化学構造式を TEX で描く:自動化による簡単生成法
Acetaminophen
2014 年 11 月 1 日
以下の構造式は、SMILES表記から Open Babelによる自動変換で生成しました。
CH
3HO
図1 エタノール
O
HO
NH
2O
H
2N
図2 アスパラギン
このように、簡単な分子であれば自動でも比較的きれいに出力できます。
より複雑な分子や大きな分子でも可能かどうか試してみましょう。少々複雑になると、いったんInkscape で.svgまたは .pdfファイルを開いて手動で調節する必要がありそうです。
1
CH
3N
O
H
H
H
H
OH
HO
図3 (−)-Morphine
H
O
O
H
H
OH
H
OH
H
OH
OH
H
OH
H OH
O
H
OH
O
H
H OH
H
HO
H O H
OH
HO
図4 d-Glucopyranosyl-(1→4)-d-glucopyranosyl-(1→4)-α-d-glucopyranose
2