• 検索結果がありません。

Tai マッピングの根無し木への拡張

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

シェア "Tai マッピングの根無し木への拡張"

Copied!
6
0
0

読み込み中.... (全文を見る)

全文

(1)

Tai

マッピングの根無し木への拡張

Enhanced Tai Mapping to Unrooted Trees

芳野拓也

1

平田耕一

2

Takuya Yoshino

1

Kouichi Hirata

2

1

九州工業大学情報工学府情報工学専攻

1

Graduate School of Computer Science and Systems Engineering,

Kyushu Institute of Technology

2

九州工業大学情報工学研究院

2

Department of Artificial Intelligence, Kyushu Institute of Technology

Abstract: In this paper, we enhance a Tai mapping to unrooted trees, motivated by the 4-point condition and the 3-4-point condition for phylogenetic trees. First, we introduce 4- 4-point-preserving mapping, rooted 4-point-4-point-preserving mapping and 3-point-4-point-preserving mapping, addi-tionally subtree-preserving mapping, center-preserving mapping and and path-preserving mapping as a bijection of nodes in two unrooted trees. Then, we show that, for rooted trees, a constrained mapping coincides with a 3-point-preserving mapping and a less-constrained mapping coincides with a 4-point-preserving mapping and a rooted 4-point preserving mapping. We also show that, for unrooted trees, a subtree-preserving mapping is always center-preserving, a center-preserving mapping is always 4-point-preserving and a 4-point-preserving mapping is always path-preserving, but no converse directions hold in general.

1

はじめに

2 つの根付き木 (rooted tree) 間の Tai マッピング (Tai mapping) [8] は, 単射であり, かつ, 先祖子孫関係 を保存する (根付き順序木の場合はさらに兄弟関係を保 存する) ノード間の対応付けである. この Tai マッピン グは, マッピングによる対応付けがあるノードを置換, 対応付けがない木のノードを削除と挿入とみなすこと で, 2 つの根付き木間の Tai マッピングの最小コストが 木編集距離 (tree edit distance) となることが知られて いる [8]. また, Tai マッピングに様々な制約を入れる ことで, 数多くの木編集距離の変種を導入することが でき [4, 5, 10, 11, 12], そのときの Tai マッピングが階 層を成すことも知られている [3, 9]. さらに, Tai マッ ピングは, 木カーネルの一種であるマッピングカーネ ル [2, 6] の定式化における数え上げの対象でもある. このように, 根付き木において Tai マッピングは木編 集距離や木カーネルとして重要な概念であるが, この Tai マッピングを根無し木 (unrooted tree) に拡張する ためには, 単射であることに加えて, 先祖子孫関係に代 わる条件を導入する必要がある. Zhang ら [12] は, 挿 連絡先:九州工業大学情報工学府情報工学専攻       〒 820-8502 福岡県飯塚市川津 680-4        E-mail: [email protected] 入と削除を次数 2 以下のノードに制限した次数 2 距離 (degree-2 distance) を根無し木に拡張する際, 根付き木 の LCA 保存マッピングの拡張として, 3 つのノードの 中心 (center) を保存する中心保存マッピング (center-preserving mapping) を導入した. ここで, 3 つのノー ドの中心とは, 2 つのノード間の 3 つのパスの共通ノー ドである. 本研究では, この中心に着目する. 生物種の進化を表す進化系統樹 (phylogenetic tree) [7] は, 葉に生物種のラベルが付いた根無し木もしくは根付 き木である. この進化系統樹の再構成とは, すべての生 物種 (葉) 間の距離が距離行列として与えらえれたとき, その距離がパス上の辺の重みの総和となる進化系統樹 を求める問題である. 距離行列から進化系統樹を再構成できるとき, 距離 行列は加法的である (additive) といい, 距離行列から 葉の高さがすべて等しい根付き進化系統樹を構成でき るとき, 距離行列は超計量的である (ultrametric) とい う [7]. このとき, 距離行列における任意の異なる 4 つ の生物種が 4 点条件 (4-point condition) [1] を満たす とき, そのときに限り, 距離行列は加法的となる [7]. ま た, 加法的距離行列における任意の異なる 3 つの生物 種が 3 点条件 (3-point condition) を満たすとき, その ときに限り, 距離行列は超計量的になる [7]. この 4 点条件と 3 点条件は, 辺の重みの総和としての 人工知能学会研究会資料 SIG-FPAI-B502-16

