平成 年 月 日受付 平成 年 月 日受理 元東京農業大学農学部バイオセラピ 学科 東京農業大学農学部畜産学科 東京農業大学名誉教授 東京農業大学客員教授 マ カ を用いた研究 が行なわれている り 品種内に生じた遺伝的差異については は 座位 は 座位 軍鶏は多くの日本鶏品種の作出に広く用いられてきたが それら軍鶏およびその近縁品種間の遺伝的 類縁関係や品種内に生じた遺伝的差異については現在でも不明な点が多い そこで本研究はマイクロサテラ イト 多型情報を用いて軍鶏およびその近縁品種につき分析を行なった 供試鶏として 品種 集団 羽を用い マイクロサテライト 座位の分析を行なった その結果 交雑により作出された品種であっ ても 選抜や品種を維持する過程で遺伝的多様性が低下したと考えられる品種も認められた 特に声良は 座位で多型が認められず もっとも低い遺伝的多様性を示した 品種間の遺伝的類縁関係は書誌学的 形態 学的研究にもとづく説をおおむね支持するものであった 品種間の遺伝的分化の程度は高かった一方 同一 品種の別地域集団は系統樹においてクラスタ を形成した 軍鶏 薩摩鶏 矮鶏において 品種内に生じた 遺伝的差異の程度は異なるものであった 軍鶏は地域集団間で明確な遺伝的差異が認められた一方 矮鶏は 地域集団間や内種間で明確な差異は認められなかった 薩摩鶏は地域集団間で差異が認められ さらに内種 によっても遺伝的差異が生じていた 本研究結果より 軍鶏およびその近縁品種間の遺伝的類縁関係は従来 説をおおむね支持する一方 品種内に生じる遺伝的差異は品種の維持形態やそれを取り巻く人側の要因によ り 程度や分集団の単位が異なることが明らかとなった 遺伝資源 遺伝的多様性 軍鶏 日本鶏 マイクロサテライト 多型 と近縁になる軍鶏が存在することが示され さらに沖縄 の軍鶏に固有の 系統が認められている このこと 日本鶏は現在 品種が天然記念物に指定されている我 から 軍鶏は従来説 よりも多元的な起源を有するものと が国の貴重な遺伝資源である 書誌学的 形態学的研究か 考えられる ら 現在の日本鶏の多くは地鶏 小国 軍鶏の 品種から 日本鶏品種間の遺伝的類縁関係については血液蛋白 酵 成立したとされている しかしながら それらの品種間 素型 や 多型 を用いた研究が行なわれてい の遺伝的類縁関係や品種内の遺伝的変異については現在で る による の解析から 軍鶏は も不明な点が多い 軍鶏は闘鶏目的に改良されてきた品種 多くの日本鶏品種と遺伝的背景を共有し ほとんどの日本 であるが 肉用品種や観賞用品種の作出にも用いられ 現 鶏は軍鶏に由来するとしている しかし この説は従来 存する多くの日本鶏品種の成立に関与した 観賞用では軍 説 とは大きく異なる 近年では 品種間の詳細な遺伝的 鶏を小型に改良した小軍鶏が知られる 比内鶏は肉用品種 類縁関係を調べるため 多型性に富むマイクロサテライト で 秋田県北部の地鶏と軍鶏の交雑により作出された 薩 摩鶏や声良の成立にも軍鶏が関与したとされている 軍鶏 は豆冠を有し 直立型の独特の体型を示す 声良の体型は は 座位の多型解析を行ない 書誌学的 形態学的研究か 軍鶏に類似する一方 薩摩鶏は小国に類似した体型を示 ら得られた品種成立の説 と比較的類似した系統関係を示 し 軍鶏の近縁品種にも多様な形態が認められる 軍鶏は す結果が得られている しかしながら これらの研究は主 江戸時代にタイおよびその周辺の東南アジア地域から渡来 に品種間の遺伝的類縁関係に言及するものがほとんどであ したとされてきた しかしながら ミトコンドリア 領域の塩基配列の解析から中国東部在来鶏 が名古屋種と尾長鶏で報告しているのみである そこで本
岡 孝夫
高橋幸水
野村こう
花田博文
天野 卓
秋篠宮文仁
論 文 要約 キ ワ ドは じ め に
マイクロサテライト
多型情報に
もとづく日本鶏 特に軍鶏および
その近縁品種の遺伝的多様性と集団構造
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DNA
0+, ++ +, 0 1 2 3 +* , -+ + . , - / / + + ,, / ,* ,, 1 ,-2 ,* 0 3 +,, ,2 +, +1 -.*+
