GlycoStation
TM
Reader 1200
LecChip
TM
Gold Standard
糖鎖プロファイリング
テクノロジープラットフォーム
:
GlycoStation
TM
レクチンマイクロアレイ
:
糖鎖は細胞の顔
:
生命は糖鎖なしでは存在し
ない
Alberts et al. (eds.) Molecular biology of the cell (3rd ed.) p.502
P.M.Rudd et al., J. Mol. Biol. 293, 351-366
癌
免疫
再生医療
感染症
80% の分化マーカーは糖
鎖抗原です。
ex. SSEA-3,
TRA-1-60
感染症のターゲット分子
の多くが糖鎖抗原です。
ex. インフルエンザウイル
スとシアル酸
●ヒトのタンパク質の50%以上が糖鎖修飾を受けている。
●糖鎖構造は、生命の発生、分化、癌化などで大きく変化する。
●組織毎に糖鎖構造は異なり、そしてまたそれは種によっても異なる。
●個々人の間でも幾つかの糖鎖構造は異なる (たとえば, A, B, O血液型)
●それ故、医療行為におけるほとんどの現象には糖鎖の構造変化が何らかの形で関係していると言って過言
ではない。
どうして糖鎖は重要なのか
?
腫瘍マーカーの
70% 以上は糖鎖抗原。
ex)CA19-9, CA125
免疫系には多くの糖鎖抗原
が関与している。
ex. NKT細胞と糖脂質抗
原
Ga
in115
133
mS
ec
1000
500
250
125
62.5
(ng/mL)
クルードサンプルの糖鎖プ
ロファイリング例
:
ラットの組織
肝臓と脳から抽出したタンパク質
で次の糖鎖構造で大きな違いが
見られる
・
Sia
a
2-6
・
T-antigen
GlycoStation
TM
は、スライドグラス上に
固定化された多数のレクチンを持つマイク
ロアレイ
(“
LecChip
TM
”)に蛍光ラベリング
を行ったタンパク質溶液をアプライし、蛍
光画像を取得する。レクチンが認識する
糖鎖エピトープ情報を元に、糖鎖のプロ
ファイリングを行うシステムの名称である。
得られた蛍光画像は、専用の解析ソフト
GlycoStation
TM
Tools Pro
を用いて解
析される。
Lectin
n
レクチンアレイを使って、糖鎖構造のバイオロジ
カルなプロファイリングを行う
Evanescent-field fluorescence-assisted lectin microarray: a new strategy for glycan profiling,
A. Kuno, J. Hirabayashi et al., Nature Methods, vol2, No.11, November (2005) pp851-856
LecChip™
LAA07B00701アレイ表面の洗浄操
作なしに、ダイレクトに
液層から蛍光画像を
取得する。
得られた蛍光
画像
45 種類のレクチンが3重に固
定化されている
固定化パターン
LecChip
TM
ver.1.0
Fuc
Sia
O-Glycan
Asialo
Agalacto
High-Man
Gal
Chitin
Others
Branch
LecChip™ Ver.1.0
LTL
1
PS
A
2
LC
A
3
U
EA
_I
4
AO
L
5
AA
L
6
M
AL_
I
7
SNA
8
SS
A
9
TJ
A-I
10
PH
A(
L)
1
1
EC
A
12
RC
A1
20
1
3
PH
A(
E)
1
4
D
SA
1
5
GS
L-II
1
6
NP
A
17
Co
nA
1
8
GN
A
19
H
H
L
20
AC
G
21
TxLC
_I
2
2
BP
L
23
TJ
A-II
2
4
EE
L
25
AB
A
26
LE
L
27
STL
28
U
D
A
29
PW
M
3
0
Ja
ca
lin
3
1
PNA
3
2
W
FA
3
3
AC
A
34
M
PA
3
5
H
PA
3
6
VV
A
37
D
BA
3
8
SB
A
39
Ca
ls
ep
a
40
PTL_
I
41
M
AH
4
2
W
GA
4
3
GS
L_
I_
A4
4
4
GS
L_
I_
B4
4
5
M
ar
ke
r
46
BG
47
CV
1
0.95
0.9
0.85
0.8
0.75
0.7
0.65
0.6
0.55
0.5
0.45
0.4
0.35
0.3
0.25
0.2
0.15
0.1
0.05
0
LecChip
TM
: 世界TOPクラスの性能を誇るプロテイン(レクチン)アレイ
Good control of the shape of
each spot and the CV-value
CV value
Configuration
45 species, 3 spots per lectin
Number of
Lectins
7 wells on a slide glass, well volume=100