(2)

距離についての条件である. 本論文では, この 2 つの条 件を, 中心を用いることで木のトポロジーを特徴づける 条件に変更する. ノード u, v, w の中心を c(u, v, w) とす る. 根無し木のノード u, v, w, x が c(u, v, w) = c(u, v, x) かつ c(u, w, x) = c(v, w, x) を満たすとき, ノードの 2 つの組 (u, v) と (w, x) は 4 点条件を満たすという. ま た, 先祖子孫関係≤ に対して, 根 r を持つ根付き木の ノード u, v, w が c(u, w, r) ≤ c(v, w, r) = c(u, v, r) を 満たすとき, (u, v, w) は 3 点条件を満たすという. 根無し木 T1と T2に対して, M⊆ V (T1)× V (T2) を 単射とする. M に 4 点条件と 3 点条件を保存するとい う条件を加えることによって, 4 点保存マッピング (4-point-preserving mapping), 根付き 4 点保存マッピン グ (rooted 4-point-preserving mapping), 3 点保存マッ ピング (3-point-preserving mapping) を導入する. また, M が T1の部分木と T2の部分木を対応付ける とき M を部分木保存マッピング (subtree-preserving mapping) という. また, M が T1, T2のパスを対応付 けるとき, M をパス保存マッピング (path-preserving mapping) という. これらの準備の下で, 本論文では, M が根付き木の マッピングの場合, 以下が成り立つことを示す. M は制限 (constrained) マッピング [10, 11] ⇐⇒ M は 3 点保存マッピング. M は劣制限 (less-constrained) マッピング [4] ⇐⇒ M は 4 点保存マッピング ⇐⇒ M は根付き 4 点保存マッピング. また, M が根無し木のマッピングの場合, 以下の含意が 成り立つことを示す. ただし, 一般に逆は成り立たない. M は部分木保存マッピング =⇒ M は中心保存マッピング =⇒ M は 4 点保存マッピング =⇒ M はパス保存マッピング.

2

準備

閉路を持たない連結グラフを木という. 木 T = (V, E) に対して, v∈ V (T ) を単に v ∈ T と表す. 木 T のうち, 根ノード r ∈ T を 1 つ選んだものを根 付き木, そうでないものを根無し木という. 根付き木 T の根を r(T ) と表す. T = (V, E) を木とする. u, v ∈ T に対して, V′ = {v1, . . . , vn}, E′ = {(vi, vi+1) | 1 ≤ i ≤ n − 1}, v1 = u, vn = v を満たす木 (E′, V′) を u から v へのパスとい い, [u, v] で表す. u, v, w∈ T に対して, [u, v], [v, w], [w, u] に共通するノードを{u, v, w} の中心 [12] といい, c(u, v, w) で表す. V′ ⊆ V , E ⊆ E, T = (V, E) とする. すべ ての u, v∈ V′に対して u から v へのパスが T’ 中に存 在するとき, T′を T の部分木という. 特に, 根付き木 T の根を r とするとき, ノード v(∈ T \ {r}) に対して, [r, v] 上の v に隣接するノードを v の親といい, par (v) で表す. また, [r, v]\ {v} のノード を v の先祖という. u, v∈ T に対して, v が u の親であ るとき, u を v の子という. 子を持たないノードを葉と いう. 本論文では, v が u の先祖であることを, u < v と表 し, u < v または u = v であることを, u ≤ v と表す. u, v ∈ T に対して, u ≤ w, v ≤ w であり, w′ < w な る w′が存在しないような w を u と v の最近共通先祖 (LCA) といい, u⊔ v で表す. 補題 1 根付き木 T の根ノードを r とし, u, v∈ T とす る. このとき c(u, v, r) = u⊔ v が成り立つ. ノード u, v ∈ T に対して, 先行走査順 pre に関し

