事 業
97
事 業
事 業
98
１．遺伝資源の増殖・保存
(1) 植物遺伝資源
区分 保存区分 保存形態
総保存点数 アクティブ 種子 栄養体 培養系等
稲類 37,312 27,018 37,312 0 0
麦類 58,181 34,261 58,123 58 0
豆類 20,230 14,350 20,229 1 0
いも類 5,502 2,533 428 5,074 0
雑穀・特用作物 16,964 9,755 14,347 2,616 108
牧草・飼料作物 31,181 14,765 27,165 4,079 0
果樹類 8,443 3,629 144 8,322 161
野菜類 25,552 11,766 24,379 1,173 0
花き・緑化植物類 4,269 358 93 4,177 0
茶 6,632 1,291 148 6,484 0
桑 1,389 737 0 652 1,101
熱帯・亜熱帯作物 219 16 38 181 0
その他の植物 3,207 765 1,803 1,404 11
合計 219,081 121,244 184,209 34,221 1,381
【JP 番号による遺伝資源の保存状況】
注：
・集計期間： 平成 23 年 12 月 1 日～平成 24 年 11 月 30 日
・JP 番号：遺伝資源の各アクセッションに与えられた固有の ID 番号 ・保存番号：遺伝資源の保存を管理するために与えられた ID 番号
（ある１種類の栄養体遺伝資源が、２か所で重複保存されている場合、JP 番号は１個、保存番号は２個となる。）
・アクティブ：配布対象としている遺伝資源
【保存番号による保存場所別保存状況】
保存場所 総数 保存形態
種子 栄養体 培養系等
センターバンク 141,916 140,720 0 1,196
中央農研 159 159 0 0
作物研 4,677 3,075 1,602 0
生物研 23,451 22,161 1,098 192
畜草研 3,776 3,174 602 0
果樹研 8232 118 8,114 0
野茶研 16,959 11,279 5,680 0
花き研 2,214 1 2,213 0
北農研 8,676 5,232 3,444 0
東北農研 2,387 1,921 466 0
近中四農研 2,436 2,247 189 0
九州沖縄農研 17,379 10,854 6,525 0
JIRCAS 1,706 771 935 0
種苗管理センター 10,986 0 10,986 0
NLBC 420 0 420 0
その他 4,250 2,605 1,645 0
合計 249,624 204,317 43,919 1,388
事 業
99
(2) 微生物遺伝資源微生物種類
H23 実績 H24 計画株数 保存
株数 新規
保存 センター移管
保存 アクティブ率
アクティブ 非アクティブ 計
細菌 10,190 327 147 7,725 2,792 10,517 73.5%
放線菌 316 0 0 157 159 316 49.7%
動物マイコプラズマ 167 5 0 85 87 172 49.4%
ファイトプラズマ 19 0 0 0 19 19 0.0%
リケッチア 4 3 0 3 4 7 42.9%
酵母 615 6 1 216 405 621 34.8%
糸状菌 15,799 442 185 13,570 2,671 16,241 83.6%
昆虫・動物ウイルス 624 71 0 341 354 695 49.1%
植物ウイルス 265 42 0 268 39 307 87.3%
バクテリアファージ 98 5 0 103 0 103 100.0%
ウイロイド 15 0 0 15 0 15 100.0%
原虫 56 3 0 13 46 59 22.0%
線虫 150 12 0 162 0 162 100.0%
細胞融合微生物 10 0 0 5 5 10 50.0%
細胞性粘菌 5 0 0 5 0 5 100.0%
合計 28,333 916 333 22,668 6,581 29,249 77.5%
916 増
（対 H23 実績）
微生物種類
H24 実績株数 達成率
新規保存 センター移管 登録 抹消
保存 アク
ティブ率
センター 移管 保存 アク
ティブ 非アク ティブ 計
細菌 287 117 21 7,664 2,792 10,456 73.3% 79.6% 99.4%
放線菌 2 1 0 159 159 318 50.0% － 100.6%
動物マイコプラズマ 5 0 0 85 87 172 49.4% － 100.0%
ファイトプラズマ 0 0 0 0 19 19 0.0% － 100.0%