m
L
Number of Wells
- 20
oC
Storage Condition
Approx. 180 days
Storage Life
<20% (over all)
LecChip
TMVer.1.0
CV=20%
糖鎖
/レクチン:
K
d
10
-4
〜
10
-7
M
抗原
/抗体: 10
-6
〜
10
-9
M
アビジン
/ビオチン: 10
-12
M
Lectin
Glycan
Washing
Interaction between glycan and lectin is so weak
Lose binding
3-4 nm
4-6 nm
エバネッセント波蛍光励起:
高感度で使いやすい
Edited by M. Yamada, 8/21/2007 Lectin No. Lectin Reported specificity
1 LTL Fuca1-3Gal1-4)GlcNAc, Fuca1-2Gal1-4GlcNAc 2 PSA Fuca1-6GlcNAc, a-D-Glc, a-D-Man
3 LCA Fuca1-6GlcNAc, a-D-Glc, a-D-Man 4 UEA-I Fuca1-2Gal1-4GlcNAc
5 AOL Fuca1-6GlcNAc (core fucose)
6 AAL Fuca1-6GlcNAc, Fuca1-3(Gal1-4)GlcNAc 7 MAL Siaa2-3Gal1-4GlcNAc
8 SNA Siaa2-6Gal/GalNAc 9 SSA Siaa2-6Gal/GalNAc 10 TJA-I Siaa2-6Gal/GalNAc
11 PHAL tri/tetra-antennary complex-type N-glycan 12 ECA Gal1-4GlcNAc
13 RCA120 Gal1-4GlcNAc
14 PHAE bi-antennary complex-type N-glycan with outer Gal and bisecting GlcNAc 15 DSA (GlcNAc1-4)n, Gal1-4GlcNAc
16 GSL-II agalactosylated tri/tetra antennary glycans, GlcNAc 17 NPA High-Mannose, Mana1-6Man
18 ConA High-Mannose, Mana1-6(Mana1-3)Man 19 GNA High-Mannose,Mana1-3Man
20 HHL High-Mannose,Mana1-3Man, Mana1-6Man 21 ACG Siaa2-3Gal1-4GlcNAc
22 TxLCI Mana1-3(Mana1-6)Man, bi- and tri-antennary complex-type N-glycan, GalNAc 23 BPL Gal1-3GalNAc, GalNAc
24 TJA-II Fuca1-2Gal1-> or GalNAc1-> groups at their nonreducing terminals 25 EEL blood group B antigen,Gala1-3Gal
26 ABA Gal1-3GalNAc 27 LEL GlcNAc trimers/tetramers
28 STL GlcNAc oligomers, oligosaccharide containing GlcNAc and MurNAc 29 UDA GlcNAc1-4GlcNAc, Mixture of Man5 to Man9
30 PWM (GlcNAc1-4)n 31 Jacalin Gal1-3GalNAc, GalNAc 32 PNA Gal1-3GalNAc
33 WFA GalNAc1-4GlcNAc, Gal1-3(-6)GalNAc 34 ACA Gal1-3GalNAc
35 MPA Gal1-3GalNAc, GalNAc 36 HPA a-linked terminal GalNAc
37 VVA a-linked terminal GalNAc, GalNAca1-3Gal 38 DBA blood group A antigen, GalNAca1-3GalNAc 39 SBA a- or -linked termincal GalNAc, GalNAca1-3Gal 40 Calsepa Mannose, Maltose
41 PTL-I a-linked terminal GalNAc 42 MAH Siaa2-3Gal1-3(Siaa2-6)GalNAc 43 WGA chitin oligomers, Sia
44 GSL-I A4 a-linked GalNAc 45 GSL-I B4a-linked Gal
Remarks) These data were collected from lectin vendors and reports found by internet searches.