て pre(u) ≤ pre(v) であり, 後行走査順 post に関して post (u)≤ post(v) であるとき, u を, v の左にあるとい

い, u ⪯ v と表す. 根付き木に対して, 兄弟間の左右の 順序関係が与えられているものを順序木, そうでないも のを無順序木という. アルファベット Σ の要素が各ノードに割り当てられ ているような木をラベル付き木という. また各ノード に割り当てられた記号をラベルといい, v∈ T のラベル を l(v) で表す. 最後に, 進化系統樹 [7] における 4 点条件と 3 点条件 を導入する. 本来の 4 点条件と 3 点条件の定義は辺の 重みの和によって定義されるが, 本稿では中心を用いる ことによって, (根の有無に関わらず) 木のトポロジー に基づいて定式化する. 定義 1 (4 点条件) 木 T の 2 組のノードの対 (u, v) と (w, x) に対して, c(u, v, w) = c(u, v, x) and c(u, w, x) =

c(v, w, x) が成り立つとき, その 2 組のノード対は 4 点

条件を満たすという.

図 1 (左) は, 4 点条件のトポロジーである. ここで, 実線はパス, c(u, v, w) = c(u, v, x) = c, c(u, w, x) =

c(v, w, x) = d である. 中心と 4 点条件は, 根付き木でも定義できる. 図 1 (右) はノード r を根とする根付き木における 4 点条件 のトポロジーである. 定義 2 (3 点条件) T を根付き木とし, その根ノード r とする. T のノードの 3 つ組 (u, v, w) に対して, c(u, w, r)≤ c(v, w, r) = c(u, v, r), すなわち u⊔ w ≤ v ⊔ w = u ⊔ v が成り立つとき, その 3 つ組は 3 点条件を満たすという. 図 2 は根付き木の 3 点条件のトポロジーである. 進化系統樹の再構成では, 以下の補題が知られている.

(3)

u w d v x r u v d w x 図 1: 根無し木 (左) および根付き木 (右) における 4 点 条件のトポロジー. r u w v 図 2: 根付き木における 3 点条件のトポロジー. 補題 2 (cf. [7]) 根無し木の任意の 4 つの異なる葉に対 して, 4 点条件を満たすような 2 組の対の取り方が存在 する. 補題 3 (cf. [7]) 根付き木の任意の 3 つの異なる葉に 対して, 3 点条件を満たすような 3 つ組の取り方が存在 する.

