バイオサイエンス分 野 の検 索テクニック ＢＩＯＳＩＳ ファイル － 検 索 例 ２
バイオサイエンス分 野 の検 索テクニック ＢＩＯＳＩＳ ファイル － 検 索 例 ２
=> S L11 NOT L7 ← 基 本 索 引 の み で ヒ ッ ト し た 回 答 を 確 認 す る L12 86 L11 NOT L7
=> D 1-86 TI ← 全 件 の 標 題 を 表 示
L12 ANSWER 1 OF 86 BIOSIS COPYRIGHT (c) 2013 The Thomson Corporation on STN TI Oseltamivir for Control of Influenza at Mass Gatherings.
L12 ANSWER 2 OF 86 BIOSIS COPYRIGHT (c) 2013 The Thomson Corporation on STN TI Reduction in Sympathetic Nerve Activity as a Possible Mechanism for the Hypothermic Effect of Oseltamivir, an Anti-influenza Virus Drug, in Normal Mice.
：
L12 ANSWER 5 OF 86 BIOSIS COPYRIGHT (c) 2013 The Thomson Corporation on STN TI Oseltamivir inhibits both viral entry and release but enhances apoptosis of cells infected with influenza A H1N1.
：
=> D 5 ALL
L12 ANSWER 5 OF 86 BIOSIS COPYRIGHT (c) 2013 The Thomson Corporation on STN AN 2013:290585 BIOSIS Full-text
DN PREV201300290585
TI Oseltamivir inhibits both viral entry and release but enhances apoptosis of cells infected with influenza A H1N1.
AU Gao, Rongbao; Du, Ning; Liu, Dongshan; Li, Zi; Zhu, Yun; Shu, Yuelong [Reprint Author]
CS 155 Changbai Rd, Beijing 100226, Peoples R China [email protected]
SO Biochemical and Biophysical Research Communications, (FEB 22 2013) Vol.
431, No. 4, pp. 788-795. http://www.journals.elsevier.com/biochemical-and- biophysical-research-communications/#description.
CODEN: BBRCA9. ISSN: 0006-291X. E-ISSN: 1090-2104.
DT Article LA English
ED Entered STN: 10 Apr 2013
Last Updated on STN: 10 Apr 2013
AB Oseltamivir (Tamiflu) has been shown to be effective as a treatment and chemoprophylaxis for influenza virus infections. However, the safety consideration of oseltamivir should not be overlooked because adverse events associated with the drug have frequently been reported after the use of Tamiflu for the treatment of influenza patients. Here, we investigated oseltamivir's influence on viral load, apoptosis, and cytokine response of influenza A H1N1-infected A549 or THP-1 cells. In addition, we analyzed the effect of the drug on the function of
influenza-infected NK cells after oseltamivir treatment. The results of our study suggest that oseltamivir may inhibit both viral entry and release but may also enhance apoptosis of infected cells and interfere with NK cell function during influenza infection. (C) 2013 Elsevier Inc.
All rights reserved.