リケッチア 3 0 0 3 4 7 42.9% － 100.0%
酵母 5 3 0 215 405 620 34.7% 300.0% 99.8%
糸状菌 665 415 19 13,774 2,671 16,445 83.8% 224.3% 101.3%
昆虫・動物ウイルス 71 1 0 341 354 695 49.1% － 100.0%
植物ウイルス 43 0 1 268 39 307 87.3% － 100.0%
バクテリアファージ 5 0 0 103 0 103 100.0% － 100.0%
ウイロイド 0 0 0 15 0 15 100.0% － 100.0%
原虫 3 0 0 13 46 59 22.0% － 100.0%
線虫 12 0 12 150 0 150 100.0% － 92.6%
細胞融合微生物 0 0 0 5 5 10 50.0% － 100.0%
細胞性粘菌 0 0 0 5 0 5 100.0% － 100.0%
合計 1,101 537 53 22,800 6,581 29,381 77.6% 161.3% 100.5%
1,048 増 1,048 増
（新規保存－登録抹消） （対 H23 実績）
事 業
100
(3) 動物遺伝資源
動物種類／
実施機関
H23 H24 計画点数 保存実績 新規
保存
保存
アクティブ率 アクティブ 非アクティブ 計
ウシ 76 2 43 35 78 55.1%
スイギュウ 1 0 1 0 1 100.0%
ウマ 6 0 5 1 6 83.3%
ヒツジ 13 1 3 11 14 21.4%
ヤギ 20 0 20 0 20 100.0%
ブタ 39 0 21 18 39 53.8%
ウサギ 4 0 4 0 4 100.0%
家禽 94 0 56 38 94 59.6%
ミツバチ 2 0 0 2 2 0.0%
カイコ 721 4 603 122 725 83.2%
昆虫培養細胞 110 0 28 82 110 25.5%
天敵昆虫 4 0 2 2 4 50.0%
天敵餌用昆虫 2 0 0 2 2 0.0%
検定用昆虫 10 0 5 5 10 50.0%
合計 1,102 7 791 318 1,109 71.3%
動物種類／
実施機関
H24 実績点数
達成率保存 新規保存 登録
抹消
保存 アクティブ率
アクティブ 非アクティブ 計
ウシ 2 0 43 35 78 55.1% 100.0%
スイギュウ 0 0 1 0 1 100.0% 100.0%
ウマ 0 0 6 0 6 100.0% 100.0%
ヒツジ 1 0 13 1 14 92.9% 100.0%
ヤギ 0 0 20 0 20 100.0% 100.0%
ブタ 0 0 21 18 39 53.8% 100.0%
ウサギ 0 0 4 0 4 100.0% 100.0%
家禽 0 0 56 38 94 59.6% 100.0%
ミツバチ 0 0 0 2 2 0.0% 100.0%
カイコ 4 1 602 122 724 83.1% 99.9%
昆虫培養細胞 3 0 28 85 113 24.8% 102.7%
天敵昆虫 0 0 2 2 4 50.0% 100.0%
天敵餌用昆虫 0 0 0 2 2 0.0% 100.0%
検定用昆虫 0 0 5 5 10 50.0% 100.0%
合計 10 1 801 310 1,111 72.1% 100.2%
9 増
（対 H23 実績）
事 業
101
(4) DNA の受入・保存
区分アクティブレクション非アクティブコレクション配布用ＤＮＡ（プラスミド）
前年度 末現在
H24保存数の増減
前年度 末現在
H24保存数の増減
前年度 末現在
H24保存数の増減 収集受入移管廃棄H24末 現在受入廃棄H24末 現在増殖配布廃棄H24末 現在 cDNAクローン232,3130000232,3135,000005,00000000 RFLPマーカー1,71300001,713000000000 RFLPマーカーセット*1 100001000000000 YACクローン7,60600007,606000000000 YACフィルター*2 100001000000000 PAC&BACクローン1,17600001,1760170,0000170,0000101000 クローン数 計242,8080000242,8085,000170,0000175,0000101000 セット数 計200002000000000 *1 RFLPマーカーセット：192クローン／2プレート／セット *2 YACフィルター：12年度より7606クローン／1フィルター（11年度までは6952クローン／5フィルター／1セット）