3

マッピング

本節では, マッピングを 2 つの木のノード間の一対一 対応として定義する. 定義 3 (マッピング [8]) T1, T2を木とし, M ⊆ V (T1)× V (T2) とする. M が以下を満たすとき, 3 つ組 (M, T1, T2) を木 T1, T2間のマッピングという: ∀(u1, u2), (v1, v2)∈ M ( u1= v1 ⇐⇒ u2= v2 ) (一対一対応). 誤解の恐れがない場合, 3 つ組 (M, T1, T2) を, 単に M で表す. また, 根付き木 (根無し木) 間のマッピングを 単に根付き (根無し) マッピングという. 定義 4 (Tai マッピング [8]) T1, T2を根付き木, M を T1, T2間の根付きマッピングとする. M が以下を満た すとき, M を T1, T2間の順序 Tai マッピングという: 1. ∀(u1, u2), (v1, v2)∈ M ( u1≤ v1 ⇐⇒ u2≤ v2 ) (先祖子孫関係の保存). 2. ∀(u1, u2), (v1, v2)∈ M ( u1⪯ v1 ⇐⇒ u2⪯ v2 ) (兄弟関係の保存). また, M が上記条件の 1 を満たすとき, M を T1, T2間 の無順序 Tai マッピングという. M が順序 Tai マッ ピングまたは無順序 Tai マッピングであるとき, M MTai(T1, T2) と表記する. また, 根付き木に関して, Tai マッピングの変種を導 入する. 定義 5 (根付きマッピングの変種 (1)) M を T1, T2間 の根付きマッピングとする. 1. M が以下を満たすとき, M をトップダウンマッ ピング [5] といい, M ∈ MTop(T1, T2) と表す. ∀(v1, v2)∈ M ( (par (v1), par (v2))∈ M ) . 2. M が以下を満たすとき, M を LCA 保存マッピ ング [12] といい, M ∈ MLca(T1, T2) と表す. ∀(u1, u2), (v1, v2)∈ M ( (u1⊔ v1, u2⊔ v2)∈ M ) . 3. M が以下を満たすとき, M を孤立部分木マッピ ング [9], もしくは 制限マッピング [10, 11] とい い, M∈ MIlSt(T1, T2) と表す. ∀(u(1, u2), (v1, v2), (w1, w2)∈ M, w1< u1⊔ v1 ⇐⇒ w2< u2⊔ v2 ) . 補題 4 根付き木 T1, T2と, A ∈ {Top,Lca,IlSt} に 対して, M ∈ MA(T1, T2) ならば, M ∈ MTai(T1, T2). 定義 6 (根付きマッピングの変種 (2)) M を T1, T2間 の根付きマッピングとする. 1. M が以下を満たすとき, M を劣制限マッピング [4] といい, M∈ MLess(T1, T2) と表す. ∀(u(1, u2), (v1, v2), (w1, w2)∈ M, u1⊔ v1< u1⊔ w1=⇒ v2⊔ w2= u2⊔ w2 ) . 2. M が Tai マッピングであり, 劣制限マッピングで あるとき, すなわち M ∈ MTai(T1, T2)∩ MLess(T1, T2) であるとき, M を劣制限 Tai マッピングといい, M ∈ MLessTai(T1, T2) と表す. 次に, 根無しマッピングの変種と, 4 点条件と 3 点条 件に関連した根付きマッピングの変種を導入する. 定義 7 (根無しマッピングの変種) M を T1, T2間の根 無しマッピングとする. 1. M が以下のパス保存条件を満たすとき, M をパ ス保存マッピングといい, M∈ MPath(T1, T2) と 表す: ∀(u(1, u2), (v1, v2), (w1, w2)∈ M, w1∈ [u1, v1] ⇐⇒ w2∈ [u2, v2] ) .

(4)