：
副 作 用 の キ ー ワ ー ド が抄 録 中 のみに存 在
47
バイオサイエンス分 野 の検 索テクニック ＢＩＯＳＩＳ ファイル － 生 物 からの検 索
■ 生 物 に関 する情 報 から検 索 する場 合 は，以 下 の索 引 項 目 を利 用 できる．
索 引 項 目 表 示 フィールド 検 索 方 法 収 録 期 間
生 物 系 統 分 類 コード ORGN : Classifier => S コードまたは分 類 名/ORGN
=> S コードまたは分 類 名/BC 1926- スーパータクサ ORGN : Super Taxa => S 索 引 語/ORGN 1926- 生 物 名 ORGN : Organism Name => S 索 引 語/ORGN 1926-1968
1993- タクサノート ORGN : Taxa Note => S 索 引 語/ORGN 1926- 生 物 部 位 ，
構 造 ，器 官 系
IT : Parts, Structures,
& Systems of Organisms => S 索 引 語(L)IT.PS/FA 1926-1968 1998- その他 の索 引 語 IT : Miscellaneous Discriptors => S 索 引 語(L)IT.MI/FA 1969-
■ 生 物 の検 索
・ ORGN フィールドには，文 献 中 の生 物 の情 報 が 4 種 類 の項 目 で索 引 されている．具 体 的 な
生 物 名 だけでなく，上 位 概 念 の生 物 分 類 名 なども索 引 されているため，霊 長 類 などの大 きな 生 物 グループを指 定 した検 索 もできる．
ORGN Classifier ← 生 物 系 統 分 類 コ ー ド Hominidae 86215
↑
ヒ ト 科
Super Taxa ← ス ー パ ー タ ク サ (生 物 系 統 分 類 階 級) Primates; Mammalia; Vertebrata; Chordata; Animalia ↑ ↑ ↑ ↑ ↑
霊 長 目 哺 乳 網 脊 椎 動 物 亜 門 脊 索 動 物 門 動 物 界
Organism Name ← 生 物 名 (文 献 中 の 名 称)
human (common): host, Black, male ← 生 物 名 : Modifier ↑ ↑ ↑ ↑
ヒ ト (一 般 名) 宿 主 ， 黒 人 ， 男 性
Taxa Notes ← タ ク サ ノ ー ト (ス ー パ ー タ ク サ に 対 す る 一 般 名 称) Animals, Chordates, Humans, Mammals, Primates, Vertebrates
↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ 動 物 脊 索 動 物 ヒ ト 哺 乳 類 霊 長 類 脊 椎 動 物
・ /ORGN フィールドは，上 記 の 4 種 すべての索 引 項 目 が検 索 対 象 となる．/BC フィールドを
用 いると，Classifier に限 定して検 索 できる．
=> S (コ ー ド ま た は 分 類 名)/BC
バイオサイエンス分 野 の検 索テクニック ＢＩＯＳＩＳ ファイル － 生 物 からの検 索
・ Organism Name 以 外 の項 目 はすべて統 制 語 で索 引 されている．
・ Organism Name には文 献 中 の生 物 名 が収 録 されている．非 統 制 語 が用 いられているため，
一 般 名 ，学 名 ，同 義 名 ，単 数 形 ，複 数 形 などを考 慮 して検 索 する．Organism Name に付 与 さ れる説 明 語 (Modifier) には，統 制 語 が使 用されている．
・ ORGN フィールドは生 物 ごとに作 成 されているため，1 レコード中 に複 数 の ORGN フィールド
が収 録されている場 合 もある．
- 同 一 生 物 中 に限 定 して検 索 する場 合 は (L) 演 算 子 でリンクさせる．
- Organism Name に付 与されている Modifier は，(S) 演 算 子 でリンクさせる．
ORGN Classifier
Hominidae 86215 Super Taxa
Primates; Mammalia; Vertebrata; Chordata; Animalia Organism Name
human (common): child, preadolescent child, adult, host, female, male Taxa Notes
Animals, Chordates, Humans, Mammals, Primates, Vertebrates ORGN Classifier
Orthomyxoviridae 03505 Super Taxa
Negative Sense ssRNA Viruses; Viruses; Microorganisms Organism Name
Influenza B virus (species): pathogen Taxa Notes
Microorganisms, Negative Sense Single-Stranded RNA Viruses, Viruses
・ Organism Name は収 録 期 間 が限 定 されているため，必 要 に応 じて他 の索 引 項 目 や基 本 索 引
