High throughput screening (HTS)の
プロトコルとデータ集
GenomONE - Si
GenomONE-Si HTS-RT法 96-well plate HVJ-E ベクター 5 μL 試薬D 1 μL 10,000g(10,000~12,000rpm)・4℃で5分間遠心し、上清除去 緩衝液で再懸濁* 200 μL 以下、冷却した各試薬を室温条件下で調製
siRNA溶液(0.23μM final conc. 10nM) 5 μL
再懸濁HVJ-E* 5 μL 20倍希釈した試薬E 5 μL 細胞懸濁液の添加 100 μL 37℃・5%CO2 インキュベーターで培養
U-937
siRNA transfection
U-937へのEg5 siRNAの導入
Eg5 siRNA(50nM) transfection → 2days → WST-8 (細胞数測定, A450)
【Cell】: U-937(Human leukemic monocytic lymphoma cell line, ATCC:CRL-1593.2)
【Culture condition】:5×103cells/well/100μL, RPMI1640 medium with 10% fetal calf serum 【96-well plate】:IWAKI 1860-096 (Non-Treated)
【siRNA】:Silencer KIF11(Eg5) siRNA(Ambion Code No.AM4639) Negative control #1 siRNA(Ambion Code No.AM4639)
Eg5(KIF 11)はキネシン様モータータンパク質として、細胞分裂する際の紡錘体微小管を形成するために必須であり、その機能が阻害されると細胞分 裂の停止とアポトーシスが誘導される。その現象を利用してsiRNAの導入効果をWST-8法(生細胞数測定法)にて定量的に評価。 実験材料・方法 フリーダイヤル 0120-409-816 FAX : 06-6444-7183 E-mail : [email protected] URL:http://www.iskweb.co.jp/hvj-e 〒550-0002 大阪市西区江戸堀1丁目3番15号
石原産業株式会社
77%
GenomONE-Si
GenomONE-SiのHTS-RT法を用いてU-937にEg5 siRNAを導入したところ、77%のノックダウン効果が得られた。
一方、他の導入試薬を用いた場合は、十分な効果が得られず、GenomONE-Siの優位性が示された。
GenomONE-Si
HTS-RT法 96-well plate HVJ-E ベクター 5 μL 試薬D 1 μL 10,000g(10,000~12,000rpm)・4℃で5分間遠心し、上清除去 緩衝液で再懸濁* 200 μL 以下、冷却した各試薬を室温条件下で調製siRNA溶液(0.92μM final conc. 40nM) 5 μL
再懸濁HVJ-E* 5 μL 20倍希釈した試薬E 5 μL 細胞懸濁液の添加 100 μL 37℃・5%CO2 インキュベーターで培養
THP-1
siRNA transfection
THP-1へのEg5 siRNAの導入
Eg5 siRNA(50nM) transfection → 2days → WST-8 (細胞数測定, A450) 【Cell】: THP-1(Human acute monocytic leukemia cell line, ATCC:TIB-202)
【Culture condition】:2.5×104cells/well/100μL, RPMI1640 medium with 10% fetal calf serum 【96-well plate】:IWAKI 1860-096 (Non-Treated)
【siRNA】:Silencer KIF11(Eg5) siRNA(Ambion Code No.AM4639) Negative control #1 siRNA(Ambion Code No.AM4639)
GenomONE-SiのHTS-RT法を用いてTHP-1にEg5 siRNAを導入したところ、85%のノックダウン効果が得られた。
一方、他の導入試薬を用いた場合は、十分な効果が得られず、GenomONE-Siの優位性が示された。
実験材料・方法
85%
GenomONE-Si HTS-RT法 96-well plate HVJ-E ベクター 5 μL 試薬D 1 μL 10,000g(10,000~12,000rpm)・4℃で5分間遠心し、上清除去 緩衝液で再懸濁* 200 μL 以下、冷却した各試薬を室温条件下で調製
siRNA溶液(0.92μM final conc. 40nM) 5 μL
再懸濁HVJ-E * 5 μL
20倍希釈した試薬E 5 μL
細胞懸濁液の添加 100 μL
37℃・5%CO2 インキュベーターで培養
GenomONE-Si HTS-RT法 96-well plate
HVJ-E ベクター 5 μL
試薬D 1 μL
10,000g(10,000~12,000rpm)・4℃で5分間遠心し、上清除去
緩衝液で再懸濁* 200 μL
以下、冷却した各試薬を室温条件下で調製
siRNA溶液(0.92μM final conc. 40nM) 5 μL
再懸濁HVJ-E * 5 μL 20倍希釈した試薬E 5 μL 細胞懸濁液の添加 100 μL 37℃・5%CO2 インキュベーターで培養
Jurkat
siRNA transfection
JurkatへのEg5 siRNAの導入
Eg5 siRNA(50nM) transfection → 2days → WST-8 (細胞数測定, A450) 【Cell】: Jurkat clone E6-1(Human T cell leukemia cell line, ATCC:TIB-152)
【Culture condition】:2.5×104cells/well/100μL, RPMI1640 medium with 10% fetal calf serum 【96-well plate】:IWAKI 1860-096 (Non-Treated)
【siRNA】:Silencer KIF11(Eg5) siRNA(Ambion Code No.AM4639) Negative control #1 siRNA(Ambion Code No.AM4639)
Eg5(KIF 11)はキネシン様モータータンパク質として、細胞分裂する際の紡錘体微小管を形成するために必須であり、その機能が阻害されると細胞分 裂の停止とアポトーシスが誘導される。その現象を利用してsiRNAの導入効果をWST-8法(生細胞数測定法)にて定量的に評価。 実験材料・方法 フリーダイヤル 0120-409-816 FAX : 06-6444-7183 E-mail : [email protected] URL:http://www.iskweb.co.jp/hvj-e 〒550-0002 大阪市西区江戸堀1丁目3番15号