【植物（イネ等）DNAの受入・保存】 【家畜（ブタおよびウシ）DNAの受入・保存】 区分
アクティブレクション非アクティブコレクション配布用ＤＮＡ（プラスミド）
前年度 末現在
H24保存数の増減
前年度 末現在
H24保存数の増減
前年度 末現在
H24保存数の増減 収集受入移管廃棄H24末 現在受入廃棄H24末 現在増殖配布廃棄H24末 現在 cDNAクローン10,147000010,14712,8640012,86400000 コスミドクローン0000001,800001,80000000 BACクローン*1 153,4880000153,488000000000 クローン数 計163,6350000163,63514,6640014,66400000 *1 BACクローンは96穴のプレートにそれぞれクローン毎に格納されており、1078枚のプレートから成っている。 全クローンを増殖し、適当数のクローン毎にDNAを混ぜ、スクリーニングし易い形で配布。
事 業
102
【昆虫（カイコ等）DNAの受入・保存】 区分
アクティブレクション非アクティブコレクション配布用ＤＮＡ（プラスミド）
前年度 末現在
H24保存数の増減
前年度 末現在
H24保存数の増減
前年度 末現在
H24保存数の増減 収集受入移管廃棄H24末 現在受入廃棄H24末 現在増殖配布廃棄H24末 現在 cDNAクローン21,979000021,979000000000 BACクローン*1 44,160000044,160000000000 クローン数 計66,139000066,139000000000 *1 BACクローンは96穴のプレートにそれぞれクローン毎に格納されており、1078枚のプレートから成っている。 全クローンを増殖し、適当数のクローン毎にDNAを混ぜ、スクリーニングし易い形で配布。
事 業
103
２．遺伝資源の配布実績(1) 植物遺伝資源
種類 国・独法機関 都道府県 大学 民間等 外国 合計
件数 点数 件数 点数 件数 点数 件数 点数 件数 点数 件数 点数 稲類 50 2,862 5 132 27 1,222 20 97 6 175 108 4,488
(10) (967) (1) (8) (4) (30) (3) (20) (2) (28) (20) (1053) *1 25 3,210 12 138 25 1,062 16 326 5 12 83 4,748
麦類 14 400 0 0 9 559 6 26 1 117 30 1,102
(3) (5) 0 0 (2) (15) 0 0 0 0 (5) (20) *1
15 739 0 0 6 11 4 14 3 12 28 776
豆類 22 729 0 0 21 1,467 9 26 5 312 57 2,534 (5) (8) 0 0 (2) (8) 0 0 (2) (183) (9) (199) *1
13 178 2 7 10 50 4 14 2 141 31 390
いも類 1 1 0 0 1 1 1 2 0 0 3 4
1 1 1 2 0 0 1 4 0 0 3 7
雑穀特用作物 8 148 2 22 3 54 4 7 2 125 19 356
8 251 0 0 1 4 4 6 2 9 15 270
牧草飼料作物 5 93 0 0 4 15 5 27 4 221 18 356
7 36 0 0 9 105 3 110 0 0 19 251
果樹類 3 43 4 16 0 0 12 22 2 9 21 90
0 0 4 8 3 25 7 12 0 0 14 45
野菜類 4 579 4 25 5 13 16 66 2 149 31 832
9 355 3 29 9 16 13 51 2 5 36 456
花き緑化植物 0 0 0 0 1 2 2 3 0 0 3 5
1 3 0 0 1 1 2 2 0 0 4 6
茶 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
桑 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 1 4 0 0 1 4
熱帯亜熱帯植物 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 1
合計 107 4,855 15 195 71 3,333 75 276 22 1,108 290 9,767
(18) (980) (1) (8) (8) (53) (3) (20) (4) (211) (34) (1272)
79 4,773 22 184 64 1,274 56 544 14 179 235 6,954