による検 索 で補 完する．
■ 生 物 部 位 ，構 造 ，器 官 系
・ IT フィールドの Parts, Structures, & Systems of Organisms には，生 物 の臓 器 名 ，器 官 名 ， 組 織 名 ，細 胞 名 などが収 録されている．
IT Parts, Structures, & Systems of Organisms
NK cell: immune system, blood and lymphatics, natural killer cell;
peripheral blood: immune system, blood and lymphatics; cord blood:
immune system, blood and lymphatics
・ 索 引 語 に (L) IT.PS/FA を演 算 すると，当 索 引 項 目 に限 定 して検 索 できる．また，索 引 語 と
Modifier は (S) 演 算 子 でリンクさせることができる．
・ この索 引 項 目 は収 録 期 間 が限 定 されている．全 年 代 を対 象 に検 索 したい場 合 は，標 題 および その他 の索 引 語 (Miscellaneous Discriptors) による検 索 で補 完 するとよい．
(L)
(L)
(S)
(S)
49
バイオサイエンス分 野 の検 索テクニック ＢＩＯＳＩＳ ファイル － 検 索 例 ３
■ 検 索 例 3 ： インフルエンザなどの，オルソミクソウイルス科 のウイルスが病 原 として研 究 されて いる文 献 を検 索し，下 記 の解 析 を行 う．
(1) 宿 主 をニワトリ，ブタ，渡 り鳥 (カモ目 の鳥) に限 定して，件 数 の推 移 を解 析 する．
(2) 2010 年 以 降 の文 献 で，ヒト，マウス，細 胞 以 外 でどのような宿 主 について研 究 されているか
を解 析 する．
◆ 検 索 の手 順 ◆
1. ウイルスおよび宿 主 の生 物 索 引 を予 備 検 索 の結 果 で確 認 する 予 備 検 索 を行 い，病 原 であるウイルスと宿 主 の生 物 の索 引 を確 認 する．
2 - 1 宿 主 を限 定 して，発 行 年 ごとの件 数 推 移 を解 析 する
Modifier で生 物 の役 割 を宿 主 に限 定 して検 索 し，得 られた回 答 の発 行 年 を解 析 する．
2 - 2 2010 年 以 降 で，ヒト，マウス，細 胞 以 外 の宿 主 を解 析 する
ウイルス名 のみで検 索して得 られた回 答 を解 析して，宿 主 の情 報 を解 析 する．
1. 予 備 検 索 の結 果 から索 引 を確 認 する
=> FILE BIOSIS
=> S SWINE(S)INFLUENZA/TI ← ブ タ イ ン フ ル エ ン ザ が 主 題 で あ る 文 献 を 検 索 L1 993 SWINE(S)INFLUENZA/TI
=> D TI ORGN 1-5 ← 標 題 と 生 物 索 引 を 表 示
L1 ANSWER 1 OF 993 BIOSIS COPYRIGHT (c) 2013 The Thomson Corporation on STN TI Dynamics of influenza A virus infections in permanently infected pig farms: evidence of recurrent infections, circulation of several swine influenza viruses and reassortment events.
ORGN Classifier
Orthomyxoviridae 03505 ← オ ル ソ ミ ク ソ ウ イ ル ス 科 Super Taxa
Negative Sense ssRNA Viruses; Viruses; Microorganisms Organism Name
Influenza A virus (species): pathogen , strain-H1N1, strain-H1N2 Taxa Notes
Microorganisms, Negative Sense Single-Stranded RNA Viruses, Viruses ORGN Classifier
Suidae 85740 ← イ ノ シ シ 科 Super Taxa
Artiodactyla; Mammalia; Vertebrata; Chordata; Animalia Organism Name
pig (common): host ← ブ タ (一 般 名) Taxa Notes
Animals, Artiodactyls, Chordates, Mammals, Nonhuman Vertebrates, Nonhuman Mammals, Vertebrates
：
病 原 の Modifier
宿 主 の Modifier
バイオサイエンス分 野 の検 索テクニック ＢＩＯＳＩＳ ファイル － 検 索 例 ３
=> S CHICKEN/ORGN ← 生 物 索 引 で ニ ワ ト リ を 検 索 L2 72354 CHICKEN/ORGN
=> D ORGN ← 索 引 を 確 認
L2 ANSWER 1 OF 72354 BIOSIS COPYRIGHT (c) 2013 The Thomson Corporation on STN
