2017.4 PubMed PubMed は、アメリカの国立医学図書館(NLM:National Library of Medicine)の、National Center for Biotechnology Information(NCBI)が、作成公開している世界最大級の医学文献データベースです。MEDLINE の文献情報の他、関連分野の文献情報も探せます。
I. PubMed とは
医学・看護学・歯学・獣医学・ヘルスケア分野の文献データベースです。1940 年代後半に出版された雑誌論 文の情報を探せます。
詳しくは、PubMed の“Fact Sheet” (http://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/pubmed.html)をご覧ください。 II. 検索する
画面上部の検索ボックスにキーワードを入れて検索します。
Library Pocket Guide
PubMed のシソーラス用語を 調べるには MeSH Database を使います。
PubMed で探せる雑誌は、 Journals in NCBI Databases で確認できます。 検索ボックス PubMed Tutorials には PubMed の使い方が掲載 されています。 Clinical Queries は次の 3 つについて手早く探す際に便利です。 疑問の種類（治療・診断 ・病因 ・予後）、システマティックレ ビュー、遺伝医学分野。
検索結果の件数が左上に表示されます。検索結果は出版年の新しい順に並びます。 結果を論文の種類 対象者年齢等 絞り込む場合 タイトル（青字のリンク）をクリック すると1 件ずつ詳細な画面に。 Summary→Abstract に変更すると、 抄録も一覧表示できます。 2 つ以上のキーワードを組み合わせて検索 する場合は Advanced へ もう少し下に、自分が入れたキーワー ドがどのように検索されたかを示す Search Details が表示されます。 この例では、influenza と検索しました。 それ以外の言葉にも変化させながら 検索している様子がわかります。 e-Journal、図書館に雑誌があるか、 の確認はこのアイコンをクリックします。 選択した論文をファイルに する、印刷する、文献検索 管理ソフトへ移動する場合 はSend to をクリック。
PubMed のキーワード集（MeSH）を使って検索する 1） MeSH について
検索結果を詳細画面にすると、abstract の下に、「Publication Types, MeSH Terms」と書かれていて、クリ ックすると下図のような言葉のリストが表示される場合があります。これは、PubMed で各論文に付与している キ ー ワ ー ド:MeSH(Medical Subject Headings)です。PubMed では、独自のキ ーワード集：MeSH データベースを作成し ていて、論文の内容にあったMeSH を選び、 各論文に付与します。 例えば、乳がんについて書いた論文①は 「breast cancer 」、論文②は「breast neoplasm」と書いていた場合、両方に 「breast neoplasms」という MeSH を付与 しています。これによって、言葉は異なる 2 つの論文を「breast neoplasms」という MeSH を使って検索することで探し当て ることができます。
2） MeSH を使って検索する
まずは自分が考えている概念に近いMeSH を、MeSH データベース（PubMed のシソーラス用語を探すデー タベース）で探します。検索ボックスの上に「PubMed」と書かれたプルダウンタブがありますので、ここで 「MeSH」を選択し、思いつく英単語を入れてから「Search」ボタンをクリックして、MeSH データベースを表 示させます。 この論文の内容を表すMeSH です。 論文で主に書かれている内容を示す MeSH には＊がついています。
MeSH の詳細画面が表示されます。
詳細表示したMeSH で PubMed を検索します。画面右の「Add to search builder」、「search Pubmed」の順に ボタンを押すと、PubMed の検索結果画面に切り替わります。 そのMeSH について、特定の角度から 見た論文を探すときは、 ここにチェックを入れます。 これらの言葉がPubMed で検索された とき、PubMed は自動的に相当する MeSH に置き換えて検索します。 （ここでの場合、Rhinitis, Allergic・・） MeSH は大きな概念から小さな概念へと木が枝分か れしていく構造になっています。ここでは複数の枝 にこのMeSH があることがわかります。
Restrict to MeSH major Topic を チェックすると、
このMeSH を主に扱った論文だけに 絞り込めます。
III. 2 つ以上の言葉を組み合わせて検索する 1） Advanced Search 画面
2 つ以上の言葉を組み合わせて検索するには、「Advanced Search」を使います。
2） 論理演算子で検索結果を組み合わせる
検索履歴に示された各検索の番号（#で始まる番号）を論理演算子（AND, OR, NOT）で組み合わせて検索をし ます。検索式は検索ボックスに直接入力するか、次の方法で論理演算子を選択しながら入力します。 （例1）#1 AND #2 （例 2）#1 OR #2 (例 3)#1 NOT #2 検索ボックス 著者名に○○、雑誌名が△△といっ た指定をした検索も可。 検索結果の履歴が ここに表示されます。 #1 の 検索結果 #2 の 検索結果 #1 の 検索結果 #2 の 検索結果 両方の検索結果を含む ものを探す 両方の検索結果を足す #1 の 検索結果 #2 の 検索結果 #1 であって#2 ではないもの 「Add to search builder 」、「Search
PubMed」の順でクリックすると、この MeSH で PubMed を検索します。 ここでは、subheadings の therapy にチェック を入れてから「Add to search builder」をクリ ックしたので、季節性鼻 アレルギーの治療の側 面からこのMeSH を検 索する式ができました。
各検索結果のAdd をクリックすると、上の検索ボックスに検索式が入力されていきます。AND はプルダウンす るとOR,NOT も選択できます。 IV. 検索結果を表示、印刷、エクスポートする 検索結果をファイルにまとめてダウンロード、メールで送る、あるいはRefWorks 等の文献管理ソフトに入れ るには、Send to からメニューを選択します。 V. My NCBI MyNCBI にアカウントを作ると、検索結果 や検索式を保存、表示項目のカスタマイズ、 保存した検索式の検索結果を定期的にメール で知らせる等、便利な機能が使えるようにな ります。アカウントの作成は画面右上の 「Sign in to MyNCBI」から行います。 「Add」をクリックしてか らBuilder で論理演算子を 選択します。 組み合わせる検索式は ここに入力されます。 RefWorks には一度に 200 件まで文 献を追加できます。 AND, OR,NOT を 選びます。 文献管理ソフトへ入れる場合 は、Citation manager を選択。
1） 新規アカウント作成、あるいは Google アカウントでログイン 新規にアカウントを作成する場合は、
「Sign in directory to NCBI」の 「Register for an NCBI account」 をクリックし、登録を行います。 「Sign in with Google」より、Google のアカウント ID とパスワードで MY NCBI を使用することもできま す。 ログイン後にPubMed 画面右上に表示される My NCBI をクリックすると、登録した検索式の編集、フィルター 設定、検索履歴の確認等ができる管理画面が表示されます。 2） 検索式の保存 検索式を保存するには、保存したい検索式を検索ボックスに表示させたまま、「Create alert」をクリックして画 面に従って操作します。
あるいは、Advanced Search の History から最終検索式（自分の見たい結果が出た式）の番号の上でマウスを左 クリックします。検索式を作る時と同じリスト（Options）が表示されます。一番したに「Save in My NCBI」 とあるので、ここをクリックします。保存する画面が表示されますので、名前を付けて「Save」します。 PubMed にアカウントを作成する場 合はこちらから。 Google アカウントで利用する場合は こちらから。
検索式を保存する際に、定期的に検索結果をメール受け取るかどうかの設定画面が開きますので必要に応じて設 定します。
3） フィルターの設定
検索結果の右側に表示されるフィルターの設定はMyNCBI にログインして行います。
Manage Filter をクリックすると My NCBI の管理画面が開き、ここで設定できます。
研究方法、言語、対象等、自分が使い易 い絞込項目を設定できます。