ῌ本研究で用いた供試鶏 が メント解析はサイズスタンダ ド で 分の後 秒 研究では 軍鶏およびその近縁品種 矮鶏の地域集団を含 目的領域の増幅後 オ トキャピラリ シ クエンサ めた分析を行なうことで 品種間の遺伝的類縁関係および 品種内に生じた遺伝的差異を明らかにすることを目的とし を用いてフラグメント解析を行なった フラグ た を基準とし 得られたデ タをもとに解析用ソ フトウェア を用 いて 産物のフラグメントサイズ 遺伝子型 を決定 軍鶏 集団 福島県と青森県 羽 小軍鶏 羽 比内 した 得られたデ タは に 鶏 羽 声良 羽 薩摩鶏 集団 茨城県と東京農業大 のフォ マットで記録した 学 以下東農大 羽 矮鶏 集団 千葉県と大分県 羽 計 集団 羽を用いた 各採取地からの供試羽数が 少ないため 小軍鶏は 地域集団を 薩摩鶏と矮鶏は各地 得 ら れ た 遺 伝 子 型 よ り 各 集 団 で 総 対 立 遺 伝 子 数 域集団で複数の内種を同一集団として解析を行なった 表 平均対立遺伝子数 対立遺伝子数をサン 抽出は標準的なフェノ ル クロロフォルム プル数で補正した を算出した 次 法 にて行なった 抽出後の は分光光度計にて濃度 に各集団の遺伝的多様性を評価するため ヘテロ接合体率 測定を行ない に調整して以下の実験に用いた の観察値 と期待値 および近交係数 を算 出した 集団内および集団間の近親交配の程度は の 統計量 にて求めた および の算出には を 本研究では の推奨する 座位のマイクロ 近交係数および 統計量の算出と からの偏りの有 サテライトマ カ を用いた これらは大型染色体 対 意性の検定には プログラム を用いた のうち 番から 番染色体 微小染色体のうち 対をカ 集団間の遺伝的分化の程度はペアワイズ 集団間お バ するように設計されたもので 同一染色体上のマ よび個体間の遺伝距離はそれぞれ遺伝距離 と カ 間には十分な距離があり マ カ 間の連鎖は報告さ を求めた 求めた遺伝距離をもとに 近隣結合法 れていない 反応には 法 にて系統樹を作成した ペアワイ を用いて の反応系 鋳型 ズ の算出には プログラム 遺伝距離 各 プライマ ペア各 の算出には プログラム 遺伝距離 の算出 ポリメラ ゼ および付属 には 系統樹の作成には の バッファ パッケ ジ の プログラムを用いた は 分 分を サイクル 次 いで 分の反応を行なった 多くの個体で増幅が認められなかった 座位 と非特異的増幅が多く認められた 座位を除く 座位のデ タを用い 解析を行なった 解析に用いた全 座位で多型が検出され 個の対立遺伝子が認められた 各集団で算出した対立遺伝子レベルの遺伝的多様性の尺度 を表 に示した 対立遺伝子数においては が が であり いずれも声良が 低く 矮鶏 集団が高い値を示した また 声良は 座位 中 座位で多型が認められなかった 薩摩鶏は とも類似した値を示した一方 軍鶏では が より低い値を示した は矮鶏 集団と同程度 の高い多様性を示した一方 は小軍鶏 比内鶏 薩摩 鶏と同程度の値を示し 同一品種であっても集団により多 様性の程度に差が認められた 次に 遺伝子頻度から算出した各集団の および を表 に示した と はそれぞれ であった 対立遺伝子レベルの多様性と同じく 声良が低く 軍鶏や 矮鶏が高い値を示す結果となった また 小軍鶏や薩摩鶏 表 供試鶏 デ タ解析 法による目的領域の増幅およびフラグメント 解析 日本鶏品種間の遺伝的多様性の比較
材料および方法
結
果
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ABI PRISM - Genetic Analyzer Applied Bio-systems
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GeneMapper . Applied Biosystems PCR
Microsoft Excel Microsatel-lite Toolkit
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-m m m ῌ ῌ集団における対立遺伝子レベルの遺伝的多様性 集団におけるヘテロ接合体率および近交係数 集団間のペアワイズ 右上 および遺伝距離 左下 の地域集団間では 間で 矮鶏は と の差が大きく も有意な値を示した 集団はそれぞれクラスタ を形成した 軍鶏およびその近 の 統計量は 全集団にお 縁品種とは遺伝的背景が異なる矮鶏は のブ トスト ける個体間の近交係数 が 集団間の分化 ラップ値にて他から明確に区別された また 軍鶏 集団 の程度を示す が 分集団内における個体 と小軍鶏 薩摩鶏 集団もそれぞれ のブ トスト 間の近交係数 が であり いずれの値も有 ラップ値で他とは区別された 一方 その他の分岐に対す 意に から偏ったものであった るブ トストラップ値は と低い値を示した 声 良と薩摩鶏は両品種とも軍鶏と小国を基礎として成立した 品種であるが 系統樹においては明確に区別された 軍鶏 各集団間の遺伝的分化の程度を示すペアワイズ およ と地鶏を基礎として成立した比内鶏も同様に 