種類 国・独法機関 都道府県 大学 民間等 外国 合計
件数 セット数 件数 セット数 件数 セット数 件数 セット数 件数 セット数 件数 セット数
コレクションコア 15 19 2 2 28 40 1 1 1 1 47 63
7 9 2 2 11 16 2 3 0 22 30
*1 （）内の数字は少量配布（内数）
注：
・表中、各項目の下段は前年度実績を示す。
事 業
104
種類 国・独法機関 都道府県 大学 民間等 外国 合計
件数 点数 件数 点数 件数 点数 件数 点数 件数 点数 件数 点数
細菌 16 55 6 22 23 527 22 49 6 39 73 692
18 384 4 16 20 170 18 48 3 11 63 629 糸状菌 33 270 19 66 43 164 59 151 12 39 166 690 43 400 13 37 46 515 58 169 12 61 172 1,182
植物ウィルス 5 20 2 3 8 14 8 21 2 8 25 66
5 11 3 11 9 16 6 11 0 0 23 49
動物ウィルス 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
原線虫 2 3 0 0 3 5 4 12 0 0 9 20
0 0 0 0 5 5 6 16 0 0 11 21
放線菌 1 8 0 0 3 14 0 0 0 0 4 22
2 2 0 0 0 0 1 2 1 1 4 5
酵母 0 0 0 0 1 2 0 0 1 2 2 4
2 11 0 0 0 0 0 0 0 0 2 11
バクテリオファージ 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
ウイロイド 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1
ファイトプラズマ 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
合計 57 356 28 92 81 726 93 233 21 88 280 1,495
70 808 21 65 80 706 89 246 16 73 276 1,898
(2) 微生物遺伝資源
事 業
105
(3) 動物遺伝資源種類 国・独法機関 都道府県 大学 民間等 外国 合計
件数 点数 件数 点数 件数 点数 件数 点数 件数 点数 件数 点数
（凍結精液）牛 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 1
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
（血液）馬 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
（生体）馬 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 1
（凍結精液）馬 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
（凍結精液）ブタ 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
（毛根）ブタ 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
（生体）ブタ 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1
（凍結精液）ヤギ 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
（毛根）ヤギ 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
（血液）ウサギ 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
（生体）ウズラ 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
（種卵）ウズラ 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
ニワトリ( 血液） 1 9 0 0 0 0 0 0 0 0 1 9
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
ニワトリ( 種卵） 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