2. M が以下の中心保存条件 [12] を満たすとき, M を中心保存マッピングといい, M ∈ MCnt(T1, T2) と表す: ∀(u(1, u2), (v1, v2), (w1, w2)∈ M, (c(u1, v1, w1), c(u2, v2, w2))∈ M ) . 3. 集合{u ∈ T1| (u, v) ∈ M} と {v ∈ T2| (u, v) ∈ M} が, それぞれ T1= (V1, E1) と T2= (V2, E2) の部分木を誘導し, 任意の (u1, u2), (v1, v2)∈ M に対して, (u1, v1) E1 ⇐⇒ (u2, v2)∈ E2を満たすとき, M を部分 木保存といい, M ∈ MSubt(T1, T2) と表す. 4. M が以下の 4 点保存条件を満たすとき, M を 4 点保存マッピングといい, M ∈ M4Pnt(T1, T2) と 表す: 任意の (u1, u2), (v1, v2), (w1, w2), (x1, x2) M に対して, 以下を満たすように ui, vi, wi, xi (i = 1, 2) を置き換えることができる. c(u1, v1, w1) = c(u1, v1, x1) かつ c(u1, w1, x1) = c(v1, w1, x1) ⇐⇒ c(u2, v2, w2) = c(u2, v2, x2) かつ c(u2, w2, x2) = c(v2, w2, x2). また, 根付き木の 4 点保存条件を以下の通りに導入 する. 定義 8 (根付き 4 点保存条件) T1, T2をそれぞれ, r1, r2 を根とする根付き木, M を T1, T2間の根付きマッピン グとする. M が以下の根付き 4 点保存条件を満たす とき, M を根付き 4 点保存マッピングといい, M Mr4Pnt(T1, T2) と表す: 任意の (u1, u2), (v1, v2), (w1, w2) ∈ M に対して, 以下を満たすように ui, vi, wi(i = 1, 2) を置き換える ことができる. c(u1, v1, w1) = c(u1, v1, r1) かつ c(u1, w1, r1) = c(v1, w1, r1) ⇐⇒ c(u2, v2, w2) = c(u2, v2, r2) かつ c(u2, w2, r2) = c(v2, w2, r2). M が Tai マッピングであり, 根付き 4 点保存マッピ ングでもあるとき, すなわち, M ∈ MTai(T1, T2) Mr4Pnt(T1, T2) であるとき, M を根付き 4 点保存 Tai マッピングといい, M∈ Mr4PntTai(T1, T2) と表す. 定義 9 (3 点保存条件) T1, T2をそれぞれ, r1, r2 を根 とする根付き木, M を T1, T2間の根付きマッピングと する. M が以下の 3 点保存条件を満たすとき, M を 3 点保存マッピングといい, M ∈ M3Pnt(T1, T2) と表す: 任意の (u1, u2), (v1, v2), (w1, w2) ∈ M に対して, 以下を満たすように ui, vi, wi(i = 1, 2) を置き換える ことができる. c(u1, w1, r1)≤ c(v1, w1, r1) = c(u1, v1, r1) (u1⊔ w1≤ v1⊔ w1= u1⊔ v1と等価) ⇐⇒ c(u2, w2, r2)≤ c(v2, w2, r2) = c(u2, v2, r2) (u2⊔ w2≤ v2⊔ w2= u2⊔ v2と等価).

4

マッピングの階層

根付きマッピングには以下の階層が知られている.

MTop(T1, T2)⊂ MLca(T1, T2)⊂ MIlSt(T1, T2)

MLessTai(T1, T2)⊂ MTai(T1, T2). まず, 根付きマッピングの改装について議論する. 以 下, T1, T2を根付き木とする. 定理 1 M3Pnt(T1, T2) =MIlSt(T1, T2). [証明] M ∈ MIlSt(T1, T2) と仮定すると, M は w1 u1⊔ v1 ⇐⇒ w2≤ u2⊔ v2を満たす. このとき, M は 図 3 で示す M1, M2, M3のどれかの形をとる. このう ち, 3 点保存条件を満たすのは M1と M3である. また, uiを viと置き換えることにより, M2もまた, 3 点保存 条件を満たす. したがって, M ∈ M3Pnt(T1, T2) が成 り立つ. 一方, M ∈ M3Pnt(T1, T2) と仮定すると, M は u1 w1≤ v1⊔w1= u1⊔v1 ⇐⇒ u2⊔w2≤ v2⊔w2= u2⊔v2 を満たす. このとき, M は M1, M2′, M3のどれかの形 をとる. M2′について, w1≤ u1⊔v1 ⇐⇒ w2≤ u2⊔v2 が成り立つ. したがって, M ∈ MIlSt(T1, T2) が成り立 つ. 2 補題 5 M ∈ MTai(T1, T2)\ Mr4Pnt(T1, T2) となる根 付きマッピング M が存在する. 補題 6 M ∈ Mr4Pnt(T1, T2)\ MTai(T1, T2) となる根 付きマッピング M が存在する. 定理 2 M4Pnt(T1, T2) =Mr4Pnt(T1, T2) =MLess(T1, T2). [証明] M4Pnt(T1, T2) =Mr4Pnt(T1, T2) は自明に成り 立つ. 補題 1 より, 根付き 4 点保存条件を以下のように 書き換えることができる. c(u1, v1, w1) = u1⊔ v1かつ u1⊔ w1= v1⊔ w1 ⇐⇒ c(u2, v2, w2) = u2⊔ v2かつ u2⊔ w2= v2⊔ w2.

(5)

r 1 1 u1 w1 v 1 r 2 2 u2 w2 v 2 r 1 u 1 d 1 w1 v1 r 2 u 2 d 2 w2 v2 M1 M2 r1 v 1 d 1 w 1 u 1 r2 v 2 d 2 w 2 u 2 r 1 u1 w1 v1 r 2 u2 w2 v2 M2 M3 図 3: 定理 1 の証明に用いる根付きマッピング Mi. M ∈ Mr4Pnt(T1, T2) と仮定する. もし, u1⊔ v1 < u1⊔w1, ならば T1中の u1, v1, w1のトポロジーは, 図 4 (1), (2), (3) に示す通りになる. このとき (2), (3) では u1 < v1 or v1 < u1のどちらか一方が成り立つ. よっ て, c(u1, v1, w1) = u1⊔ v1 < u1⊔ w1 = v1⊔ w1が 成り立つ. 根付き 4 点保存条件より, c(u2, v2, w2) = u2⊔ v2及び u2⊔ w2 = v2⊔ w2が成り立つ. ゆえに, M ∈ MLess(T1, T2) が成り立つ. r1 d 1 1 u 1 v 1 w1 r1 d 1 v1 u 1 w1 r1 w 1 v1 u 1 r2 d 2 2 u 2 v 2 w2 (1) (2) (3) (4) r2 2 v 2 u 2 w 2 r2 w 2 v 2 u 2 r 2 2 u 2 v 2 w 2 (5) (6) (7) 図 4: 定理 2 の証明に用いる木のトポロジー. 逆に, M ∈ MLess(T1, T2) を仮定する. u1⊔ v1 < u1⊔w1とすると, 図 4 (1), (2), (3) より, c(u1, v1, w1) = u1⊔ v1及び u1⊔ w1= v1⊔ w1が成り立つ. 一方,M は 劣制限マッピングであるため, v2⊔ w2= u2⊔ w2が成 り立つ. そのため, c(u2, v2, w2) = u2⊔ v2を示せばよ いことになる. もし, u2⊔ v2< u2⊔ w2ならば, T2中での u2, v2, w2 のトポロジーは図 4 (4), (5), (6) に示す通りになり, c(u2, v2, w2) = u2⊔v2= c2が成り立つ. もし, u2⊔v2= u2⊔w2ならば, T2中での u2, v2, w2のトポロジーは図 4 (7) に示す通りになり, c(u2, v2, w2) = u2⊔ v2 = c2が 成り立つ. したがって, M∈ Mr4Pnt(T1, T2) が成り立つ. 2 注意 1 定理 2 のMr4PntTai(T1, T2) =MLessTai(T1, T2) を示すには, T1, T2のトポロジーを図 4 の (1), (4), (7) と比較すればよい. 次に, 根無しマッピングの階層について議論する. 以 下, T1と T2は根無し木とする. 補題 7 MSubt(T1, T2)⊂ MCnt(T1, T2). [証明] M ∈ MSubt(T1, T2) とし, (u1, u2), (v1, v2), (w1, w2)∈ M とする. このとき, T1の [u1, v1] ([v1, w1], [w1, u1]) と, T2の [u2, v2] ([v2, w2], [w2, u2]) は同型で あるので, (c(u1, v1, w1), c(u2, v2, w2)) ∈ M が成り立 つ. ゆえに, M ∈ MCnt(T1, T2) が成り立つ. 一方, 図 5 のようなマッピング M ∈ MCnt(T1, T2)\ MSubt(T1, T2) が存在する. 2 u 1 Æ u 2 Æ 1 Æ w 1 2 Æ w 2 v 1 Æ v 2 Æ 図 5: 補題 7 の根無しマッピング M . 補題 8 MCnt(T1, T2)⊂ M4Pnt(T1, T2). [証明] M ∈ MCnt(T1, T2) とし, (u1, u2), (v1, v2), (w1, w2), (x1, x2)∈ M とする. 補題 1 より, c1 = c(u1, v1, w1) = c(u1, v1, x1) かつ d1 = c(u1, w1, x1) = c(v1, w1, x1) を満たすように, u1, v1, w1, x1を置き換えることができる. もし (c1, c2)∈ M なる ノード c2 ∈ T2が存在するなら, c1 = c(u1, v1, w1) = c(u1, v1, x1) であり M が中心保存マッピングであるこ とから, c2 = c(u2, v2, w2) = c(u1, v1, x1) が成り立つ. また, (d1, d2)∈ M なるノード d2 ∈ T2が存在するな ら, d1= c(u1, w1, x1) = c(v1, w1, x1) であり M が中心 保存マッピングであることから, d2 = c(u2, w2, x2) = c(v2, w2, x2) が成り立つ. ゆえに, M ∈ M4Pnt(T1, T2) となる. 一方, 図 6 のようなマッピング M ∈ M4Pnt(T1, T2)\ MCnt(T1, T2) が存在する. 2 補題 9 M4Pnt(T1, T2)⊂ MPath(T1, T2). [証明] M ∈ M4Pnt(T1, T2) とする. このとき, すべ ての (u1, u2), (v1, v2), (w1, w2), (x1, x2)∈ M のトポロ ジーは T1, T2中で図 7 の通りになる. (y1, y2) ∈ M となる, y1 ∈ [c1, d1], y2 ∈ [u2, c2] を 仮定する. このとき, c(u1, v1, y1) = c(u1, v1, w1) = c1,