他から明確 び集団間の遺伝距離 を算出し表 に示した 集団間の に区別される結果となった ペアワイズ は 本研究で用いた全 個体について 座位の遺伝子型 であった 本研究で用いた 品種 から遺伝距離 を算出し 法にて系統樹を作成した すべての間で有意な値が認められた 同一品種 図 系統樹において 同一品種では薩摩鶏を除 いてクラスタ を形成する結果となった 軍鶏 集団と小 間で であり 矮鶏の地域集団間 を 軍鶏はそれぞれサブクラスタ を形成した 小軍鶏は茨城 除いていずれも有意な値であった 遺伝距離 県の 羽と愛媛県の 羽がさらに分かれる傾向が認められ は であり ペ た 一方 矮鶏 集団は明確な差異が認められず つのク アワイズ と同様の傾向が認められた ラスタ に 集団由来の個体が混在する結果となった ま 集団間の遺伝的類縁関係を明らかにするため 遺伝距離 た 内種による差異も認められなかった 薩摩鶏は採取地 をもとに 法にて無根系統樹を作成した 図 および内種により大きく つのサブクラスタ が認められ 系統樹の樹形はペアワイズ の値を支持するも る結果となった また 東農大白笹集団 羽は他の 羽と のであった 軍鶏 集団と小軍鶏 矮鶏 集団 薩摩鶏 は離れて位置していた 表 表 表 日本鶏品種間の遺伝的類縁関係 ῐ ῑ ῐ ῑ ῒ ῒ ῍ ῐ ῌ ῑῌ ῍ ΐ ῍ ῌ ῍ ΐ ῍ ῍ ΐ ῍ ῌ ῍ ῐ ῑῌ ῏ ῌ ῍ ῌ ῍ ῌ ῌ ῐ ῒ ῍ ῑ῏ ῍ ῐ ῒ ῍ ῑ ῌ ῍ ῐ ῑῌ ῐ ῑῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῐ ῒ ῑ ῌ ῐ ῑῌ ῐ ῒ ῑ῏ ῐ ῒ ῑ ῍ ῌ ῍ ῍ ῌ ῌ ῍ ῍ ῌ ῐ ῑῌ ῌ ῍ ῌ ῍ ῍ ῌ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῌ ῌ ῌ ῌ ST A A F I T O E IS IT ST IS ST A C O ST AS AS C O A C O ST A A ST EIR OCKERHAM
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日本鶏 品種間の 遺伝距離に基づく 系統樹 全 個体間の 遺伝距離にもとづく 系統樹 枝上の数字はブ トストラップ値 薩摩鶏は赤笹 白笹 矮鶏は千葉 大分 で示した 同じ軍鶏系品種について 座位の分析を行なった では 軍鶏の が が 差が大きく 有意な を示した これらの 品種は複数 の地域集団や内種を つの集団として分析したものであ り この結果は各地域集団や内種により近親交配が生じて 本研究で分析した 品種 集団において 軍鶏 集団と いることを示すものと考えられた 矮鶏 集団が高い遺伝的多様性を示し 他の 品種 集団 はそれに比べて低い値を示した 小軍鶏は軍鶏を矮小化し た品種とされているが 領域の分析から となり 本研究よりも高い値を示した は愛 その成立には他品種の関与が示唆されている また 比 好家所有の軍鶏 集団 各 羽 を分析しており 試験場 内鶏は地鶏と軍鶏が 薩摩鶏と声良は小国と軍鶏が成立に で維持されている集団を分析した本研究と異なる結果に 関与したとされている 一般的に 遺伝的に離れた集団 なったものと考えられた 小軍鶏 比内鶏 薩摩鶏 声良 の交雑により生じた集団の遺伝的多様性はもとの集団と比 も同様であった 遺伝的多様性の値はいわゆる在来鶏 放 べて高くなるとされる 岡ら はマイクロサテライト 飼鶏 よりも低い値を示し 明確に品種化された商用 多型の解析から純系会津地鶏と純系に白色プリマスロック 品種 に近いものであった を交雑した大型会津地鶏 さらにロ ドアイランドレッド を交雑した肉用会津地鶏において は純系 大型 肉用としている しかしながら本研究では交雑に 系統樹 図 より 軍鶏と小軍鶏は つのクラ より作出されたとされる 品種 スタ を形成した 小軍鶏の成立には他品種の関与も示唆 は純系の軍鶏よりも低い値を示した これらの品種は江戸 されているが 本結果からは成立に他品種が関係してい 時代に作出された後 品種の特徴を維持するために他の集 る薩摩鶏 声良 比内鶏よりも軍鶏の遺伝的寄与が大きい 団から隔離され 小集団で維持されてきたため 遺伝的多 ことが示された 声良 薩摩鶏 比内鶏は軍鶏とは明確に 様性が低下したものと考えられた 声良は三大長鳴鶏 声 区別された これはいずれも軍鶏を基礎として成立してい 良 唐丸 東天紅 の一品種であり より長く 良い声で るものの 声良と薩摩鶏には小国が 比内鶏には地鶏が関 鳴くように強い選抜 淘汰を受けたため 比内鶏は食用で 与しているとされ その遺伝的背景が異なることが原因 ある比内地鶏の作出のための育種選抜が行われているた と考えられた また 軍鶏と小国から派生した薩摩鶏と声 め 遺伝的多様性が低くなったと考えられた 特に声良 良も遺伝的に離れて位置した 両品種の体型を比較する は精液性状の悪化や孵化率の低下が報告されており 本 と 薩摩鶏は尾羽が豊かな小国型の体型を示し 声良は直 研究で示された遺伝的多様性の低下や近親交配の影響を裏 立した軍鶏型の体型を示す このことから 成立に関与し 付けるものと考えられた 逆に 軍鶏や矮鶏は日本のみな た各品種の遺伝的寄与の程度が異なることがこの原因と考 らず東南アジアから東アジア地域を中心に世界中で広く飼 えられた 育され 日本のものも多起源であると考えられている は 領域の解析より そのため 現在でもその遺伝的多様性を維持しているもの 声良を含む長鳴鶏は日本鶏の古い系統の つであるとし と考えられた さらに小軍鶏 薩摩鶏 矮鶏は と の 多くの日本鶏の成立に関与したとしている 一方 本研究 図 図 日本鶏品種間の遺伝的多様性の比較 日本鶏品種間の遺伝的類縁関係
考
察
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本研究結果 左 および 右 における 系統樹の樹形の比較 本研究結果は図 と同じデ タを用いて矮鶏 集団を アウトグル プとして示したもの などによる遺伝的偏りの程度を示すものである 日本鶏と ベトナム ジンバブエ在来鶏の比較より いずれも から 有意に異なる の値が得られたことより なんらかの遺 伝的集団構造が存在することが示された しかしながら の値よりその分集団間に生じた遺伝的分化の程度は日 本鶏と在来鶏で差が認められた すなわち 日本鶏は全体 の遺伝的多様性の が集団間に偏在し 高い分化の程 度を示したのに対し 両在来鶏の集団間には と しか偏在せず 多様性の大部分は集団内に偏在する分化の 程度の低い集団であることを示すものであった さらに で分化の程度が非常に高いとされている ことか らも本研究で用いた軍鶏および近縁品種の遺伝的分化の程 度は高いと考えられた さらに 有意かつ正の の値か ら 日本鶏とベトナム ジンバブエ在来鶏の分集団内に遺 伝的な偏りが生じていることが示されたが その程度は日 本鶏の方が高いものであった これらの結果はいずれも や など マイクロサテライトマ カ を用 本研究で用いた集団は明確な品種や地域集団や内種と認識 いた研究結果 図 では 声良は他の軍鶏の近縁品種とク され 集団間の遺伝的交流が少ない状態で遺伝的分化が急 ラスタ を形成する結果が得られた の塩基置換 速に進んだことが原因と考えられた 速度は もっとも速い 領域でも 万年あたり 系統樹 図 より 地域集団を分析した 品種 程度とされている そのため 塩基配列情報は長期的 軍鶏 薩摩鶏 矮鶏 において異なる樹形が得られた 軍 に見た渡来経路の推定 には適しているが 日本鶏品種間 鶏は各地域集団 福島県と青森県 由来の個体が異なるク の類縁関係の推定にはマイクロサテライト多型のような遺 ラスタ を形成した この傾向は小軍鶏でも認められ 茨 伝子頻度情報の方が適しているものと考えられた 城県の 羽と愛媛県の 羽の間にわずかながら遺伝的差異 は 座位を用いて軍鶏およびその近縁品 が認められた 薩摩鶏は地域集団 茨城県と東農大 に加 種のマイクロサテライト 多型解析を行なっている え 内種 赤笹と白笹 でも遺伝的差異が生じていた 一 で用いた マ カ は本研究で用いたマ 方 矮鶏は地域集団 千葉県と大分県 で明確な差異が認 カ と つが共通しており 同様にゲノムを幅広くカバ められず また内種による差異も認められなかった 岡ら できるように設計されたものである そこで本研究結果と は会津地鶏 および龍神地鶏 において 同一品種でも経 にて得られた 系統樹を比較した 図 時的に遺伝的差異が生じることを示している また マイ その結果 軍鶏と小軍鶏がクラスタ を形成し 次い クロサテライト 多型の解析から 名古屋種において で小国が成立に関与した品種 本研究では声良と薩摩鶏 同一品種内で 尾長鶏において内種間で 遺伝的分化が では声良 蓑曳 薩摩鶏 地鶏が成立に関与 生じていることが示された 本研究結果では 試験場にて した品種 比内鶏 が続くという共通の樹形を示した ま 小集団で維持されている軍鶏 集団間には明確な差異が認 た では声良は金八 八木戸などの軍鶏の小 められた この 集団間の遺伝的距離 は愛好家により 型品種とクラスタ を形成した このことからも 声良の 維持されている軍鶏 集団間から算出された値 よりも大 成立において軍鶏の遺伝的寄与は他の軍鶏系品種よりも高 きな値を示した