ニワトリ( 凍結精液） 1 4 0 0 0 0 0 0 0 0 1 4
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
天敵昆虫 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
検定用昆虫 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
昆虫培養細胞 0 0 0 0 1 5 0 0 0 0 1 5
0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1
蚕種 10 96 15 17 5 8 18 47 0 0 48 168
7 49 11 13 9 17 13 27 0 0 40 106
合計 14 111 15 17 6 13 19 48 0 0 54 189
7 49 11 13 11 19 14 28 0 0 43 109
事 業
106
種類 国・独法機関 都道府県 大学 民間等 外国 合計
件数 点数 件数 点数 件数 点数 件数 点数 件数 点数 件数 点数
【 イ ネ 】
PAC/BAC クローン
（チューブ） 1 1 0 0 2 5 0 0 7 10 10 16
2 3 0 0 1 1 0 0 4 4 7 8
cDNA クローン
（チューブ） 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1
RFLP マーカー
（チューブ） 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
RFLP マーカー
（プレート） 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
計 1 1 0 0 2 5 0 0 7 10 10 16
2 3 0 0 2 2 0 0 4 4 8 9
【 ブ タ 】
cDNA クローン
（チューブ） 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
完全長 cDNA
クローン
（チューブ）
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 2 2
BAC クローン
（チューブ） 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
BAC クローン
（スーパープール） 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
BAC クローン
（4D プール） 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
計 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 2 2
合計 1 1 0 0 2 5 0 0 7 10 10 16
2 3 0 0 2 2 1 1 5 5 10 11
(4) DNA 等
事 業
107
(5) 原蚕種並びに桑の接穂及び苗木配布実績区分 国・独法機関 都道府県 大学 民間等 計
件数 蛾 件数 蛾 件数 蛾 件数 蛾 件数 蛾
原蚕種 2 206 0 0 1 2 0 0 3 208
交雑原蚕種 2 76 0 0 0 0 1 1 3 77
交雑蚕品種 3 396 2 174 1 1 1 1 7 572
蚕 計 7 678 2 174 2 3 2 2 13 857
桑 件数 本 件数 本 件数 本 件数 本 件数 本
0 0 1 120 1 10 6 1,640 8 1,770 （注） 配布単位は蚕が蛾、桑は本
事 業
108
３．放射線育種場における依頼照射一覧
依頼者名 作 物 名 照射形状 照射方法 一般件数 協力件数
【独法試験研究機関】
（独）生物研 イネ 種子 急照射 104 0
（独）農研機構 作物研 イネ 種子 急照射 6 0
〃 サツマイモ 食用作物球根類 急照射 23 0
（独）農研機構 畜草研 ギニアグラス 鉢植え、種子 急照射 21 0
（独）農研機構 北農研 イネ 種子 急照射 3 0
〃 ソバ 種子 急照射 3 0
（独）農研機構 東北農研 ダイズ 種子 急照射 1 0
〃 コムギ 種子 急照射 6 0
（独）農研機構 近中四農研 イネ 種子 急照射 2 0
（独）農環研 イネ 種子 急照射 1 0
小 計 170 0
【公立試験研究機関】
（地独）青森県産業技術センター
野菜研究所 やまのいも 食用作物球根類 急照射 4 0