ORGN Classifier
Galliformes 85536 ← キ ジ 目 の Classifier Super Taxa
Aves; Vertebrata; Chordata; Animalia Organism Name
chicken (common) ← ニ ワ ト リ (一 般 名) Taxa Notes
Animals, Birds, Chordates, Nonhuman Vertebrates, Vertebrates
=> S ANSERIFORMES/ORGN ← 生 物 索 引 で カ モ 目 を 検 索 L3 36007 ANSERIFORMES/ORGN
=> D ORGN
L3 ANSWER 1 OF 5242 BIOSIS COPYRIGHT (c) 2013 The Thomson Corporation on STN
ORGN Classifier
Anseriformes 85504 ← カ モ 目 の Classifier Super Taxa
Aves; Vertebrata; Chordata; Animalia Organism Name
duck (common): host Taxa Notes
Animals, Birds, Chordates, Nonhuman Vertebrates, Vertebrates ORGN Classifier
Orthomyxoviridae 03505 Super Taxa
Negative Sense ssRNA Viruses; Viruses; Microorganisms Organism Name
H5N1 Avian influenza virus (common): pathogen Taxa Notes
Microorganisms, Negative Sense Single-Stranded RNA Viruses, Viruses
予 備 検 索 で確 認 した索 引 情 報
・ 病 原 であるウイルスには pathogen，宿 主 には host の Modifier が付 与 されている．
・ オルソミクソウイルス科 ，およびカモ目 は統 制 語 である Classifier を検 索 に利 用 できる．
・ ニワトリ，ブタは統 制 されていない Organism Name で検 索 するため，同 義 語 を含 める必 要 がある．
51
バイオサイエンス分 野 の検 索テクニック ＢＩＯＳＩＳ ファイル － 検 索 例 ３
2 - 1a 宿 主 を限 定 して検 索し，発 行 年 を解 析 する (ブタ)
=> S ORTHOMYXOVIRIDAE/ORGN (L) PATHOGEN ← ウ イ ル ス に PATHOGEN を リ ン ク さ せ て 検 索 L4 21498 ORTHOMYXOVIRIDAE/ORGN (L) PATHOGEN
=> S L4 AND (SWINE OR PIG)/ORGN (S) HOST ← 同 義 語 を 含 め た 生 物 名 に HOST を リ ン ク さ せ て 検 索 L5 795 L4 AND (SWINE OR PIG)/ORGN (S) HOST
=> D ORGN ← ヒ ッ ト し た 回 答 の 索 引 情 報 を 確 認
L5 ANSWER 1 OF 795 BIOSIS COPYRIGHT (c) 2013 The Thomson Corporation on STN
ORGN Classifier
Orthomyxoviridae 03505 Super Taxa
Negative Sense ssRNA Viruses; Viruses; Microorganisms Organism Name
Influenza A virus (species): pathogen, strain-H1N1, strain-H1N2 Taxa Notes
Microorganisms, Negative Sense Single-Stranded RNA Viruses, Viruses ORGN Classifier
Suidae 85740 Super Taxa
Artiodactyla; Mammalia; Vertebrata; Chordata; Animalia Organism Name
pig (common): host Taxa Notes
Animals, Artiodactyls, Chordates, Mammals, Nonhuman Vertebrates, Nonhuman Mammals, Vertebrates
=> ANA L5 PY ← 全 件 の 発 行 年 を 解 析
L6 ANALYZE L5 1- PY : 17 TERMS
=> D 1- ALP D ← 解 析 し た 発 行 年 を 降 順 で 表 示 L6 ANALYZE L5 1- PY : 17 TERMS
TERM # # OCC # DOC % DOC PY
--- --- --- --- --- 1 95 95 11.95 2013
2 131 131 16.48 2012 3 139 139 17.48 2011 4 105 105 13.21 2010 5 93 93 11.70 2009 6 49 49 6.16 2008 7 41 41 5.16 2007 8 34 34 4.28 2006 9 20 20 2.52 2005 10 16 16 2.01 2004 11 13 13 1.64 2003 12 18 18 2.26 2002 13 13 13 1.64 2001 14 15 15 1.89 2000 15 5 5 0.63 1999 16 7 7 0.88 1998 17 1 1 0.13 1997