また 図 において 小軍鶏個体間の遺 いものと考えられた 以上の結果 本研究で得られた品種 伝距離 は試験場で維持されている 個体間のほうが 間の遺伝的類縁関係は従来説およびマイクロサテライト 愛好家に維持されている 個体間よりも小さい値を示し 多型情報にもとづくこれまでの研究結果を支持する た このことから 同一品種地域集団間に生じる遺伝的差 ものと考えられた 異は飼育形態や飼育規模により左右されることが示され た 一方 矮鶏は 地域集団間で明確な遺伝的分化が認め られなかった これらのサンプルはいずれも 全日本チャ の 統計量は が が ボ保存会 所属の愛好家由来のものであり 地域を越えて が であった いずれも 本研究と 保存会所属会員間での遺伝的交流があったためと考えられ 同じマ カ を用いてベトナム在来鶏およびジンバブエ在 た 来鶏の多型解析を行なった と では はそれぞれ と と 本研究結果より 軍鶏を中心とする日本鶏品種間の遺伝 と いずれも であった は 的類縁関係は従来説をおおむね支持することが示された 全集団に含まれる個体間に生じた遺伝的偏り すなわち全 一方 品種内に生じる遺伝的分集団化には品種の維持形態 集団内の分集団 品種や地域集団 の存在を示し は分 やそれを取り巻く人的要因により その程度や分集団化の 集団間の遺伝的分化の程度を は分集団内で近親交配 単位が異なってくることが明らかとなった 図 日本鶏品種内の遺伝的差異 ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῏ ῐ ῏ ῐ ῌ ῎ ῎ ῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῌ ῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῏ ῐ ῍ ῍ ῌ ῌ ῍ ῏ ῐ ῍ ῌ ῍ ῏ ῍ ῍ ῐ ῌ ῍ ῏ ῐ ῌ ῍ ῌ ῌ ῏ ῐ ῌ ῍ ῏ ῐ ῌ ῍ ῏ ῐ ῍ ῍ ῌ ῌ ῍ ῏ ῌ ῍ ῐῌ ῍ ῍ ῍ ῏ ῍ ῍ ῍ ῍ ῐ῍ ῌ ῍ ῏ ῐ ῌ ῍ ῍ ῌ ῌ ῍ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ῍ ῌ ῌ ῍ ῌ ῑ ῍ ῒ ῍ ῍ ῏ ΐ ῐῌ ῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῏ ΐ ῐ ῌ ῌ ῍ ῍ ῏ ῐ ῍ ῍ ῍ ῌ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ A IT ST ST IS AS A A AS IT ST IS IT ST IS IT ST IS SMAN SMAN SMAN SMAN SMAN SMAN SMAN EIR OCKERHAM UC UCHADEYI O -NJ . . . . O mtDNA D-loop -NJ O DNA O O -NJ DNA O O DNA W and C . . . . C M . . . . . . . et al. D F F F F et al. D et al. et al. et al. D et al. et al. D D F F F F P et al. et al. F F F P F F F 1 -+ 1 ,2 , 1 1 ,- -, 1 ++ +, 1 1 1 ,3 -* + , * -- / , 0 * 2 * ,/ -+** + , -/ 1 ,* ,* / -, , , , / 1 , * .,0 * --/ * +-1 * *+ * *03 * *2. * *,0 * **2 * **. * *11 * */
-小穴 彪 日本鶏の歴史 日本鶏研究社 東京 貴重な日本鶏サンプルを提供していただきました福 島県農業総合センタ 畜産研究所 青森県産業技術セン タ 畜産研究所 茨城県畜産センタ 養鶏研究室 愛媛県 農林水産研究所畜産研究センタ 養鶏研究所 全日本チャ ボ保存会に厚く御礼申し上げます 引用文献 謝辞 ῑ ῑ ῑ ῐ ῑ ῎ ῍ ῎ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῍ ῍ ῍ ῍ ῌ ῏ ῏ ῏ ῏ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ HTA AMBROOK USSELL
OFFMAN ARSAN ARKER OTHRAN ANOTTE ENSTRA ILAN EIGEND IMIANER
ARK KA NO OMURA AWASHIMA UWAYAMA
ANADA MANO AKADA AKAHATA AYASHI KISHINONOMIYA