山梨県果樹試験場 スモモ 花粉 急照射 1 2
小 計 5 2
【大学法人等】
弘前大学農学生命科学部 リンゴ 花粉 急照射 8 0
信州大学農学研究科 アマランサス 種子 急照射 4 0
宇都宮大学農学部 セイヨウナタネ 種子 急照射 4 0
新潟大学農学部 シロイヌナズナ 種子 急照射 2 0
東京農業大学農学部 シュンギク 球状 急照射 1 0
小 計 19 0
【民間・個人】
個人 バショウ 種子 急照射 2 0
個人 イネ 種子 急照射 3 0
民間 キク 穗木 急照射 1 0
民間 ナガミノアマナズナ 種子 急照射 1 0
個人 キク 穗木 急照射 4 0
民間 エダマメ 種子 急照射 2 0
個人 ブドウ 穗木 急照射 2 0
民間 セダム 種子 急照射 1 2
小 計 16 2
合 計 210 4
事 業
109
４．オープンラボ利用実績(1) マイクロアレイ解析室
(2) 昆虫機能解析関連
利 用 者 件 数
生 物 研 内 15
研 究 所 外 28
小 計 43
依 頼 者 名 件 数
【遺伝子クローニング】
生 物 研 内 13
研 究 所 外 20
小 計 33
【マイクロアレイ】
生 物 研 内 6
研 究 所 外 2
小 計 8
【遺伝子組換えカイコの作成】
生 物 研 内 5
研 究 所 外 14
小 計 19
合 計 103
事 業
110
５．生物研が公開しているホームページと 主な知的基盤データベース一覧
データベース名 アクセス数 (H24 年 4 月～
H25 年 3 月 ) 担当ユニット等 データベース等の内容
農業生物資源研究所
ウェブサイト 3,831,387 広報室 農業生物資源研究所（生物研）の公式ホームページで す。内容は生物研の最新情報、研究分野ごとの研究概 要、プロジェクト研究概要、公開データベース情報、
知的所有権情報、公募・募集のお知らせ、プレスリリ ース、情報公開、生物研 Q&A、問い合わせ窓口一覧 等です。
【データベース等】
遺伝資源（マーカー情報、日本植物病名データベース、及び旧・蚕昆研のコンテンツのアクセス数は、農業生物資源 ジーンバンクウェブサイト のアクセス数の内数です。）
農業生物資源ジーン
（以下、3 件は内数）バンク
5,811,868 遺伝資源センター 農業生物資源ジーンバンクの概要紹介及び、保存して いる植物、微生物、動物遺伝資源を試験研究または教 育用に利用していただくため、遺伝資源の来歴や特性 を提供するサイトです。
- アズキ・ケツルアズキ
の SSR マーカー情報 6,924 遺伝資源センター アズキおよびケツルアズキの連鎖地図作成に用いた SSR マーカーのリストです。
- 日本植物病名
データベース 1,180,559 遺伝資源センター 日本植物病理学会編集の日本植物病名目録を出典とし たデータベースです。宿主名、病名、病原からの検索 を行うことができます。
- 蚕糸関係遺伝資源 データベース
（旧蚕昆研のコンテンツ）
247,385 遺伝資源センター 蚕糸関係遺伝資源データベースは、生物研が保存して いる蚕品種（在来種、突然変異種、および実用蚕品種）
情報及び、必要とする特性から蚕品種の検索を行なう 品種検索システムが利用可能です。また、保存してい る桑、昆虫培養細胞株のデータも含んでいます。
農林水産 DNA バンク 1,652,579 ゲノムリソース U 農林水産 DNA バンク（NIAS DNA Bank）は、農林水 産省のプロジェクト研究から得られたイネ、カイコ及 びブタゲノムの情報を公開しています。また、類似性 検索やキーワード検索システムも提供しています。
ゲノムリソースセンター
（RGRC） 144,304 ゲノムリソース U イネゲノムリソースセンターは、グリーンテクノプロ ジェクトで得られた多様かつ貴重なゲノム研究材料 を、国内外の多くの研究コミュニティーに提供してい るサイトです。
ゲノム情報統合データベース 農林水産生物ゲノム
情報統合データベース
（AgriTOGO）
150,752 ゲノムリソース U 農林水産省委託プロジェクトで作成されたイネ、家畜、
昆虫のゲノムデータベースを中心に一元管理していま す。個々のデータベースの情報が効率的に閲覧出来る ようにデータベース間の有機的な連携・統合を図り、
ユーザーの利便性の向上を図ったデータベースシステ ムです。
イネゲノム
イネアノテ - ション
データベース （RAP-DB） 7,101,524 ゲノムインフォ U 2004 年にイネの全ゲノム塩基配列が決定された後、
アノテーション会議を開催するなどして、専門家によ って精査された高精度の遺伝子アノテーション情報を 提供しています。NCBI、Gramene、アリゾナ大学な どの外部データベースや機関と連携を図り、NCBI ア ノテーションや OMAP の BAC 端配列のような外部デ ータも順次取り入れています。