(6)

1 1 2 2 1 d 1 2 d 2 v 1 x 1 v 2 x 2 図 6: 補題 8 の M . u 1 w 1 1 d 1 v 1 x 1 u 2 w 2 2 d 2 v 2 x 2 T1 T2 図 7: 補題 9 の証明で用いる M のトポロジー. c(u2, v2, y2) = y2, c(u2, v2, w2) = c2が成り立つ. ゆえ に, y2= c2となる. (y1, y2) ∈ M となる, y1 ∈ [u1, c1], y2 ∈ [v2, d2] を 仮定する. このとき, c(y1, v1, x1) = c(y1, v1, w1) = c1, c(y2, v2, x2) = c(y2, v2, w2) = y2が成り立つ. ま

た, c(u2, y2, w2) = c(u2, y2, x2) = c2, c(u1, y1, w1) =

c(u1, y1, x1) = y1が成り立つ.

(y1, y2) ∈ M となる, y1 ∈ [u1, c1], y2 ∈ [w2, d2]

を仮定する. このとき, c(y1, v1, x1) = c(y1, v1, w1),

c(y2, v2, x2) = d2, c(y2, v2, w2) = y2が成り立つ. また,

c(u2, v2, y2) = c(u2, v2, x2), c(u1, v1, y1) = y1,

c(u1, v1, x1) = c1が成り立つ. ゆえに, y1= c1, y2= d2 となる. 上記の議論を組み合わせることにより, (y1, y2)∈ M に対して以下が成り立つ. ここで, k ∈ {u, v}, l ∈ {w, x} である. 1. y1∈ [c1, d1] iff y2∈ [c2, d2]. 2. y1∈ [u1, v1] iff y2∈ [u2, v2]. 3. y1∈ [w1, x1] iff y2∈ [w2, x2]. 4. y1∈ [k1, c1] かつ y2∈ [l2, d2] ならば, y1= c1 か つ y2= d2. 5. y1∈ [l1, d1] かつ y2∈ [k2, c2] ならば, y1= d1か つ y2= c2. したがって, M∈ MPath(T1, T2) となる. 一方, 図 8 のようなマッピング M ∈ MPath(T1, T2)\ M4Pnt(T1, T2) が存在する. 2 補題 7, 8, 9 をまとめると以下の通りになる. 定理 3 根無し木 T1, T2に対して, 以下が成り立つ. MSubt(T1, T2)⊂ MCnt(T1, T2) M4Pnt(T1, T2)⊂ MPath(T1, T2). 1 1 2 2 1 d 1 2 d 2 v 1 x 1 w 2 x 2 図 8: 補題 9 の M . 注意 2 操作的には,MTop[5] とMSubtは, 挿入と削除 を次数 1 のノード (根付き木の場合は葉, 根無し木の場 合は端点) に制限したものと対応する. また,MLca[12] と MCnt [12] は, 挿入と削除を次数 2 以下のノードに 制限したものと対応する.

参考文献

[1] P. Buneman: A note on the metric properties of trees, J. Comb. Theory (B) 17, 48–50, 1974.

[2] K. Hirata, T. Kuboyama, T. Yoshino: Mapping

ker-nels between rooted labeled trees beyond orderd trees,

New Frontier in Artificial Intelligence, LNAI 9067, 317–330, 2015.

[3] T. Kuboyama: Matching and learning in trees, Ph.D thesis, University of Tokyo, 2007.

[4] C. L. Lu, Z.-Y. Su, C. Y. Yang: A new measure of edit distance between labeled trees, Proc. CO-COON’01, LNCS 2108, 338–348, 2001.

[5] S. M. Selkow: The tree-to-tree editing problem, In-form. Process. Lett. 6, 184–186, 1977.

[6] K. Shin, M. Cuturi, T. Kuboyama: Mapping kernels

for trees, Proc. ICML 2011, 2011.

[7] W.-K. Sung: Algorithms in bioinformatics: A