********* END OF L6 ***
(L)
(S)
バイオサイエンス分 野 の検 索テクニック ＢＩＯＳＩＳ ファイル － 検 索 例 ３
2 - 1b 宿 主 を限 定して検 索し，発 行 年 を解 析 する (ニワトリ)
=> S L4 AND (CHICKEN OR BROILER CHICKEN OR HEN OR ROOSTER OR FOWL OR POULTRY)/ORGN (S) HOST L7 1728 L4 AND (CHICKEN OR BROILER CHICKEN OR HEN OR ROOSTER OR FOWL OR
POULTRY)/ORGN (S) HOST ↑
同 義 名 を 含 め た 生 物 名 に HOST を リ ン ク さ せ て 検 索
=> D ORGN
L7 ANSWER 1 OF 1728 BIOSIS COPYRIGHT (c) 2013 The Thomson Corporation on STN
： ORGN Classifier
Galliformes 85536 Super Taxa
Aves; Vertebrata; Chordata; Animalia Organism Name
chicken (common): host Taxa Notes
Animals, Birds, Chordates, Nonhuman Vertebrates, Vertebrates
： ORGN Classifier
Orthomyxoviridae 03505 Super Taxa
Negative Sense ssRNA Viruses; Viruses; Microorganisms Organism Name
Influenza virus (common): pathogen Taxa Notes
Microorganisms, Negative Sense Single-Stranded RNA Viruses, Viruses
=> ANA L7 PY
L8 ANALYZE L7 1- PY : 17 TERMS
=> D 1- ALP D
L8 ANALYZE L7 1- PY : 17 TERMS
TERM # # OCC # DOC % DOC PY
--- --- --- --- --- 1 123 123 7.12 2013
2 232 232 13.43 2012 3 231 231 13.37 2011 4 234 234 13.54 2010 5 199 199 11.52 2009 6 134 134 7.75 2008 7 161 161 9.32 2007 8 129 129 7.47 2006 9 96 96 5.56 2005 10 45 45 2.60 2004 11 75 75 4.34 2003 12 19 19 1.10 2002 13 15 15 0.87 2001 14 14 14 0.81 2000 15 9 9 0.52 1999 16 10 10 0.58 1998 17 2 2 0.12 1997
********* END OF L8 ***
(S)
53
バイオサイエンス分 野 の検 索テクニック ＢＩＯＳＩＳ ファイル － 検 索 例 ３
2 - 1c 宿 主 を限 定 して検 索し，発 行 年 を解 析 する (カモ目)
=> S L4 AND ANSERIFORMES/ORGN (L) HOST
L9 761 L4 AND ANSERIFORMES/ORGN (L) HOST
=> D ORGN
L9 ANSWER 1 OF 761 BIOSIS COPYRIGHT (c) 2013 The Thomson Corporation on STN
ORGN Classifier
Anseriformes 85504 Super Taxa
Aves; Vertebrata; Chordata; Animalia Organism Name
duck (common): egg, embryo, host goose (common): egg, embryo, host Taxa Notes
Animals, Birds, Chordates, Nonhuman Vertebrates, Vertebrates
：
ORGN Classifier
Orthomyxoviridae 03505 Super Taxa
Negative Sense ssRNA Viruses; Viruses; Microorganisms Organism Name
Avian influenza virus (species) [AIV (common)]: pathogen Taxa Notes
Microorganisms, Negative Sense Single-Stranded RNA Viruses, Viruses
：
=> ANA L9 PY
L10 ANALYZE L9 1- PY : 15 TERMS
=> D 1- ALP D
L10 ANALYZE L9 1- PY : 15 TERMS
TERM # # OCC # DOC % DOC PY
--- --- --- --- --- 1 73 73 9.59 2013