事 業
111
データベース名 アクセス数 (H24 年 4 月～
H25 年 3 月 ) 担当ユニット等 データベース等の内容
イネ遺伝子発現 データベース
（RiceXPro）
2,344,200 ゲノムリソース U イネの生育過程を通して様々な器官・組織のサンプリ ングを実施し、マイクロアレイ解析によって遺伝子発 現情報を収集しました。RiceXPro はその遺伝子発現 情報を公開するために構築されたデータベースです。
2011 年 4 月現在、器官・組織網羅的遺伝子発現データ、
及び田植えから刈取りまでの期間における定期的な葉 の遺伝子発現データを閲覧することができます。この データベースは、簡単な解析ツールも実装しているた め、目的とする遺伝子の発現情報に容易にアクセスす ることができるようになっています。
イネ完全長 cDNA
データベース （KOME） 2,981,755 作物ゲノム U イネゲノムプロジェクトの一環として 2000 年 1 月 から、2003 年 9 月末までに遂行された「イネ完全長 cDNA プロジェクト」で収集、マッピング、意味づけ された約 28,000 の完全長 cDNA クローンの情報を公 開しています。
イネ遺伝子発現
データベース （RMOS） 250,756 作物ゲノム U 約 32,000 存在するイネ遺伝子の網羅的発現解析を 行うためにマイクロアレイ法という技術が 1999 年 来立ち上げられていますが、その技術紹介と 9,000、
22,000、44,000 の遺伝子を固定したマイクロアレイデ ータを紹介しています。
全塩基アノテ - ション ゲノムブラウザー
（WhoGA）
6,076,361 作物ゲノム U 日本型イネ「日本晴」全塩基配列解析の配列 Build04 と様々なイネデータを利用し、全染色体のマニュアル アノテーションを行いました。WhoGA ではこれらア ノテーション結果を染色体の位置毎に簡単に閲覧する ことができます。また確実な予測遺伝子以外にも、「full length cDNA は存在しているが遺伝子が組めない偽遺 伝子」、「既知遺伝子と有意な相同性を示しながらも遺 伝子が組めない領域」、「一つの予測プログラムでしか 支持されていない ORF」も同時に表示するため、遺伝 子単離を目指す研究者の利便性を考慮した予測遺伝子 表示を行っています。
ミュータントパネル
データベース （Tos17） 713,146 ゲノムリソース U 農業生物資源研究所で作出された遺伝子破壊系統（5 万系統）の表現型と破壊された遺伝子を整理したデー タベースです。RAP-DB でアノテートされたすべての イネの遺伝子情報も保持しており、それぞれの遺伝子 の破壊部位と対応する系統、及びその表現型情報が閲 覧できます。33,000 か所を上回る破壊部位情報が登録 されており、種子が必要な場合は、系統のリンクより ゲノムリソースセンターへ分譲依頼ができます。
シスエレメント モチーフ検索
データベース （PLACE）
126,104 ゲノムリソース U 高等植物遺伝子のプロモーター等の発現制御に関わる 領域（シスエレメント）の塩基配列モチーフ（特定の 塩基配列パターン）を論文から収集し、解説や文献な どの情報を付加したデータベースです。キーワード検 索機能、解析ツール SignalScan による検索機能など を有します。
イネゲノムアノテ - ション データベース
（RiceGAAS）
559,880 ゲノムリソース U、
ゲノムインフォ U このシステムは、イネゲノムの自動アノテーションシ ステムです。このシステムは、タンパク質をコードす る遺伝子構造の予測と解析を行う統合プログラムで す。
イネプロテオーム
データベース 759,567 （独）農研機構 作 物研（畑作物研究 領域）
イネの生育時期・器官特異的、および細胞内局在性を 示すタンパク質群に関するデータベースです。二次元 電気泳動上のタンパク質群の配列情報、分子量や等電 点情報のみならず、検索機能も有しています。
イネミトコンドリア ゲノム情報
（RMGinformation）
7,603 遺伝資源センター、
ゲノムリソース U イネミトコンドリアゲノムの情報を公開しているペー ジです。生物研と東京大学は 2002 年にイネのミトコ ンドリアゲノム全構造を決定し、その詳細と特徴につ いて解説しています。単子葉植物で初めて、農作物で 初めての例であり、イネの研究に加え、コムギ、トウ モロコシなどの研究にも役立っています。
