ライブラリ使用方法

スーパーコンピュータでは以下のライブラリを提供しています。

詳細は各詳細マニュアルを参照して下さい。

ライブラリ名称 バージョン リンク可能なコンパイラ 備考 CSML(Cray Scientific and Math

Libraries)

18.03.1 各コンパイラ

Intel MKL（インテル マス・カーネル・

ライブラリー）

18.0.2.199 17.0.4.196

Intelコンパイラ

Third Party Products - 各コンパイラ

５.２.１ CSML(Cray Scientific and Math Libraries)

CSML (Cray Scientific and Math Libraries)は、Crayが提供する科学数学ライブラリ群です。

以下のライブラリが利用可能です。

ライブラリ名称 説明 対応ライブラリ モジュール名 備考

Cray LibSci XC50 システム向

けに最適化された 科学技術計算ライ ブラリ

BLAS, LAPACK, BLACS,

ScaLAPCK, IRT, etc

cray-libsci デフォルトでロー

ドされる

Cray PETSc (Portable,

Extensible Toolkit for Scientific Computation)

線形・非線形方程 式並列ソルバーラ イブラリ

MUMPS, SuperLU, SuperLU_dist, ParMETIS, HYPRE , etc

cray-petsc

Cray Trilinos Packages

科学計算ライブラ リのオブジェクト指 向インターフェイス

PETSc,

Metis/ParMetis, SuperLU, Aztec, BLAS, LAPACK

cray-trilinos cray-petsc を 事 前にロードする必 要あり

TPSL (Third Party Scientific Libraries)

PETSc/Trilinos と組み合わせ可能 な数学ライブラリ

MUMPS, Super_LU, Super_LU_dist, ParMetis, Hypre, Sumdials, Scotch, etc

cray-tpsl

FFTW3.3 Library FFTW バージョン 3.3

FFTW3.3 cray-fftw

FFTW2.1 Library FFTW バージョン 2.1

FFTW2.1 fftw ライブラリ名が単

精度・倍精度によ って変わるため、

リンク時に選択指 示が必要

５-３５

（１） プログラム環境の設定

superではCrayコンパイラをデフォルトで設定しています。

必要に応じて利用するプログラム環境に切替えて下さい。

・例 intelコンパイラの環境への切替

（２） 使用例

例1： CrayコンパイラでFFTW3.3 LibraryをMPI並列プログラムから利用する場合

例2： Intel コンパイラでFFTW3.3 LibraryをMPI 並列とスレッド並列を組み合わせたプログラ ムから利用する場合

例3： FFTW2.1 Libraryを単精度で利用する場合

例4： FFTW2.1 Libraryを倍精度で利用する場合

５.２.２ Intel MKL

Intel MKL（インテル マス・カーネル・ライブラリー）は、BLAS, LAPACK, SparseBLAS, PARDISO, Iterative Sparse Solver, FFT, 乱数生成などを含むライブラリです。

（１） プログラム環境の設定

Intelプログラム環境(PrgEnv-intel)をロードすることで利用可能です。

なお、競合回避のため、cray-libsci はアンロードして下さい。

$ module load cray-fftw

$ cc main.c -L${FFTW_DIR} -lfftw3_mpi -lfftw3

$ module switch PrgEnv-cray PrgEnv-intel

$ module load cray-libsci

$ module switch PrgEnv-cray PrgEnv-intel

$ module load cray-fftw

$ cc -qopenmp main.c -L${FFTW_DIR} -lfftw3_mpi -lfftw3_threads -lfftw3

$ module load fftw

$ cc main.c -lsrfftw_mpi -lsfftw_mpi -lsrfftw -lsfftw

$ module load fftw

$ cc main.c -ldrfftw_mpi -ldfftw_mpi -ldrfftw -ldfftw

５-３６

・例 Crayコンパイラの環境からの切替

（２） 使用例

・固定形式のBLASを使用したFortranのソースプログラムhello.fからhello.outという 実行モジュールを作成

・BLASを使用したCのソースプログラムhello.cからhello.outという実行モジュールを作成

５.２.３ Third Party Products

以下のライブラリが利用可能です。

ライブラリ名称 モジュール名 備考

NetCDF(Unidata’s Network Common Data Format) Library

cray-netcdf

cray-parallel-netcdf

シリアル版 並列版 HDF5(Hierarchical Data

Format 5) Libraries & Utilities

cray-hdf5

cray-hdf5-parallel

シリアル版 並列版

$ ftn -mkl -o hello.out -fixed hello.f

$ module switch PrgEnv-cray PrgEnv-intel

$ module unload cray-libsci

$ cc -mkl -o hello.out hello.c

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