索が実行 されるか確認できる 検索するキーワードをここへ入力Clinical Queries
① Clinical Study Category 左図のように５種類の 研究カテゴリーと２種類 の Scopeを設定する。 ・ Category（臨床研究カテゴ リー） etiology（病因）、diagnosis（診 断）、therapy（治療）、 prognosis（予後）、 clinical prediction guides（臨床 予測指針） ・ Scope（検索の範囲） narrow（狭い）、broad（広い）Clinical Queries
② Find Systematic Reviews Systematic Reviewに関連ある論文を探す。 Publication TypeのMeta‐analysisを使った検索よりも 広く検索できる。 システマティック・レビューとは、 同一のテーマに関する複数のランダ ム化比較試験（RCT）などを統計的に 処理して総合評価した結果をまとめた 論文。 ※ コクラン共同体システマティックレ ビューについて、PubMedでは抄録ま で。全文はEBM Reviewsに収録。Clinical Queries
③ Medical Genetics Searches 遺伝子学関係文献のための 検索画面。キーワードを入力 し、Categoryにチェックを付け て検索すると、各カテゴリーに 最適な遺伝学関係のキー ワードが自動的に追加される。Clinical Queries 検索例
• 風邪の治療にビタミンCは有効かどうか（科学
的根拠の確かな文献をいくつか確認したい） キーワード common cold, vitamin c
診療ガイドライン作成などのために
エビデンスレベルの高い文献を検索
• エビデンスの高い文献を網羅的かつ効率的 に検索する。 ① MeSHを使う ② Subheadingsを使う ③ Publication Typesを使う ④ 特定のキーワードを使うエビデンスレベルの高い文献の
網羅検索
＜治療＞に関するキーワード（最も主だったキーワード） [MeSH]（統制されたキーワード） ・ double blind method ・ placebos [Publication Types]（文献の種類） ・ clinical trial ・ comparative study ・ controlled clinical trial ・ randomized controlled trial [Title/Abstract Words] ・ random* （*は前方一致検索） Yale大学ではこれらのキーワードをPubMed用に翻訳したものを以 下のURLで公開している。（コピー、ペーストでそのまま使える） http://info.med.yale.edu/library/reference/publications/pubmed/エビデンスレベルの高い文献の
網羅検索
• 乳癌の臨床的腫瘤径評価に超音波検査を行 うことは勧められるか？ キーワード breast cancer, ultrasonography, size, sensitivity ① MeSHの確認（breast cancer, ultrasonography）、同時にSubhedingsの確認 キーワードとして使えそうなMeSHを複数組 み合わせる。エビデンスレベルの高い文献の
網羅検索
② Publication Types（Limit機能）や特定のキー ワードを掛け合わせる。
エビデンスレベルの高い文献の
網羅検索
• 乳癌の臨床的腫瘤径評価に超音波検査を行 うことは勧められるか？