特徴的な糖鎖結合性を有する
45 種
類のレクチン(主に天然型)が固定化
されている
10,000種以上の相互作用をカバーする
lectin-glycan affinity (FAC) データベースが2009年8月
19日に公開された。
Glycoprotein
Glycolipid
Endogenous lectin/
Receptor
(抗体オーバーレイ法も)
生きた細胞表面を
そのままに
細胞や組織から抽出
されたタンパク質
Cultured cells
精製されたタンパク質
各種サンプルが取り扱える
糖タンパク質溶
液
蛍光ラベリング
レクチンアレイ
スキャン、数値
化
071227_Gain85_E00133_LAA07C00802_155253_well5 071227_Gain85_E00133_LAA07C00805_162416_well5 LT L 1 PS A 2 LC A 3 U EA _I 4 A OL 5 A A L 6 M A L_ I 7 SN A 8 SS A 9 TJ A -I 1 0 PH A (L ) 11 EC A 1 2 R CA 12 0 13 PH A (E ) 1 4 D SA 1 5 G SL -I I 16 N PA 1 7 Co nA 1 8 G N A 1 9 H H L 20 A CG 2 1 Tx LC_ I 22 BP L 23 TJ A -II 2 4 EE L 25 A BA 2 6 LE L 27 ST L 28 UD A 2 9 PW M 3 0 Ja ca lin 3 1 PN A 3 2 W FA 3 3 A CA 3 4 M PA 3 5 H PA 3 6 VV A 3 7 D BA 3 8 SB A 3 9 Ca ls ep a 40 PT L_ I 41 M A H 4 2 W G A 4 3 G SL _I _A 4 44 G SL _I _B4 4 5 M ar ke r 4 6 BG 4 7 N et In te ns ity 65,000 60,000 55,000 50,000 45,000 40,000 35,000 30,000 25,000 20,000 15,000 10,000 5,000 0 071227_Gain85_E00133_LAA07C00802_155253_well5 071227_Gain85_E00133_LAA07C00805_162416_well5 LT L 1 PS A 2 LC A 3 U EA _I 4 A OL 5 A A L 6 M A L_ I 7 SN A 8 SS A 9 TJ A -I 1 0 PH A (L ) 11 EC A 1 2 R CA 12 0 13 PH A (E ) 1 4 D SA 1 5 G SL -I I 16 N PA 1 7 Co nA 1 8 G N A 1 9 H H L 20 A CG 2 1 Tx LC_ I 22 BP L 23 TJ A -II 2 4 EE L 25 A BA 2 6 LE L 27 ST L 28 UD A 2 9 PW M 3 0 Ja ca lin 3 1 PN A 3 2 W FA 3 3 A CA 3 4 M PA 3 5 H PA 3 6 VV A 3 7 D BA 3 8 SB A 3 9 Ca ls ep a 40 PT L_ I 41 M A H 4 2 W G A 4 3 G SL _I _A 4 44 G SL _I _B4 4 5 M ar ke r 4 6 BG 4 7 N et In te ns ity 65,000 60,000 55,000 50,000 45,000 40,000 35,000 30,000 25,000 20,000 15,000 10,000 5,000 0解析
30~60 min.
90 min. (incl. 60 min incubation)
3~20 h incubation
About 15 min.
実例
: CHO vs. Lec1 mutant cells
CHO - Chinese hamster ovary
Lec1 mutant -
GlcNAc-T1をノックアウト
=> N型糖鎖の糖鎖修飾に大きな変化が起こる
GlcNAc
Glc
Man
Gal
Sia
GlcNAc-T1
L
ecti
n
I
n
ten
si
ty
CHOに比べてLec1では
・ 複合型N型糖鎖
↓
・ シアル酸
↓
・ ガラクトース
↓
・ マンノース
↑
Lectin Intensity
L
ecti
n
I
n
ten
si
ty
Lectin Intensity
どんな変化が見られるの
?
(A) A scheme of total procedures, (B) Scan images of brain glyoblastoma, stomach adenocarcinoma, colon normal control (N), and
adenocarcinoma (T), and (C) The obtained profiling patterns were normalized by a lectin showing the maximum intensity in each case;
UDA for brain glyoblastoma, stomach adenocarcinoma and adenocarcinoma (T), and STL for colon normal control (N).
パラフィン固定化組織切片からの糖鎖プロファイリング
超高感度
:
わずか
500個の細胞
から右図のようなき
れいな蛍光画像が得
られる。
0 1 2 3 4 5 6 L T L 1 PSA 2 L CA 3 UEA _I 4 AO L 5 AA L 6 MA L _I 7 S NA 8 S S A 9 T JA-I 10 PHA(L ) 11 ECA 12 R CA 120 13 PHA(E) 14 D S A 15 G S L -I I 16 NPA 17 ConA 18 GNA 19 HHL 20 AC G 21 T xL C_I 22 BPL 23 T JA-II 24 EEL 25 ABA 26 LEL 27 S T L 28 UD A 29 PWM 30 Jaca lin 31 PNA 32 WFA 33 AC A 34 MPA 35 HPA 36 VV A 37 D B A 38 S B A 39 Cal sep a 40 PTL _I 41 MA H 42 WGA 43 G S L _I _A 4 44 G S L _I _B 4 45 Mark er 46 BG 47 No rm al is ed Net I nt ens it y(Al l S p ots ) NKNT-3 NKNT-3/3-9-2
規格化されたデータ
培養液中へ分泌されたタンパク質からの糖鎖プ
ロファイリング
Courtesy of Dr. H. Nakabayashi, Hokkaido Information Univ.