石原産業株式会社
77%
GenomONE-SiのHTS-RT法を用いてJurkatにEg5 siRNAを導入したところ、77%のノックダウン効果が得られた。
一方、他の導入試薬を用いた場合は、十分な効果が得られず、GenomONE-Siの優位性が示された。
GenomONE-Si
GenomONE-Si
HTS-RT法 96-well plate HVJ-E ベクター 5 μL 試薬D 1 μL 10,000g(10,000~12,000rpm)・4℃で5分間遠心し、上清除去 緩衝液で再懸濁* 200 μL 以下、冷却した各試薬を室温条件下で調製siRNA溶液(1.15/3, 1.15μM final conc. 50/3, 50nM) 5 μL
再懸濁HVJ-E* 5 μL 20倍希釈した試薬E 5 μL 細胞懸濁液の添加 100 μL 37℃・5%CO2 インキュベーターで培養
HeLa
siRNA transfection
GenomONE-SiのHTS-RT法を用いてHeLaにEg5 siRNAを導入したところ、50/3nMで65%、50nMで70%のノッ
HeLaへのEg5 siRNAの導入
Eg5 siRNA(50nM) transfection → 2days → WST-8 (細胞数測定, A450)
【Cell】: HeLa (Human cervical carcinoma cell line, ATCC:CCL-2)
【Culture condition】:4×103cells/well/100μL, DMEM medium with 10% fetal calf serum 【96-well plate】:IWAKI 3860-096 (Tissue culture Treated)
【siRNA】:Silencer KIF11(Eg5) siRNA(Ambion Code No.AM4639) Negative control #1 siRNA(Ambion Code No.AM4639)
実験材料・方法
70%
GenomONE-Si HTS-FT法 96-well plate 細胞を培養用プレートに播種し、培養 24h 100μl/well HVJ-E ベクター 10 μL 試薬D 2 μL 10,000g(10,000~12,000rpm)・4℃で5分間遠心し、上清除去 緩衝液で再懸濁* 200 μL 以下、冷却した各試薬を室温条件下で調製
siRNA溶液(1.15/3, 1.15μM final conc. 50/3, 50nM) 5 μL
再懸濁HVJ-E* 5 μL 20倍希釈した試薬E 5 μL 予め細胞を播種・培養しておいたプレートの各ウェルに添加・混合 15 μL / well 37℃・5%CO2 インキュベーターで培養 No.GS-HTS-005
HeLa
siRNA transfection
GenomONE-SiのHTS-RT法を用いてHeLaにEg5 siRNAを導入したところ、50/3nMで72%、50nMで75%のノッ
クダウン効果が得られた。
HeLaへのEg5 siRNAの導入
Eg5 siRNA(50nM) transfection → 2days → WST-8 (細胞数測定, A450) 【Cell】: HeLa (Human cervical carcinoma cell line, ATCC:CCL-2)
【Culture condition】:2×103cells/well/100μL, DMEM medium with 10% fetal calf serum 【96-well plate】:IWAKI 3860-096 (Tissue culture Treated)
【siRNA】:Silencer KIF11(Eg5) siRNA(Ambion Code No.AM4639) Negative control #1 siRNA(Ambion Code No.AM4639)
Eg5(KIF 11)はキネシン様モータータンパク質として、細胞分裂する際の紡錘体微小管を形成するために必須であり、その機能が阻害されると細胞分 裂の停止とアポトーシスが誘導される。その現象を利用してsiRNAの導入効果をWST-8法(生細胞数測定法)にて定量的に評価。 実験材料・方法 フリーダイヤル 0120-409-816 FAX : 06-6444-7183 E-mail : [email protected] URL:http://www.iskweb.co.jp/hvj-e 〒550-0002 大阪市西区江戸堀1丁目3番15号
石原産業株式会社
75%
GenomONE-Si
GenomONE-Si
HTS-RT法 96-well plate HVJ-E ベクター 30 μL 試薬D 6 μL 10,000g(10,000~12,000rpm)・4℃で5分間遠心し、上清除去 緩衝液で再懸濁* 1200 μL 以下、冷却した各試薬を室温条件下で調製siRNA溶液(0.23, 0.92μM final conc. 10, 40nM) 5 μL
再懸濁HVJ-E* 5 μL
20倍希釈した試薬E 5 μL
細胞懸濁液の添加 100 μL
37℃・5%CO インキュベーターで培養
siRNA Library transfection
n=1
【Cell】: U-937(Human leukemic monocytic lymphoma cell line, ATCC:CRL-1593.2)
【Culture condition】:5×103cells/well/100μL, RPMI1640 medium with 10% fetal calf serum 【96-well plate】:IWAKI 1860-096 (Non-Treated)
【siRNA】:siRNA Library, Cell cycle-regulated genes(Thermo Scientific Dharmacon) Negative control #1 siRNA(Ambion Code No.AM4639)
実験材料・方法
siRNA Library(10, 40nM) transfection → 2days → WST-8 (細胞数測定, A450)
フリーダイヤル 0120-409-816 FAX : 06-6444-7183 E-mail : [email protected] URL:http://www.iskweb.co.jp/hvj-e 〒550-0002 大阪市西区江戸堀1丁目3番15号