基礎と実習 バイオインフォマティクス(補足-Ⅲ)
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・ ・・ ・実習実習実習実習でででで使用使用 する使用使用するするするデータデータデータデータ 第1,2,5,6章の実習において使用するデータを,それぞれ,CD-ROM の中の Chapter1,Chapter2,Chapter5,Chapter6 という名前のフォルダ(ディレクトリ)に 収 め て あ る . 使 用 方 法 は 各 章 の 実 習 の 項 目 を 参 照 の こ と . こ の デ ー タ は , MacOSX , Windows(Cygwin 含む),Linux(Knoppix 含む)などの環境で使用できる. ・ ・・
・タンパクタンパクタンパクタンパク 質複合体予測質複合体予測質複合体予測質複合体予測システムシステムシステム GreenPepperシステムGreenPepperGreenPepperGreenPepper
第 8 章で紹介しているソフトウェア GreenPepper を,CD-ROM の中の GreenPepper という名前のフォルダ(ディレクトリ)に説明書とともに収めてある.CD-ROM 内の説明 書,および,本文第 8 章の実習の項目にある使用方法を参照のこと.PC/AT 規格パソコン 上の Redhat linux 7.X, 8.0, 9.0,Knoppix3.4 で動作確認済み.Windows,Macintosh に は非対応である.
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・KKKKnoppixnoppixnoppix noppix
Knoppix はインストールせずに CD-ROM から立ち上げて手軽に使える linux である. PC/AT 規格パソコン(Windows で使われるパソコン)でのみ動作する. Macintosh では 使用できない. ブート可能な CD-ROM ドライブに CD-ROM を入れてパソコンを再起動することで, CD-ROM から起動させる.数分程度で Knoppix が立ち上がり,その状態ですでにユーザ ー名:knoppix として login した状態になっている. UNIX のコマンドを入力するためのウィンドウを出すには,画面最下段のアイコンの中 のディスプレイのアイコン(「ターミナルプログラム」アイコン)をクリックする.UNIX のコマンドについては第1章を参照すること. プログラムを書くために必要なエディタ(文書作成ソフト)を使うためには,画面最下 段一番左のKマークのついた「アプリケーションを起動」アイコンをクリックして,出て くるメニューの中から「エディタ」を選ぶとエディタのリストが出てくるので,その中か ら好みで選ぶ.たとえば NEdit はふつうのワープロ感覚で使えるので,初めてでもすぐに 使い方に慣れるであろう.注意点として,knoppix は CD-ROM だけで動くことを目的と しているため,ファイルを作成(保存)してもパソコンの電源を落としたら消えてしまう ので,その点はあらかじめ認識して使用すること.ハードディスクや外部記憶媒体に保存 する方法はあるので,興味があれば knoppix 関係の本やインターネット上の情報を参照す ること. 実習で使用するソフトウェアを Knoppix 上でインストールする際に参考となるように, より詳しいインストール手順の説明文 how_to_install.html を CD-ROM に添付したの で役立ててほしい.説明文を見るには,ターミナルを開いて(「ターミナルプログラム」ア イコンをクリックして)how_to_install と入力する.または,Knoppix の画面上にある CD-ROM アイコンをクリックして,開くウィンドウの中の how_to_install.html をクリッ クする.