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TNP(Type 1)

ドキュメント内 仏 遺 伝 子 改 変 シ ス テ ム の 構 築 (ページ 38-49)

O︻日hF回︑

muomhH

ωm‑AHh

ω‑hF回︑

A.TIR  ‑4.4 

1 10 

kb  ー+

No. of strains 

ー+

11.0  5.4 

‑11.0  ‑8.4  ‑2.8  +‑2.4 

kb  ↓↓ 

3.4

ー争

仏コ α 1  Fig 9. Variation bandipatternprobed with TIR (A) and TNP (B) in Japanese lowland strains.  Eleven strains in Type 1 was hybridized to TNP (B) and showed RFLPs among them. 

3 11 36 No. of strains 

C.TNP  B.TNP  A.TIR 

ω向凶hvH

ω角同hH

NωahH 

一 +‑

Type 1 kb  11.0 

5.4  ‑

Type2 

LM 

L 11.0 

5.4 

一 11.0

守一

7.4 ‑2.8 

kb 

b <D  2  Fig 10. Variation banding pattern probed with TIR (A) and TNP (B and C) in Japanese upland strains.  Twenty‑seven strains in Type 2 and twenty‑two strains in Type 

were hybridized to TNP 

(B) 

and  showed RFLPs among them. 

7 13 

o. of strains 12 15 

o. of strains  1 22 27 N o. of strains 

‑ 凶 口 明 記 ︼ 凶

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‑41

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Fig 13. Comparison of amino acids sequences of mudrA gene and 

rmuA gene. 

‑42

c  Ml  1  2  3  4  Ml  5  6 

7 8 

Ml  9  M2 

1.0kちゅ 0.6kb1.0kb 0.6幼ゅ0.6k~

lAωj 

口利

i Fig 14. RTPCRof rmuA gene transcript. A: 1.0kRTPCRfragments coespondto the transcripts spliced with the 1 st  and the 2nd introns. PCR productsoveredfrom the first ATG to the middle of the 3rd exson. 0.6bagmentlost the 2nd  exon with two intron. Lanes 1 and 3 were panicles at later stage. In contrast, lanes 2 and 4 were yougpanicles.  日:Lanes 5 to 7 were tissues from the plants grown under 250 C(day) and 150 C (night). Lane 8 were tissue  from the plant grown under 25

0 C (day) /20o C (night). C: RPCRproduct obtained from calli. 

A. 

2 5 / 1 8   IR36 

480p

B. 

C. 

ALTS 

A1  2 

. . . ‑

r1 

1 5 / 1 5   IR36 

3 7 / 3 7   2 5 / 1 2   ( 1  week) 

A1 

IR36 

A1 

IR36 

ALTS‑rl 

actin 

915. Activation of the rmuA gene. A: Cycling stress of lower temperature  giveηfor a week activated the transcriptio ofthe rmuA gee.RTPCFミwas done with ALTS and r1  primer shown in  panel C. B: Control for RTPCRreactio

by actin primers. 

‑44‑

A.  kb 

2.2… 

1.5 ‑

B.  kb 

M  1 

M  1 

2 3 4  

伺峰一 Normallyspliced  products 

4暗一 Altenativespliced  products 

2  3  4  5  6 

ヨ …

Genomic1 (1339) 

Genomic2(1203) 

...̲  cDNA(294) 

Fig 16. Alternative transcription amplified by RT‑PCR. 

Panel A: 623f and RSTOP primers were used for RT‑PCR. 

Normally spliced product including the exon 1 to 3 were  shown with an arrow. Alternative spliced product lost the  exo2.Lane 1, 3:NAsamples were extracted from mature  leaves from A 1 and IR36 grown in  green house. Lanes 2 and 4:  RNA samples from flag leaves grown in  green house. lane 5:  RNA sample from mature leaves grown with cycling stress  (250C for 12 hours and 120C for 12 hours). Panel B: primers 

designed to amplify a portion of31gene including introns. Lanes 1  to 5 were same as panel A.しane6: Genomic DNA of A1. Amplified  fragment from Pgi1 and Pgi2 were shown with arrows (genomic 1  and genomic 2). 