EIR OCKERHAM OMIYAMA KEO OJOBORI
OUDET KADA AMAMOTO ASHIGUCHI TO
OUDET OMIYAMA KEO ATENO OJOBORI
EI AJIMA ATENO
AKAHASHI IRASAWA AGAMINE SUDZUKI
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IDD AVALLI FORZA AITOU EI
SMAN EKINO ISHIBORI AWAMOTO INOSHITA AMAMOTO SUDZUKI
ELSENSTEIN SMAN EKINO ISHIHATA AKENAKA
INOSHITA UWAYAMA ISHIBORI AMAMOTO SUDZUKI
ADANO EKINO ISHIBORI SUDZUKI
ADANO ISHIBORI MAMURA ATSUZAKI INOSHITA IZUTANI AMIKAWA SUDZUKI
ADANO ISHIBORI SUDZUKI
ADANO ISHIBORI SUDZUKI
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F The Journal of Heredi-Japanese Poultry Science
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The Journal of Heredity
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The Journal of Poultry Science
Asian-Australasian Journal of Animal Science
Poultry Science Animal Genetics Animal Genetics Animal Genetics a laboratory manual. +33-,**+ +. ,**. ++ +0 ,**. +/ ,**. + +3/+ # , ,**+ ,**1 +0 +32. ,21 ,3-+-/2 +-1* - ,**-+1 ,**+ +3/ ,*, , 3 -. +32. +33/ + , -+2 -,3 .2/ .20 / ,**. +2 +32-+0 ,+ +/- +1* 0 +3 +332 +33. .// ./1 /.- /.0 ,* +321 1 ,**. .*0 .,/ ,+ ,, +33-3. +*3 - / 2 ,**0 +-03 +-12 3 ,**1 .0* .03 +* ,**2 1+ 12 ++ ,**2 /01 /1+ +, ,**3 # 323 33, + -,3 -2 -2 -+1 ,+ 20 +3 ---02 23 . .+ +3 20 -3 -3 .* 岡 孝夫 井野靖子 野村こう 花田博文 天野 卓 山内 克彦 小林雄治 泉田和子 西堀正英 山本義雄 秋篠宮文 仁 マイクロサテライト 多型による会津地鶏の 遺伝的多様性と遺伝的位置 日本家禽学会誌 野口純子 韮澤圭二郎 秋田県における家禽遺伝資源 の探索と収集 動物遺伝資源探索調査報告 ῑ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῐ ῑ ῎ ῍ ῍ ῑ ῍ ῐ ῑ ῎ ῍ ῍ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ
ERTHOULY EROY HU AN OANG HANH ED OM RONG GUYEN U HI ONICAT IXIER OICHARD ERRIER AILLARD OGNON
ANDEY ANTIA UMAR ISHRA HAUDHARY IJH
ADANO ISHIBORI AGASAKA SUDZUKI
ROWN EORGE ILSON
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shington, Seat-tle. DNA . . B , C., L , G., N V T., H T , H., B ’H , B., T N , B., V C , C., M , F., T -B , M., V , E., M , J.C. and R X. ( ) Genetic analysis of local Vietnamese chickens provides evidence of gene flow from wild to domestic populations. , .
