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以下の構造式は、SMILES表記から Open Babelによる自動変換で生成しました。
CH3 HO
図1 エタノール
O
HO
NH2 O H2N
図2 アスパラギン
このように、簡単な分子であれば自動でも比較的きれいに出力できます。
より複雑な分子や大きな分子でも可能かどうか試してみましょう。少々複雑になると、いったんInkscape で.svgまたは .pdfファイルを開いて手動で調節する必要がありそうです。
CH3 N O
H H
H
H OH
HO
図3 (−)-Morphine
1
H O
O
H
H OH
H OH H
OH
OH
H OH
H OH O
H OH
O H H
OH H
HO
H O H
OH HO
図4 d-Glucopyranosyl-(1→4)-d-glucopyranosyl-(1→4)-α-d-glucopyranose
2
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