‑45‑

NTR 

R4Iu1‑A1 240 335  5' C一四7GAGGAGGGAGAAGCTGGGA‑GCGGCATCGGCAGAGGCGACACCAGCTGCCTCCACATCGGCTTCGTCTCCGGCGCCGGCCCCCGCCCCTGCCAC * * *本*事訓ド***場*本****市*****判事****本****本****本******事*本*******本******ホ*****司院本*刻ドヨド本車事*司何事*羽炉本事本*謝辞*本当事本本***本 目玉STC71789 5' CCCTCGAGGAGGGAGAAGCTGGGAAGCGCATCGGCAGAGCGACACCAGCTGCCTCCACATCGGCTTCGTCTCCGGCGCCGNCCCCCNCCCCTCCNAC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100  336 435  TCCCCCACCTCGTCCTCCCCCAGTCAGCGCCGCCGCCCCATCCCCTCCGCCACCGCCCCCATCCGCCGCCACCCCCACCCCTATCCGCCGCCCCCATC ***本*****本権準本*場事本**本******本**準**ホホ*刻ドホ*ホ***本*****事*****刻院本本**ホ本*本****本*******事本調院本当ド察本本判ド本事**本*担炉導***** TCCCCCACCTGTCCTCCCCCAGTNAGCGCCGCCGGCCCCATCCGCCTCCGGCACCGCCCCATCCGCCGCCACCCCCACCCCTATCCGCNGCCCCCATC 101 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200  436 514  CACCCTGCCCCTCGGTCAGCTCCTCCCGCCCTCCACTCCCTCCTCCCCTCCCTCAATGTGTGGTTAGGGTTTGGCTCC3'  ***本*事事**本***事事中*****************本*******場*事場権**本****本**地*本第********本*****判事本*** CACCGCTGCCCCTCGGTCAGCTCCTCCCGCCCTCCACTCCCTCCTCCCCTCCCTCAATGTGTGGTTAGGTTTGGCTCC3'  201 210 220 230 240 250 260 270 

1st  exon 

AFmi 

R4Iu1‑A1 515 551  5' ATGGATGACTCCACCTGGCTACAGATTGTTGGGAGG 3'  本当事場**本***ホ****本*ホ****本******本*****事* 自主STC71789 5' ATGGATGACTCCACCTGGCTACAGATTGTTGGGAGG 3'  280 290 300 310 

3  rd  exon 

1355 1453  R4Iu1‑A1 5'ACAAAGTTTACTAATCATCACACGTGTACATCTAGCGGTAGAAGGAAGACTACCACACCAACCA‑GCGCCTGGGTTGCTTCCAAGGCCACATATCC ホ*本*********事******************本調ド***ホ******本******本****ホ*本本**ホ*刻ド*本*****市場*本**事事事本**本調ドネ*司ド*司院本*本本*** EST C71789 5' TGACAAAGTTTACT~ATCATCAÇAÇGTGTACATÇIACGGTAGAAGGAAGACTACCACAACAACCAAGCGGCTGGNTTGCTTCCAAGGNCATCCATATCC 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410  1~4 140  TTGGGACA‑GATTCAGGTAGGGCCCTAAAGAACTGCAAAAAAGGTT3'  本****当事事******本*******場****ネ***本*******事事事**** TTGGGACAAGATTCAGGTATTGGGCCNTAAAGAACTTCAAAAAAGGTT 3'  420 430 440 450 460  Fig 17. Sequence comparison betweenMu‑A1and rice EST, C71789. Gap was indicated with dash.  Same nucleotides were shown with asterisks. Differences were markerd.  池山脳凶幽幽ム描鋪幽幽幽幽

ト的凶. m

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ト‑1

2

Fig 19̲ Genomic fragments carring eHon 2. 6enomic PCR 

asdone with F同2and r4 primers which can amplify a 

rtof codingequencesincluding eHon 2. 

‑48 

1

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制金

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