prac-tical introduction, Chapman & Hall/CRC, 2009.

[8] K.-C. Tai, The tree-to-tree correction problem,

J. ACM 26, 422–433, 1979.

[9] J. T. L. Wang, K. Zhang: Finding similar consensus

between trees: An algorithm and a distance hierar-chy , Pattern Recog. 34, 127–137, 2001.

[10] K. Zhang: Algorithms for the constrained editing

dis-tance between ordered labeled trees and related prob-lems, Pattern Recog. 28, 463–474, 1995.

[11] K. Zhang: A constrained edit distance between

un-ordered labeled trees, Algorithmica 15, 205-222, 1996.

[12] K. Zhang, J. Wang and D. Shasha: On the editing

distance between undirected acyclic graphs, Internat.

参照

関連したドキュメント

Using the concept of a mixed g-monotone mapping, we prove some coupled coincidence and coupled common fixed point theorems for nonlinear contractive mappings in partially

Furuta, Log majorization via an order preserving operator inequality, Linear Algebra Appl.. Furuta, Operator functions on chaotic order involving order preserving operator

In this paper, the au- thor shall give a proof of a coincidence theorem for a Vietoris mapping and a compact mapping (cf. Definition 3.2) and prove the Lefschetz fixed point theorem

Because of this property, it is only necessary to calculate a small range of cohomology groups, namely the even dimension and the odd dimension of cohomology groups, in order

We show that for a uniform co-Lipschitz mapping of the plane, the cardinality of the preimage of a point may be estimated in terms of the characteristic constants of the mapping,

We shall dis- cuss among others: the convergence of Newton’s method; iterated function systems and how certain fractals are fixed points of set-valued contractions; the

Going back to the packing property or more gener- ally to the λ-packing property, it is of interest to answer the following question: Given a graph embedding G and a positive number

The classical Schwarz-Christoffel formula gives conformal mappings of the upper half-plane onto domains whose boundaries consist of a finite number of line segments.. In this paper,