2 105 105 13.80 2012 3 102 102 13.40 2011 4 113 113 14.85 2010 5 89 89 11.70 2009 6 63 63 8.28 2008 7 89 89 11.70 2007 8 49 49 6.44 2006 9 32 32 4.20 2005 10 10 10 1.31 2004 11 15 15 1.97 2003 12 7 7 0.92 2002 13 4 4 0.53 2001 14 6 6 0.79 2000 15 4 4 0.53 1999
********* END OF L10***
Classifier と Organism Name の Modifier は (L) 演 算 子 でリンクさせる
(L)
バイオサイエンス分 野 の検 索テクニック ＢＩＯＳＩＳ ファイル － 検 索 例 ３
■ 解 析 結 果 のまとめ
・ ニワトリは 2004 年 以 降 ，ブタは 2009 年 以 降 ，それぞれ新 型 インフルエンザの流 行 にともな って顕 著 に件 数 が増 加 している．また，家 畜 動 物 だけでなく野 生 の渡 り鳥 (カモ目 の鳥) につ いても，研 究 が進 んでいることが分 かった．
0 50 100 150 200 250
2011 2009
2007 2005
2003 2001
1999 1997
ブタ ニワトリ カモ目
55
バイオサイエンス分 野 の検 索テクニック ＢＩＯＳＩＳ ファイル － 検 索 例 ３
2 - 2 ヒト，マウス，細 胞 以 外 の宿 主 の情 報 を解 析 する
=> SET HIGH OFF ← ヒ ッ ト タ ー ム ハ イ ラ イ ト を 付 与 し な い 設 定 SET COMMAND COMPLETED
=> S ORTHOMYXOVIRIDAE/ORGN (L) PATHOGEN ← ウ イ ル ス 名 で 検 索 L11 21498 ORTHOMYXOVIRIDAE/ORGN (L) PATHOGEN
=> SET HIGH ON ← ハ イ ラ イ ト の 設 定 を 元 に 戻 す SET COMMAND COMPLETED
=> S L11 AND
HOST/ORGN (NOTS) (HUMAN OR MOUSE OR CELL_LINE)/ORGN
L12 5237 L11 AND HOST/ORGN (NOTS) (HUMAN OR MOUSE OR CELL_LINE)/ORGN
=> D 10 ORGN
L12 ANSWER 10 OF 5237 BIOSIS COPYRIGHT (c) 2013 The Thomson Corporation on STN
：
ORGN Classifier
Galliformes 85536 Super Taxa
Aves; Vertebrata; Chordata; Animalia Organism Name
chicken (common): host
QM5 cell line (cell_line): host, quail myoblast cells Taxa Notes
Animals, Birds, Chordates, Nonhuman Vertebrates, Vertebrates ORGN Classifier
Muridae 86375 Super Taxa
Rodentia; Mammalia; Vertebrata; Chordata; Animalia Organism Name
mouse (common): host, strain-BALB/c, female Taxa Notes
Animals, Chordates, Mammals, Nonhuman Vertebrates, Nonhuman Mammals, Rodents, Vertebrates
： ORGN Classifier
Orthomyxoviridae 03505 Super Taxa
Negative Sense ssRNA Viruses; Viruses; Microorganisms Organism Name
Avian influenza H7N7 virus (common): pathogen, strain-H7N7/03 Taxa Notes
Microorganisms, Negative Sense Single-Stranded RNA Viruses, Viruses
(NOTS) 演 算 子 を 利 用 し た た め ， cell_line，mouse は host であるが ヒットタームにはなっていない
ウイルスの索 引 は SET HIGHLIGHT OFF の 設 定 で 検 索 し た た め ， ヒ ッ ト タ ー ムハ イ ライトが付 与 されていない
参 考 ： NOT 近 接 演 算 子
NOT 近 接 演 算 子 は，（L） や （S） などの近 接 演 算 子 と組 み合 わせて （NOTL） や （NOTS） のように 使 用 して，次 の条 件 が満 たされるように検 索 を限 定 する．
・ 第 1 の検 索 語 が存 在 する．
・ 第 2 の検 索 語 は，指 定 された近 接 範 囲 内 には存 在 しない．
(S) の 近 接 範 囲 に HUMAN，MOUSE， CELL_LINE が存 在 しない HOST を検 索
解 析 対 象 となる生 物 名 のみにヒット タームハイライトが付 与 された
(L)
(S)
(S)