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Asian-Australasian Journal of Animal Science
Poultry Science
Proceed-ings of the National Academy of Science of the United States of America ,-,**2 0+ 0/ ,. +332 .+ /* ,/ ,**3 + 2 ,0 ,**, +/-0 +/., ,1 ,**1 ,-*+ ,-*2 ,2 +313 +301 +31+ ,3 ./ 2 +* ++ 20 10
岡 孝夫 井野靖子 高橋幸水 野村こう 花田博文 天野 卓 寒川 清 秋篠宮文仁 マイクロサテライト 多型情報にもとづく龍神地鶏の遺伝的多様性 東京農 業大学農学集報 ῏ ῏ ῏ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῎ ῏ ῍ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ
EIGEND OLLNY ALLOUX UGON OULIN UCHADEYI DING OLLNY ROENEVELD
AKUZA HAMSELDIN IMIANER EIGEND
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Animal Genetics ,**0 -+ ,**, # 3+, 3,* +// +0/ -* -, ,**3 ,**1 -0- -01 --, --3 / ++ /--2
A
(Received May , /Accepted July , )
* Former : Department of Human and Animal-Plant Relationships, Faculty of Agriculture, Tokyo University of Agriculture ** Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Tokyo University of Agriculture
*** Professor emeritus, Tokyo University of Agriculture **** Visiting professor, Tokyo University of Agriculture
KA AKAHASHI OMURA ANADA
MANO KISHINONOMIYA
: is a breed of Japanese native chicken that has been used to establish various modern Japanese native breeds. However, genetic relationships among the breeds derived from the and their genetic population structure is unclear. In this study, microsatellite DNA polymor-phisms were used to analyze the genetic relationship among and its related breeds. A total of
individuals of six breeds (nine populations),
and were used for the analyses of the loci recommended by ISAG/FAO. In the results, low genetic diversity was observed even in the breeds established by crossbreeding, because of artificial selection and maintenance of these breeds. In particular, the which had monomorphic loci, demonstrated the lowest diversity amongst the six breeds. Genetic relationships of these popu-lations were supported by the established theories of their genetic histories. In the phylogenetic tree analysis, local populations of the same breeds were located in the same cluster. However, the star-like topology of the tree showed a high and significant genetic di erentiation in each population with the exception of two local populations of the The degree of genetic di erentiation was esti-mated from local populations of and A high and significant genetic dif-ferentiation was observed in two local populations of the In addition, in the no genetic di erentiation was observed, not only between local populations but also amongst plumage varia-tions. In the di erentiations were observed among local populations and plumage variation. In conclusion, the results of this study showed that the degree of genetic di erentiation and the unit of population segmentation were influenced by the manner in which the breeds are managed and human factors.
: Genetic diversity, genetic resource, Japanese native chicken, microsatellite DNA poly-morphisms, and its related breeds
By
Takao O
*, Yukimizu T
**, Koh N
**, Hirofumi H
**,
Takashi A
*** and A
Fumihito****
Genetic Diversity and Population Structure of
Shamo and Its Related Breeds of Japanese
Native Chicken based on Microsatellite
DNA Polymorphisms
Shamo
Shamo
Shamo
Shamo, Ko-Shamo, Hinai-dori, Koeyoshi, Satsuma-dori, Chabo,
Koeyoshi,
D
Chabo.
Shamo, Satsuma-dori, Chabo.
Shamo. Chabo, Satsuma-dori, Shamo Summary Key words ,* ,*+* ,- ,*+* +,, ,2 +, # # # # #