NKNT-3: 正常株
NKNT-3/3-9-2: 癌化した株
O型糖鎖に明瞭な違い
Drs. H. Tateno, J. Hirabayashi et al. Glycobiology, vol17, No.2, pp.1138-1146, (2007)
生きた細胞表面の糖鎖
プロファイリング
Cell-Tracker Orange CMRA を
細胞全体をラベリングするために
使用する
LecChip
TM
Lec1: Lack the glycosyltransferase termed GlcNAc-TI, which produces incomplete
intermediates of N-linked carbohydrates
Lec2: Sia-transporter mutant, unable to transport CMP-sialic acid into the golgi compartment
Lec8: Gal-transporter mutant, unable to transport UDP-galactose into the golgi compartment
どんな複雑な糖鎖であっても
(混合物であってさえ), GlycoStationは、タンパ
ク質から糖鎖を切出すことなく、糖鎖のエピトープイメージをハイスループット、高
感度、高精度で解析することができる。
・
GlycoStationのメリット
洗浄操作なし(高い再現性)
実時間液層計測が可能
どんな弱い相互作用も見逃さない missing any weak interactions
N型糖鎖もO型糖鎖も
異性体
・超高感度(
LOD)
100pg/mL
糖タンパク質
100pM
糖鎖
10
3
細胞
・クルードサンプルも可能
・高い汎用性と広い応用性
N. Uchiyama et al., Proteomics 2008, 8, 3042-3050
Specs.
Appendix
Light source
metal halide lamp: 350W
durability: >1500 hours (60% of
initial intensity)
Fluorescent label
Cy3 etc.
wavelength is selected by a filter
Control PC
internal high performance PC, Windows XP
Function
resolution
5
m
m
scanning, automatic scanned data saving
scanning time: 2min./slide
( exposure time: 34msec)
variable exposure time
33.3msec~34. 3sec
variable camera gain
1~127 (25
oC、Max.: 1000Gain)
continuous scanning
acquisition of scanning pictures at
different gain
hour indicator
life time of metal halide lamp
External terminal
USB2×3, LAN(1000M)×1, VGA×1, Mouse,
key board terminal
Input Voltage
AC100V-240V 50/60Hz
Power Consumption
650W (body) 450W (light source)
Size of outward form
W440×D592×H585 (mm) (body)
W170×D340×H225 (mm) (light source)
Weight
70kg (body), 8.5kg (light source)
GlycoStation
TM
Reader 1200
は、GlcyoStationを構成するスキャナー。エバネッセン
ト波蛍光励起法を使用し、ハイスループットで高感度にレクチンマイクロアレイ (“LecChips”) をスキャンすることができる。
High power white light source
Wavelength is selected by a filter
World fastest scanner: < 2min.
High resolution 5
m
m
GlycoStation
TM
Reader
Method
Mass Spectrometry
HPLC
Lectin Microarray
Protocol
Glycan cleaving from Protein by
PNGase
Glycan cleaving from protein by
PNGase
No glycan cleaving from protein
Purification of cleaved glycans
Gel Filtration
Cy3 labeling and Gel Filtration
PA labeling and Gel Filtration
PA labeling and Gel Filtration
Incubation on Lectin Microarray
Mass Spectroscopy
Separation by
DEAE(Diethylaminoethyl) Column Fluorescence Image Scan
Data analysis and matching
Separation by ODS(Octadecyl
Silane)Column
Data Analysis (differential analysis)
Separation by Amide Column
Data analysis and matching
Protein
100
m
g
100
m
g
1
m
g ~ 10ng Order
Glycan
only N-glycans
only N-glycans
both N- and O-glycans
limited performance for O-glycans limited performance for O-glycans
Isomers
Poor
So-So
Very GOOD
Structure Analysis GOOD (difficult in isomer
identification)
GOOD (depend on database size)
Epitope Profiling (not definite
identification of detailed glycan
structure)
Processing time
2days
4days
3hours (except for incubation time)
Price
~US$1M
~US$200,000
20 HHL Conc. (ng/mL) 10 100 1,000 10,000 100,000 1,000,000 N et I nt en si ty 25,000 20,000 15,000 10,000 5,000 0 24 TJA-II Conc. (ng/mL) 10 100 1,000 10,000 100,000 1,000,000 Net I nten si ty 50,000 40,000 30,000 20,000 10,000 0 27 LEL Conc. (ng/mL) 10 100 1,000 10,000 100,000 1,000,000 Net I nten si ty 80,000 70,000 60,000 50,000 40,000 30,000 20,000 10,000 0