• 検索結果がありません。

ある塩基配列に対して BLAST を用いて相同性検索を行った結果、 Score=150, Expect=3e-20 という結果が得られた。この結果の解釈としてもっとも適切なもの を選択肢の中から一つ選べ。

1. 150 以上のスコアが偶然に出る確率は、およそ 3x10

-20

である。

2. 150 以下のスコアが偶然に出る確率は、およそ 3x10

-20

である。

3. 150 以上のスコアが偶然に出る確率は、およそ 1-3x10

-20

である。

4. 150 以下のスコアが偶然に出る確率は、およそ 1-3x10

-20

である。

1. 150

以上のスコアの偶然に生じるアライメントの本数の期待値は、およそ

3x10

-20である。

2. 150

以下のスコアの偶然に生じるアライメントの本数の期待値は、およそ

3x10

-20である。

3. 150

以上のスコアの偶然に生じるアライメントの本数の期待値は、およそ

1-3x10

-20である。

4. 150

以下のスコアの偶然に生じるアライメントの本数の期待値は、およそ

1-3x10

-20である。

平成19年度バイオインフォマティクス技術者認定試験

(日本バイオインフォマティクス学会主催)問題から引用

H19 問49

ある塩基配列に対して BLAST を用いて相同性検索を行った結果、 Score=150, Expect=3e-20 という結果が得られた。この結果の解釈としてもっとも適切なもの を選択肢の中から一つ選べ。

1. 150 以上のスコアが偶然に出る確率は、およそ 3x10

-20

である。

2. 150 以下のスコアが偶然に出る確率は、およそ 3x10

-20

である。

3. 150 以上のスコアが偶然に出る確率は、およそ 1-3x10

-20

である。

4. 150 以下のスコアが偶然に出る確率は、およそ 1-3x10

-20

である。

1. 150

以上のスコアの偶然に生じるアライメントの本数の期待値は、およそ

3x10

-20である。

2. 150

以下のスコアの偶然に生じるアライメントの本数の期待値は、およそ

3x10

-20である。

3. 150

以上のスコアの偶然に生じるアライメントの本数の期待値は、およそ

1-3x10

-20である。

4. 150

以下のスコアの偶然に生じるアライメントの本数の期待値は、およそ

1-3x10

-20である。

平成19年度バイオインフォマティクス技術者認定試験

(日本バイオインフォマティクス学会主催)問題から引用

タンパク質の相同性の判断基準

100

同一残基率 30% 以上

BLAST の E-value < 0.0001

PSI-BLAST の E-value < 0.0001

0 10

20 30

40 70

25 15 5

35

同一残基率 (Sequence Identity) (%)

立体構造比較が必要

配列解析

50

60 80

90

BLAST のプログラムの種類

クエリ配列 データベース 配列

比較回数 典型的な使用目 的

blastn 核酸 核酸 2回

相補鎖にしたDB配列と も比較

ゲノムDNAのアノテー ション、cDNAのゲノムへ のマッピング、非コーディ ング領域の比較

blastp アミノ酸 アミノ酸 1回

タンパク質配列からの比

較的遠縁のホモログの発

blastx 核酸

(を翻訳

したアミノ酸)

アミノ酸 6回

クエリから6通りのアミノ 酸配列を生成して比較

ゲノムDNAから遺伝子(タ ンパク質をコードしている 領域)を発見する

tblastn アミノ酸 核酸

(を翻訳

したアミノ酸)

関連したドキュメント